Terry ermittelt Undercover, um einen Wissenschaftler, der mit einer fortschrittlichen Art von Genmanipulation, dem Verbinden von Zellen, arbeitet, um Menschen tierische Eigenschaften zu geben. Er will damit eine perfekte Gruppe jugendlicher Handlanger schaffen.

Ein Monster, das fähig ist, die Erde zu manipulieren, erscheint in Gotham, um seine menschliche Tochter von dem Mann zurück zu fordern, der dafür verantwortlich ist, daß es zu einer Lehmkreatur wurde.

Ein paar der Jokerz entführen ein brandneues Versuchsfahrzeug des Militärs. Batman muß verhindern, daß die Jokerz randalieren, und die gestohlene Waffe zurückbekommen, bevor das "Versuchsfahrzeug" sich überhitzt und halb Gotham in die Luft jagt.

Die "virtuelle" Seele eines verstorbenen Medienmoguls übernimmt die Kontrolle über Terrys Batsuit. Als der Gangster plant, seinen virtuellen Verstand in sein eigenes Enkelkind zu transferieren, muß ein machtloser Terry gegen seinen eigenen Anzug kämpfen, um das Kind zu retten.

Stalker, ein kybernetisch aufgerüsteter Großwildjäger, langweilt sich zunehmend bei der Jagd und konzentriert sich auf die einzige Herausforderung, die die Welt noch hat: Batman.

Batman/Terry muß seine Entschlossenheit unter Beweis stellen, als eine alte Freundin, die als Ten der Royal Flush Gang bekannt wurde, wieder zum kriminellen Leben zurückkehrt. Die Situation wird noch komplizierter, als er erfährt, daß sie dazu gezwungen ist, zu stehlen, um ihre Familie aus den Händen von Entführern zu befreien.

Batman muß Max retten, als sie süchtig nach einer virtuellen Realität wird, die von Spellbinder kontrolliert wird.

Batman muß Dana vor einem gefährlichen heimlichvollen Verehrer schützen, einem einsamen jungen Ausgestoßenen, der im Untergrund mit riesigen mutierten Ratten als einzigen Gefährten lebt.

Ein junges Mädchen mit unheimlichen psychischen Fähigkeiten tritt mit Batman mental in Verbindung und fleht ihn an, sie aus den Fängen einer geheimen Organisation namens "The Brain Trust" zu befreien.

Nach einer Serie von unerklärlichen Ereignissen glauben Terrys Klassenkameraden, daß der Geist eines toten Studenten in ihrer High School umgeht. Aber Terry bleibt skeptisch und schließlich kann er beweisen, daß Willie Watt, ein ehemaliger Mitschüler, der psychokinetische Kräfte entwickelt hat, für die unheimlichen Geschehnisse verantwortlich ist.

Shriek kehrt zurück, um Gotham mit einem Gerät ins Chaos zu stürzen, das alle Schallwellen verzerrt und damit Kommunikation unmöglich macht. Im Austausch für Batmans Unversehrtheit verlangt er Lösegeld.

Howard Groote, einer von Terry Freunden, versucht, die In-Clique zu beeindrucken, in dem er sich mit einem wunderschönen Mädchen verabredet, das in Wirklichkeit aber ein sehr hoch entwickelter Roboter ist. Die Dinge laufen aus dem Ruder, als ihre Programmierung verrückt spielt und sie Howards Haus verwüstet, bevor Batman sie endlich ausschalten kann.

Da Commissioner Gordon gesehen zu haben glaubt, daß Batman mit dem verfrühten Ableben von Mad Stan zu tun hat, muß Batman vor dem Gesetz fliehen. Glücklicherweise enthüllt Bruce die Wahrheit und kann Batmans Unschuld beweisen: Der Mord war eine Halluzination, die Spellbinder geschaffen hat.

Bruce ist nicht in Gotham und hat auch keine Möglichkeit, heimzukehren, als Curare wieder in die Stadt kommt. Mit der Hilfe von Max gelingt es Batman, den Killer zu fassen und seine Bombe rechtzeitig zu entschärfen.

Einige von Terrys Mitschülern wechseln in ein neues, innovatives "stark durch Liebe"-Internat. Als Chelsea ebenfalls diese Schule besucht, entdeckt Terry, daß dieser Ort mehr ein mittelalterliches Gefängnis als eine Schule ist.

Als der Vater eines Freundes von Terry seinen lukrativen Entwicklungs- und Forschungsauftrag verliert, bastelt er sich im Hinterhof einen Superpower-Anzug und beginnt ein kriminelles Leben.

Ein Klatschreporter erwirbt die Technologie, "körperlos" zu werden und durch Wände gehen zu können. Dadurch wird er zum ultimativen Spanner und entdeckt Batmans Identität, was er in einer landesweit ausgestrahlten TV-Sendung zu enthüllen droht.

Batman muß eine Diebesbande - Ma Mayhem und ihre Söhne - zur Strecke bringen, während er im Rahmen des Sozialkunde-Unterrichts für ein computergeneriertes Ei sorgen muß.

Batman versucht gemeinsam mit dem Militär, einen Killerroboter wieder zu finden, bis er entdeckt, daß der Roboter geflohen ist, um nicht länger eine Killermaschine für die Regierung zu sein. Daraufhin wechselt er die Seiten und hilft dem Roboter zu fliehen.

Stalker kehrt im Dienst der U.S.-Regierung zurück, und Batman muß, wenn auch widerwillig, mit seinem früheren Feind zusammenarbeiten, um einen verschlagenen Kriminellen namens False Face zu jagen, der für eine Verbrecherorganisation namens KOBRA einen gefährlichen Virus gestohlen hat.

Batman muß mit einer Gang kämpfen, die von einem angesehenen Wissenschaftler bionisch aufgerüstet wurden.

Batman findet sich selbst in einem Kampf mit "Charakteren" wieder, die scheinbar direkt aus einem bekannten Videospiel gekommen sind.

Ein neuer Vigilant, der sich selbst Payback nennt, beginnt sich an den Peinigern in Not geratener Teenager zu rächen.

Batmans tödlicher Feind Shriek lauert ihm im U-Bahn-System auf und lässt ihn in eine Falle laufen.

Ace wird vermißt, nachdem er hinter jemandem aus sein Vergangenheit herjagd. Bruce erzählt, wie er zum ersten mal auf Ace traf, während Terry versucht, einen illegalen Sportclub auffliegen zu lassen.