Un nouveau changement intervient au commissariat, qui pourrait mettre en péril la relation naissante entre Jake et Amy. Parallèlement, Terry assiste Holt dans une affaire délicate impliquant les relations publiques du service. Rosa et Gina tentent de mettre en garde Charles, qui fait l'objet des attentions d'une collègue, le lieutenant Knox...

Jake pense que Charles a peut-être rencontré son âme soeur en la personne de Geneviève, la propriétaire d'une galerie d'art. Il fait tout pour provoquer un rapprochement. De son côté, Rosa s'occupe d'une affaire de vol, tandis que l'ancien capitaine du commissariat, Holt, demande l'aide d'Amy pour une campagne...

Jake, aux prises avec une délicate enquête sur un tueur en série, demande officieusement l'aide de son ancien capitaine, Holt, pour résoudre l'affaire. Au commissariat, Rosa et Amy doivent faire avec les exigences d'un ancien adversaire, tandis que Terry se découvre une nouvelle obsession...

L'affrontement annuel qui a lieu entre Holt et Jake à l'occasion de la soirée d'Halloween reprend : le jeu décisif doit permettre de désigner l'inspecteur le plus génial. Pour s'assurer la victoire, chacun des deux s'adjoint les services d'une partie de l'équipe, divisée en deux...

Jake et Charles persuadent Terry de s'accorder un week-end camping en amoureux avec sa femme, avant l'arrivée du bébé. Mais ils se rendent rapidement compte que le séjour pourrait s'avérer peu idyllique. Holt, de retour au commissariat, donne un conseil avisé à Rosa. Amy demande à Gina de l'aider à préparer une importante présentation...

Jake et Amy parviennent à convaincre le capitaine de les laisser travailler ensemble sur une affaire. Mais leur relation complique rapidement les choses. Dans le même temps, au commissariat, Charles panique lorsqu'il se rend compte qu'il a endommagé l'un des objets que Holt aime le plus...

Terry confie à Jake la lourde tâche de divertir sa femme enceinte. Mais celle-ci perd les eaux plus tôt que prévu, ce qui provoque une panique au sein du commissariat. Dans le même temps, Amy et Charles doivent rédiger toute la paperasse à la main, à cause d'un problème informatique. De son côté, Holt doit faire face à son ancien amant...

Pour résoudre une affaire internationale, Jake et Rosa font équipe avec deux policiers suédois. La compétition s'installe très vite. Amy et Terry, de leur côté, proposent leur aide à Gina, qui doit passer un important test. Holt propose à Charles d'être son partenaire de squash, en prévision d'un tournoi annuel...

Pendant le réveillon de Noël, alors qu'ils sont supposés être de repos, Jake, Charles et Gina sont impliqués dans une situation à la «Die Hard», mais dans la vraie vie. Terry est obligée de laisser ses proches pour venir à la rescousse. Amy, prenant exemple sur Rosa et Holt, tente de prouver qu'elle est elle aussi une dure à cuire...

Charles et Genevieve veulent aller de l'avant. Eleanor, l'ex-femme de Charles, s'interpose. Amy demande un service à Terry. Le résultat est peu concluant.

Lors d'une enquête, Jake et le capitaine Holt ont contracté les oreillons, ils doivent être mis en quarantaine, mais ils décident de continuer leur enquête malgré l'intervention de Amy. Dans le même temps, Terry doit prendre l'intérim du poste de capitaine avec l'aide de Gina, mais doit aussi gérer les dégâts de Hitchcock et Scully. Rosa essaie de remonter le moral de Charles qui est en deuil puisqu'il a perdu un de ses chiens.

Jake et Amy ont planifié une croisière en amoureux pour leurs premières vraies vacances. Un intrus est à bord. Holt se prépare à la visite de sa soeur.

Pour son anniversaire, Jake emmène Amy voir sa mère. Son père fait une apparition. Terry, Rosa et Charles rencontrent des difficultés pendant une surveillance.

L'équipe accueille les détectives du 9-8, le commissariat voisin. Charles se montre jaloux de l'ancien partenaire de Jake. Des problèmes surviennent.

Hitchcock et Scully doivent faire leurs preuves, tandis que Rosa affronte une phobie. Holt et Charles traitent une affaire impliquant une célébrité.

Après 12 ans d'infiltrations, le lieutenant Adrian Pimento revient au 9-9, il est alors confié à Jake mais il va s'apercevoir qu'il souffre de graves problèmes psychologiques. Charles a fait exploser une cocotte minute dans la salle de repos, Amy et Terry lui demandent de convaincre la responsable du service d'entetien à la terrible réputation. Le capitain Holt doit présenter une vidéo pour obtenir une subvention pour du matériel de bureau et demande à Gina de réaliser une vidéo.

Pour partir voir son mari qui est àParis, le capitaine Holt confie les clés de sa maison à Jake et Amy pour qu'ils la gardent ainsi que Cheddar, le chien du capitaine, mais tout va virer à la catastrophe quand Cheddar disparaît.

Pour prouver sa valeur à d'anciens coéquipiers moqueurs, Terry tente de résoudre une vieille affaire, avec l'aide de Jake, impliquant d'inoffensifs chatons. Pendant ce temps, Adrian emménage chez Charles. La répartition des tâches est déséquilibrée entre les deux hommes. Amy s'invite lorsqu'elle entend que le capitaine et Rosa vont participer à un stage d'entraînement intensif et ultra-compétitif...

Rosa demande à Jake de l'aider avec Terry, qui a une mauvaise opinion de sa relation avec Adrian. Selon lui, tout va trop vite entre les deux amoureux. Rosa aimerait le faire changer d'avis. Leur liaison est mise entre parenthèse par la force des choses : Adrian est persuadé qu'une vieille connaissance essaie de le supprimer...

Pour démanteler l'organisation de Jimmy "Le Boucher" Figgis qui a mis la tête d'Adrian à prix, Amy doit se faire passer pour une détenue pour rencontrer la soeur Figgis, mais les sentiments de Jake vont mettre cette opération en pértil. Quant au reste de l'équipe, ils organisent les fausses funérailles d'Adrian pour trouver la taupe du FBI qui travaille pour Figgis.

Le capitaine appelle un de ses amis du FBI pour identifier la taupe qui a manqué de tuer Pimento et de trouver des preuves. Terry et Gina découvrent que des statistiques de la brigade ont fuité en ligne. Amy et Charles trouvent un moyen de faire avancer leur mission d'infiltration.

Jake découvre que la taupe au FBI n'est autre que l'agent Bob Anderson, l'ancien équipier du capitaine Holt, après avoir sauvé le capitaine, la brigade interroge Bob pour savoir où se trouve le dossier sur Figgis pour démanteler son organisation et faire revenir Adrian, Charles et Amy essaient de revenir au plus vite possible par avion de leur mission d'infiltration, mais le voyage dure 3 heures.