Беллами похищают невидимые сущности, а Габриэль, Хоуп и Эко отправляются на её поиски, которые приводят их к готовой закрыться Аномалии. В это время в Святилище нарастает напряжение, когда Дети Габриэля начинают требовать казнить Рассела. Мёрфи пытается справиться с чувством вины, Мэди борется с тревожными воспоминаниями, а Кларк берёт на себя ответственность.

Во флэшбеках становится известно, как Октавия провела десять лет по другую сторону Аномалии. В настоящем Хоуп, Габриэль и Эхо отправляются в новое приключение по местам памяти Хоуп, но героев ожидает непредсказуемый поворот событий. На незнакомой планете отряд обнаруживает новый порядок жизни, тело старого знакомого и правду о происхождении этого мира.

Приближается казнь Шейдхэды, но у злодея есть план, как этого избежать - удастся ли Кларку распознать ложь в его словах? В это время в машинном зале Святилища происходит авария, которая может привести к катастрофе. Способности Мерфи и Эмори позволяют им подобраться поближе к очагу проблемы, но без помощи героям не обойтись.

Из флэшбеков становится известная история знакомства Дэв и Хоуп, объединённых общей целью. В настоящем Габриэль, Эко и Хоуп вынуждены дожидаться Учеников, чтобы продолжить свой путь. Рейвен, страдающая от груза вины за причиненное ею зло, изучает технологии Учеников и обнаруживает кое-что, что поможет героям победить в последней войне.

В прошлом, когда Октавия оказывается на Бардо, ей везёт встретить сострадающего Ученика, который позже влияет на судьбу героини. Хоуп пытается спасти мать, а Беллами оказывается в смертельной опасности. В настоящем Хоуп, Эко и Габриэль узнают все подробности произошедшего тогда, а Индра начинает догадываться о сущности Шейдхэды.

События на Бардо разворачиваются трагическим образом - сможет ли команда Хоуп в очередной раз сбежать из плена? В это время отряд Кларка узнаёт правду о планете Накара и кое-что новое о культе Учеников. На Санктуме назревает катастрофа, когда пропадает оружие Ванкру, а Шейдхэда набирает силу. Удастся ли Мерфи, Эмори и Индре найти достойного противника злодею?

На Санктуме Шейдхэда предлагает Мерфи сыграть в шахматы, обещая поделиться информацией в случае победы героя. Но какие цели преследует злодей на самом деле? Планы Эмори оказываются под угрозой. В это время на Бардо Эко узнаёт больше об учениках, и команде предстоит принять несколько трудных решений.

Во флэшбеках становится известна история Кэдогана, который после Армагеддона обнаружил таинственный артефакт. Два года спустя Бекка прибывает к нему на помощь и показывает вероятное будущее, если герой продолжит использовать камень.Ситуация принимает серьёзный оборот, когда вмешивается ещё один герой.

Три месяца назад на Бардо Эко, Октавия, Дийоза и Хоуп примыкают к Ученикам, но один из них не хочет участвовать в приближающейся войне. В настоящем на Санктуме Никки выдвигает свои требования в обмен на жизни пленных - послушают ли её Мёрфи, Шейдхэда и Рейвен? Пока стороны пытаются договориться, неожиданно приходит помощь.

На Бардо к Эко, Хоуп, Габриэлю и Октавии начинают относиться с подозрением, а К'доган демонстрирует древние манускрипты этой планеты. Джордану удаётся докопаться до истины, но смогут ли герои действовать сообща? В это время на Санктуме Шейдхэда укрепляет свои позиции, а Мёрфи возглавляет сопротивление.

Когда Левитт пытается помочь ученику, раненому во время взрыва, он узнает правду о считавшемся погибшим Беллами. Оказывается, героя забросило в Аномалию, которая привела его и пленного Проводника на планету Этерия. Здесь двух мужчин ждало настоящее испытание, полное смертельных опасностей, которые можно преодолеть только вдвоем.

На Бардо Беллами предлагает Кэдогану свой план по началу последней войны, в то время как Кларк требует освобождения друзей. Как поступит Кэдоган в этой ситуации? В это время на Санктуме Шейдхэда устраивает резню и начинает погоню за выжившими героями. Смогут ли Мерфи и Эмори противостоять злодею?

Ученики уничтожают охрану Шейдхеды и серьёзно ранят Тёмного Командующего, после чего Индра оказывается перед сложным выбором. Начинается красное солнечное затмение, которое может сильно повлиять на ход событий на Санктуме. Никки решает отомстить Рейвен, а Кларк пытается сбежать через Аномалию.

Команде Кларк удаётся перенестись в бункер Второго пришествия, и для героев открывается шанс начать новую жизнь, заново построив цивилизацию на выздоравливающей Земле. Но готовы ли друзья снова жить и работать вместе? Ситуация усложняется тем, что на Сактуме о беглецах пока не забыли...

Кларк пытается разобраться с последствиями произошедшего, а Кэдоган копается в сознании Мади в надежде найти таинственный код. Эмори оказывается смертельно ранена, что вынуждает Рейвен, Мёрфи и Джексона действовать решительно. В это время на Бардо начинается цепочка трагических событий.