Na een cryo-slaap van een eeuw beginnen de overlevenden de wonderen en de raadselachtige gevaren van hun mysterieuze nieuwe thuis te verkennen: de planeet Alpha.

Het plan van Clarke en Bellamy om de verduistering te overleven mislukt al snel. Raven heeft hulp van Diyoza nodig om een aanval aan boord van de Eligius IV te stoppen.

Clarke probeert diplomatiek om te gaan met de behoedzame leider van Sanctum. Buiten de barrière vormt een mysterieuze groep overvallers een bedreiging voor het schip.

De mysterieuze vernieuwingsviering in Sanctum lijkt een nieuwe start voor Clarke en de anderen, maar er wacht een nare verrassing. Octavia plant een gewaagde ontsnapping.

Jordan houdt vast aan zijn vermoedens. Josephine wil de zorgwekkende plannen van de Primes doordrukken. Tijdens hun vlucht stuiten Diyoza en Octavia op een nieuw gevaar.

Murphy en Abby overwegen verleidelijke aanbiedingen van Josephine. Diyoza en Octavia vinden een cryptische aanwijzing en Madi's visioenen nemen een duistere wending.

Clarke moet afrekenen met haar herinneringen en vecht tegen de overheersing door Josephine in de dromerige arena van haar geest.

Diyoza en Octavia volgen Xavier tot in het duistere geheim van Gabriel. Raven spreekt Abby aan op haar plan om Kane te redden. Murphy's deal eindigt in een krachtmeting.

Bellamy probeert onderhandelingen met Gabriel aan te knopen. Kane neemt een grimmige beslissing. Octavia wordt geconfronteerd met haar eigen slechte geweten.

Er broeit een revolutie tegen de Primes die Kane willen wreken. Als het lichaam dat ze delen, bijna doodgaat, vechten Clarke en Josephine voor hun leven.

Clarke en Gabriel bedenken een riskant plan om paniek te zaaien in Sanctum. Echo vertelt Ryker over haar verleden. Octavia probeert het goed te maken met Bellamy.

Terwijl er buiten Sanctum een aanvalsmacht bijeenkomt om meer naamdagmoorden te voorkomen, doet Clarke zich voor als Josephine om zo het schild omlaag te krijgen.

Gabriel en de rest vechten tegen de overgebleven ware gelovigen in Sanctum. Clarke probeert te voorkomen dat de Primes met het ruimteschip Eligius IV ontsnappen.