Amikor Stephen Jameson elkezd hangokat hallani és furcsa helyeken ébredni azt hiszi, hogy megőrült. Azonban hamarosan kiderül, hogy egy genetikailag fejlett, emberfeletti képeségekkel rendelkező faj tagja. Megismerkedik fajtársaival a Holnap Embereivel, akik a túlélésért folytatják harcukat, egy katonai szervezet az úgynevezett Ultra ellen, akik igyekeznek őket elpusztítani. Stephen újabb felfedezéseket tesz és elhatározza, hogy kideríti édesapja rejtélyes eltűnésének okát. Ráadásul kiderül, hogy az Ultra könyörtelen vezéréhez Dr. Jedikiah Price-hoz rokoni szálak fűzik.

Stephen vonakodva elmegy egy partira Astriddal, megdöbben amikor meghallja, hogy egyik osztálytársa veszélyben van. Ismét megkéri Johnt és Carat, hogy segítsenek megmenteni a lányt, de ők, nem hajlandók embereken segíteni. Stephen megpróbálja titokban rávenni Carat, akinek érzései traumatikus múltjából újra előtörtek, hogy segítsen a lány megmentésében. Mindeközben Stephen az Ultrának dolgozik, John pedig ad neki egy küldetést, hogy törje fel az Ultra számítógép rendszerét, hogy még több Holnap Emberét találhassanak meg az Ulta előtt.

Amikor az Ultra legkörözöttebb embere, Killian McCrane, több évnyi bújkálás után újra felbukkan, Stephen segítséget kér John-tól, hogy együtt elkaphassák. John vonakodva beleegyezik, hogy segít, de meggondolja magát amikor kiderül, hogy Killian nem Jedikiah-ra vadászik, ahogy mindenki gyanította. Stephen segíteni akar, de Cara elmagyarázza, hogy John múltja Killian-nel, ami sok mindent felidéz John múltjából, arra késztette, amit soha nem gondolt volna, hogy valaha újra megtesz. Eközben Stephen édesanyja gyanakszik fia hollétéről, amivel őt egyre kínosabb helyzetbe hozza.

Miután Stephen megszegi az Ultra egyik protokollját egy gyakorlati képzésen, Jedikiah titokzatos főnöke ragaszkodik ahhoz, hogy találkozzon Stephennel. Miután kiderül, hogy Jedikiah nem tud neki segíteni, Stephen John-hoz fordul, aki csak önző érdekeit képviseli. Eközben néhány Holnap Embere kétségbesetten részt akar venni a külvilágban egy partin, de John és Cara nem értenek egyet ezzel a veszélyes tervvel. Ez alatt Stephen megint átveri Astridot, aki eldönti, hogy utána jár végre a dolgoknak.

Amikor Stephen és Russel este szórakozni indulnak, összefutnak egy potenciális újonnan kitörő holnap emberével. Stephen és Russel jelentést adnak John-nak és Cara-nak az új személyről, de ők az Ultrától akarják megtudni a profilját. Sajnos, Russel megtudja, hogy édesapja meghalt és nem tudja, hogy haza menjen-e vagy sem. John önként segít a bajban Russel-nek. Eközben Jedikiah olyan sokkoló titkot őriz, amely egész karrierjét tönkre teheti.

Amikor Stephen úgy dönt, hogy szórakozni fog újdonsült erőivel, Jedikiah súlyos intézkedéseket hoz, hogy megbizonyosodjon arról, hogy ez többet nem fordul majd elő. Miután John és Russel visszatérnek útjukról, John úgy érzi, hogy furcsa feszültség van közte és Cara között. Stephen megpróbálja kezelni új és veszélyes kitörését, azonban minden a feje tetejére áll és segítségre van szüksége. Eközben Stephen új információkat tud meg apjáról és még elszántabban próbálja kideríteni, hogy mi történt vele.

Stephen elhatározza, hogy kideríti azt, amiről reméli, hogy édesapja megtalálásához közelebb viszi, így kidolgoz egy tervet a Holnap Embereivel, amely magába foglalja azt, hogy bejussanak Jedikiah fejébe. Mindeközben Cara és Russel találkozik egy hivatlan vendéggel a metróalagútban. Stephen kockáztat és szaglászni kezd az Ultra körül.

Amikor John veszélyes helyzetben találja magát, Stephen nem tud segíteni neki anélkül, hogy felfedné magát az Ultra előtt. Nem elégedett meg azzal a válasszal, amelyet apja eltűnéséről megtudott, így drasztikus lépést tesz a Holnap Emberei segítségével, hogy megtudja az igazságot. Mindeközben Cara és Russel egy cseréről tárgyalnak Jedikiah-val, amellyel végső soron Jedikiah nagy kockázatot vállal.

Miután Stephen visszatér a pokol tornácáról, azt gondolja, hogy meg van a kulcs ahhoz, ami apjával történt, de társai a Holnap Emberei nem biztos, hogy hisznek neki. Amikor a Holnap Emberi megtudnak néhány kiábrándító hírt, s csalódnak Johnban, egy váratlan döntést hoznak a jövőjükről. A Holnap Emberei végül előnyt szereznek az Ultra titkos labor kutatásaival szemben, és egy veszélyes tervet eszelnek ki, hogy kiszabadítsák azokat, akiket fogva tartanak. Időközben Stephen anyukája bemutatja Stephent és testvérét Lucát, egy új férfinek akivel randizik.

Stephen és az Ultrás társai kapnak egy tesztet Jedikiah-tól, hogy kiderüljön ki méltó arra, hogy az Ultra ügynöke legyen, de nem mindenki lesz boldog, hogy csapatként kell együtt dolgozni. Cara szembenéz egy rejtélyes látogatóval a múltjából. Russelt elküldik egy veszélyes felderítő küldetésre, ami lehet összeütközést kényszerít ki a Holnap Emberei között. Eközben John egy új kitöréssel foglalkozik.

Stephen kényelmetlenül érzi magát társgyakornokától Hillary-től, akinek van egy saját titkos napirendje. Stephen édesanyja azt szeretné, ha az egész család elmenne kempingezni, beleértve új barátját Peter-t is, akinek úgy tűnik, hogy Stephen nehezen olvas a gondolatai között. Tudva, hogy ő nem lesz a városban, Stephen megkéri Cara-t és John-t, hogy segítségükkel megbizonyosodjon arról, hogy minden rendben lesz Astrid-dal, amíg ő távol lesz.

Stephen dühös lesz Jedikiah-ra mert megszegi a szavát, majd Stephen távozik és szembenéz az Alapítóval. Azért hogy megvédje Astridot, Stephen-nek kötnie kell egy veszélyes alkut, hogy létrehozzon egy erőteljes kitörést. John és Cara összecsapnak, majd kényszerítik Cara-t, hogy kibocsásson egy durva és váratlan büntetést. Mindeközben Stephen, megtud egy meglepő titkot édesanyjáról.

Néhány sokkoló hír után Stephen, megpróbálja helyreállítani a rendet mind két világában, azáltal, hogy alkut köt Jedikiah-val. Egy új kitörést próbál elcsábítani Cara és Russel, de az Ultra csapdát állít nekik. Mindeközben Jedikiah egyre közelebb áll ahhoz, hogy kifejlesszen egy új titkos technológiát, amely megváltoztatná a jövőjét.

Julian visszatér és dühösebb, mint valaha, de amikor elkapja az Ultra, egy olyan alkura kényszerítik rá, amely nem csak az ő, hanem Stephen életébe is kerülhet. John újra engedelmeskedik Cara parancsainak, amikor megtudja, hogy Julian felfedezte a Holnap Embereinek búvóhelyét. Mindeközben Astridot rémálmok sújtják halálközeli élménye miatt, és új barátjához John-hoz fordul egy kis segítségért.

Stephen még mindig igyekszik lépést tartani Ultrás munkatársával Hillary-vel, aki továbbra is gyanakvó Stephennel kapcsolatban. Amikor a Holnap Emberei és az Ultra megtudják, hogy egy új kitörés segít az embereknek, mindketten az oldalukra akarják állítani. Mindeközben Morgan kockázatot vállalva elárulja Jedikiah bizalmát, hogy segítsen a Holnap Embereinek, de amit Jedikiah megtud Morgan-ről az egy még nagyobb meglepetés.

Stephen, rábukkan egy olyan nyomra, amit a Holnap Emberei már rég óta kétségbeesetten keresnek. John és Russel tudomást szereznek egy olyan veszélyes tervről, amelyet Jedikiah tervez, de senki sem tudja megjósolni a végső eredményét. Mindeközben Cara felfedez egy új kitörést, de megdöbben, amikor rájön, hogy ez a személy egy ismerőse a múltjából.

Elege van Jedikiah állandó hazugságaiból apjáról, Stephen a szövetségeiről csinál egy választást. Megbízva az Ultrában és Hillary-ben, Stephen hozni akar egy új kitörést az Ultrának, hogy lássa a dolgok valóban változtak-e, ezen Cara megrémül. Mindeközben Stephen öccse eltűnik, miután Jedikiah kényszeríti Stephent, hogy megvédje őt.

Stephen keményen dolgozik kettős ügynökként, s úgy tűnik, hogy egy lehetséges fegyversszünet alakul ki a Holnap Emberei és az Ultra között. Mégis bizalmatlan dolog, Cara elküldi Russelt, hogy találkozzon az Alapítóval. Jedikiah kétségbeesetten próbál menekülni, hogy megakadályozza, hogy az Ultra felfedezze titkát. Mindeközben Stephen, Hillary segítségével megpróbál újra kapcsolatba lépni édesapjával.

Roger esetleges visszatérése a láthatáron, mindenki aggódik a következmények miatt, hogy az Alapító megtudja. Stephen most már tudja az igazságot a gépről, hogy az Alapító mire használta Őt, szüksége van Cara és John segítségére, hogy megsemmisítsék a gépezetet. Mindeközben Russel és a Holnap Emberei feladják a reményt, hogy valaha is megtalálják a Menedéket, úgy döntenek, hogy a saját fejük után mennek.

Amikor a Holnap Emberei megtudják az igazságot arról a szérumról amellyel befecskendezték őket, Stephen és Cara próbálnak időt nyerni Jedikiahnak, hogy létrehozzon egy lehetséges ellenszert. Russel és a Holnap Emberei egyre türelmetlenebbek, s egy hirtelen elhatározást hoznak, hogy feláldozzák Rogert az Ultrának, saját biztonságuk érdekében. Mindeközben John, nehezen tud rájönni arra, hogy mi az új szerepe, és az egyetlen ember akihez tanácsért tud fordulni az Astrid.

Russel rájön, hogy szövetsége az Alapítóval hiba volt, a rossz döntését úgy próbálja helyre hozni, hogy Carát megmenti egy Ultrás csapdától. Stephen megérti, hogy Ő az egyetlen, aki képes megállítani a gépezetet és az emberiség kiírtását, de fél, hogy ehhez már túl késő. Russel felajánl egy tervet, hogy segítsen Stephennek, de neki minden segítségre szüksége lesz, köztük Johnra és Astridra, ha bármi esélyük van az életben maradásra. Mindeközben Jedikiah egy érdekes lehetőséget ajánl fel Johnak, ami által ők újra együtt működhetnének.