Depuis son évasion spectaculaire, Flint écume les mers sur son navire. Profondément marqué par la mort de la femme qu'il aimait, il noie son chagrin dans le meurtre. Il multiplie les attaques dans les ports et devance son équipage, au plus près du danger. Silver tente de le raisonner, sans succès. De son côté, Eleanor, prisonnière, accepte de collaborer avec un envoyé du pouvoir. Elle l'accompagne vers Nassau. Sur l'île, Anne Bony s'inquiète car les travaux de restauration du fort n'avancent pas. Elle place Jack Rackham face à ses responsabilités. Elle ne sait pas que le pirate a un plan : il a envoyé Charles Vane capturer la précieuse cargaison d'un navire...

Une flotte royale fait route vers Nassau, avec à son bord Eleanor. La jeune femme tente de faire comprendre à Rogers qu'elle est indispensable à la réussite de son opération. De son côté, le capitaine Flint affronte une terrible tempête pour échapper au capitaine Hornigold. Il souffre d'hallucinations, qui lui montrent Miranda sous la forme d'un spectre. John Silver, qui souffre depuis son amputation, aide comme il le peut les pirates à colmater les brèches dans la coque du navire. A Nassau, l'ancien capitaine de Charles Vane refait surface et renverse les alliances...

Flint et son équipage sont toujours à flot après la terrible tempête qu'ils ont dû traverser. Ils sont maintenant dans une zone sans vent et dérivent à petite vitesse. La nourriture, et surtout l'eau potable, commencent à manquer. Un rationnement strict est mis en place. Silver tente de faire comprendre à Flint qu'ils feraient mieux d'enterrer la hache de guerre pour le bien de tous. À Nassau, Max et Anne prennent une décision importante qui concerne l'avenir de leur relation. Quand elles apprennent qu'une flotte s'apprête à envahir l'île, elles en avertissent Rackham et Teach. Porteur d'un message du nouveau gouverneur, le capitaine Hornigold pourrait bien renverser les alliances à Nassau…

Le capitaine Flint et ses hommes ont pu rejoindre une île. Sur place, ils trouvent de l'eau douce en abondance, mais comprennent vite qu'ils ne sont pas seuls. Des esclaves en fuite vivent là en communauté. Ils n'ont aucune envie que leur lieu de vie soit découvert. Les pirates sont faits prisonniers et interrogés. Silver tente de semer la zizanie chez ses geôliers. A Nassau, la récompense pour la capture de Charles Vane en intéresse plus d'un. Rackham tente l'impossible pour lui permettre de fuir. S'il rejoint l'équipage de Teach, il a une chance d'éviter la pendaison...

Toujours prisonniers des esclaves en fuite, sur l'île qui leur sert de refuge, les hommes de Flint tentent de négocier leur libération. Flint en personne mène les débats. Lorsque monsieur Scott arrive blessé, les équilibres sont rompus. A Nassau, le nouveau gouverneur britannique prend ses quartiers. Eleanor essaie d'influencer Max pour qu'elle se soumette à l'autorité anglaise, mais la jeune femme a plus d'ambition pour son avenir. De son côté, Jack Rackham envisage de signer la grâce offerte par Sa Majesté aux pirates, afin de profiter tranquillement de son butin. Anne Bonny veut l'en dissuader. En mer, Charles Vane et Barbe Noire attaquent un vaisseau espagnol...

John Silver souffre terriblement de sa jambe amputée qui ne veut pas cicatriser, mais refuse de se montrer affaibli devant l'équipage. Il reçoit toutefois une aide et des soins appropriés. De son côté, Flint rejoint Barbe Noire sur son île. Deux capitaines pour une seule flotte : un chef est de trop. Un combat singulier doit départager les deux aventuriers. Charles Vane hésite : il est lié par sa promesse à Flint, mais doit aussi rester fidèle à Barbe Noire. A Nassau, Jack Rackham est arrêté par le gouverneur, qui veut récupérer son butin. Jack accepte d'envoyer un message à Anne, lui demandant de revenir en ville. Anne se méfie...

Anne Bonny, qui a compris le message codé de Jack, est en fuite, recherchée par les hommes du gouverneur. Sam essaie de la convaincre de collaborer avec les Britanniques pour que Jack évite la torture. Flint, lui aussi, veut libérer Jack et récupérer le trésor. La cheffe des esclaves décide d'aider Flint en le mettant sur la piste d'une cache d'armes. Sa fille accompagnera l'expédition pour servir d'intermédiaire. De son côté, madame Hudson continue de fournir des renseignements aux services secrets espagnols. Son contact lui conseille de demander au gouverneur de livrer, non seulement le trésor, mais aussi Jack Rackham à la couronne espagnole...

Pendant que les hommes de Flint tentent d'élaborer un plan pour faire évader Charles Vane, le gouverneur Rogers, malade, se repose sur Eleanor Guthrie. Pour faire face au risque de révolte à Nassau, le procès de Vane et son exécution sont décidés pour le lendemain. Pendant ce temps, Flint rejoint son île avec Jack Rackham et Anne Bonny. Ils mettent leur trésor en lieu sûr et positionnent le Walrus afin que le navire barre la route du capitaine Hornigold lancé à leur poursuite. Une grande bataille maritime se prépare...

Une guerre sanglante qui se joue aussi bien sur terre qu’en mer, où Anne et Jack Rackham sont dans une situation périlleuse et ont pu s’en sortir grâce à l’intervention de Barbe-Noire.

Tandis que Flint et ses compagnons font face aux Anglais, à Nassau, les choses ne sont pas moins intéressantes. La mort de Charles Vane a bien semé les graines de la révolution, avec un peuple qui se montre de plus en plus méfiant. Billy Bones en profite pour faire naître la peur au sein des proches du gouverneur. Terreur à qui il finira par donner un nom et un visage, où, pendant son discours, nous assistons à une réunion entre les personnes au sommet de l’alliance pirate : Flint, Barbe-Noire, Rackham, Madi, et celui qui sera destiné à devenir le roi de Nassau et à entrer dans l’histoire : Long John Silver…