Amikor leszáll egy repülőgép New Yorkban, amelynek fedélzetén mindenkit holtan találnak, Dr. Ephraim Goodweathert, a Járványügyi Központ Kanári Projektjének vezetőjét csapatával együtt a helyszínre hívják, hogy segítsenek a nyomozásban. A harlemi zálogkölcsönző, Abraham Setrakian is a reptérre siet, mert meggyőződése, hogy az elsőre rejtélyes járványkitörésnek tűnő jelenség egy végtelenül gonoszabb okra vezethető vissza.

A négy túlélőn különös tünetek mutatkoznak, ám Eph és Nora hiába próbálja őket karanténban tartani, mert megkezdődik a félretájékoztatási kampány. Mindeközben a börtönben Setrakiant váratlanul meglátogatja egy régi – de még milyen régi – ismerős.

Eph és Nora Redfern kapitány életéért küzd, majd szembe kerülnek a vírus szörnyű hatásaival. Az egyre gyakoribb patkánytámadások azt jelzik Fetnek, hogy valami érthetetlen dolog történik mélyen a város alatt. Miután Setrakiant kiengedik a börtönből, az örmény munkához lát, hogy megvalósítsa saját könyörtelen tervét a járvány megfékezésére.

Egy titokban elvégzett boncolás feltárja a vírus bizarr természetét, amely megdöbbentő vallomásra készteti Jimet. Eph és Nora versenyt fut az idővel, hogy megtalálják a repülőgép-szerencsétlenség legfiatalabb áldozatának édesapját, de valaki megelőzi őket. A betegséggel küszködő Ansel kétségbeesett lépésre szánja el magát, hogy megvédje családját.

Nora távozása után Eph vonakodva csatlakozik Setrakian küldetéséhez, mert abban reménykedik, hogy elegendő bizonyítékot talál egy egész városra kiterjedő karantén elrendeléséhez. Fet megdöbbentő felfedezést tesz a földalatti alagutakban, egy egészségügyi vészhelyzet pedig veszélybe sodorja Palmer tervét.

Ephet letartóztatja az FBI miután figyelmezteti Kellyt, hogy Zach-kel hagyják el a várost még mielőtt a járvány terjedése felgyorsul. Eichhorst egy utolsó feladattal bízza meg Gust, miközben Setrakian ráébred, hogy a közeledő napfogyatkozás fordulópont lesz a fertőzés szempontjából, amely a vég kezdetét jelzi majd.

Setrakian, Eph és Nora előáll egy tervvel a Mester megtalálására, amelyben Jimnek jut a csali szerepe. Megismerjük Eichhorst és Setrakian közös múltját. A Luss rezidencián Neeva mindent megtesz, hogy megvédje a gyerekeket, miközben egy rejtélyes idegennel találkozik, akitől nem kívánt segítséget kap.

Miután rájönnek, hogy az ultraibolya-sugárzás hatékony fegyver a striogik ellen, Setrakian egy új és szokatlan tanítványra talál. A gyors vásárlásból egy brooklyni vegyeskereskedésben egész éjszakás, halálos ostrom kerekedik.

Eph versenyt fut az idővel, hogy megmentse családját, ám Kelly eltűnik. Dutch elárulja szerepét Palmer tervében, Gusnak pedig nehéz döntést kell hoznia Felixszel kapcsolatban.

Eph Kelly eltűnése után nyomoz, de nem könnyű elfogadnia azt, amit talál. Dutch kidolgoz egy tervet, hogy bosszút álljon Palmeren, Fitzwilliam pedig meglepő döntést hoz.

Setrakian vezeti Ephet, Fetet és Norát, miközben a Mester búvóhelyét keresik. Zach a zálogházban marad Marielával, és kockára teszi saját biztonságát, hogy megmentse az idős nőt.

Dutch visszatér, és az a terve, hogy közzéteszi Eph figyelmeztetését a vámpírjárványról. Ám új veszéllyel kell szembenézniük, amikor Eicchorst támadást indít a zálogház ellen. Palmerhez különös látogató érkezik, Gus pedig felkészül a közelgő harcra, ám rájön, hogy egy titokzatos csoportot kihagyott a számításaiból.

Eph és Fet totális támadásra készül, mert Setrakian szerint így biztosan végezhetnek a Mesterrel. Gus egy különös erővel szövetkezik, amely megjósolhatatlan irányba mozdíthatja a küzdelmet.