Junjie, le lanceur des cavernes de l’Est fait maintenant partie de la bande d’Éli. Les slugs commencent à se transformer en goules. Éli, guidé par le chef du Clan des Ombres découvre un hologramme de son père. Celui-ci lui explique que les Slugs Élémentaires représentant le feu, l’eau, la terre, l’air et l’énergie et dont dépend l’équilibre de Slugterra, sont en passe d’être perverties par le sorcier Goune qui s’est emparé de l’esprit d’un nouveau lanceur. La mission d’Éli et sa bande est de réunir les cinq Slugs Élémentaires pour sauver Slugterra.

Junjie emmène Eli pour lui enseigner le Slug Fu, une technique de contrôle des slugs par la pensée mais Eli n’arrive pas à maîtriser cette discipline. Pendant ce temps les autres membres de la bande doivent veiller sur les slugs élémentaires et régler un problème du côté des cavernes lointaines mais les élémentaires s’échappent et finissent par tomber entre les pattes d’une monstrueuse araignée qui compte s’en servir pour décimer les êtres humains et instaurer un royaume arachnoïde sur Slugterra.