Red betrekt Liz bij zijn plan om tegelijkertijd geld te verdienen en een nieuw persoon van zijn zwarte lijst aan het team over te dragen. Liz wordt met de realiteit geconfronteerd: zij aan zij met haar vader werken. Ressler zit in een penibele situatie terwijl Tom zijn opties afweegt.

Liz en het team trekken met Red naar het buitenland op zoek naar een miljardair die bijklust als dief. Dembe trekt op zijn eentje iets na en Tom schakelt hulp in van buitenaf om de overblijfselen uit de koffer te identificeren.

Ressler is afgeleid daar hij zich moet bezighouden met druk van buitenaf. Red en Tom voeren een plan uit om de criminele reputatie van Red in stand te houden.

Liz en het team zitten een ongrijpbare crimineel achterna die alles uit de kast haalt om wereldwijd de meest waardevolle schatten te vernietigen. Een onverwachte ontmoeting zorgt voor een mogelijk nieuwe zakendeal voor Red. Tom komt in actie en gaat op onderzoek uit omtrent de botten uit de koffer.

De informatie van Red zorgt ervoor dat het team zich moet reppen om de CIA voor te zijn. Red en Hawkins leggen het fundament voor hun nieuwe zakelijke onderneming. Tom gaat undercover om informatie in te winnen.

Ressler leidt de Task Force op hun missie om het groeiende aantal moorden een halte toe te roepen. Tom negeert een waarschuwing en zet zijn onderzoek rond de koffer verder.

Tom raakt vermist, een wanhopige Liz poogt hem terug te vinden. Reds zoektocht naar de koffer brengt hem bij Tom die tevens achter het voorwerp aanzit. Hun levens zullen hierdoor voorgoed veranderen.

Liz geeft haar oude leven op en wil elders een nieuwe start maken waar niemand haar kent. Wanneer haar leven bedreigd wordt, moet ze noodgedwongen kracht putten uit haar verdriet om ten strijde te gaan en te overleven.

Red roept het team op om op zoek te gaan naar een nieuwe naam van op zijn Blacklist. Deze gebruikt zijn machtspositie om gevoelige informatie te verkopen. Ressler neemt het risico zichzelf bloot te stellen. Liz beraamt een plan.

Red gaat op jacht naar een legendarische schat, maar trekt hierbij de aandacht van de manipulator Abraham Stern. De sluwe man wijdt zijn leven aan het vinden van de schat en kijkt niet meer op een dode meer of minder. Liz doet onderzoek naar de methodes van een zeer gevaarlijke crimineel die op de zwarte lijst staat.

Liz en Red zitten samen achter de moordenaars van Tom. Tijdens hun onderzoekt stelt zij zijn beweegredenen in vraag. Intussen schakelt het team de hulp in van een brandstichter in de hoop een dergelijke dader te pakken te kunnen krijgen.

Wanneer er lijken worden gevonden in afgelegen bossen, brengt Red het team op het pad van 'De Onzichtbare Hand', een groep die zijn slachtoffers kiest op basis van hun verwerpelijke, doch legale, acties. Red helpt één van zijn werknemers, terwijl Liz een belangrijke aanwijzing vindt in het onderzoek van Tom.

Red helpt het team bij het opsporen van een mysterieuze Blacklister die waterdichte alibi's verschaft aan moorddadige klanten. Liz wil zich terug bij het team integreren, maar moet hiervoor eerst langs bij een therapeut voor een evaluatie.

Liz zet haar onderzoek naar Toms moordenaars voort, terwijl Red dan weer op zoek is naar een oplossing voor het witwassen van zijn geld. Aram doet veldwerk in een FBI-zaak waarin een mysterieuze vrouw verantwoordlijk is voor een dodelijke virusuitbraak.

Wanneer er nieuwe aanwijzingen opduiken in een oude zaak bijt Liz zich er terug in vast. Haar achtergrond als profiler komt hierbij goed van pas. Daarnaast bezoekt ze nog regelmatig de therapeut, Dr. Fulton. Het team maakt zich op voor de confrontatie met de moordenaars van Tom, wat bovendien volgens het boekje moet gaan. Red zit Ian Garvey steeds meer op de hielen en kiest voor een andere aanpak.

Wanneer een partner van het Nash Syndicaat vermoord wordt teruggevonden, zet Reddington Liz en het team op de zaak. Hierdoor kan hij belangrijk bewijsmateriaal verzamelen om Ian Garvey ten val te brengen. Ondertussen denkt Aram eraan zijn relatie met Samar tot een hoger niveau te brengen.

Red poogt met het team Ian Garvey onder druk te zetten en reist hiervoor af naar Parijs om een vooraanstaande heroïnedealer, die drugs levert aan het Nash Syndicate op te sporen. Liz wantrouwt Red en kiest haar eigen weg en methode om achter Garvey aan te gaan.

Liz heeft informatie uit onverwachte hoek gekregen en gebruikt deze om geheimen die Red verbergt, te achterhalen. Red zet een plan in gang om de plunjezak met de botten terug in handen te krijgen.

Een niet-geïdentificeerd meisje wordt gevonden en het team poogt een verband te vinden tussen haar en het geheim dat Red niet wil onthullen. Wanneer de familie van het meisje zelf ook geheimen verbergt, is het een kwestie van er snel bij zijn om het leven van hun dochter te redden.

Aram en het team komen in actie om Samar terug te vinden voor het te laat is. Red reist naar Costa Rica om te vermijden dat de botten verkocht worden tijdens een veiling.

Liz en Red zoeken naar een persoon van op de Blacklist die in het bezit is van de plunjezak met de botten. De waarheid achter de botten wordt eindelijk onthuld.