Nakon što je desetljećima bio na popisu najtraženijih zločinaca, Raymond "Red" Reddington (James Spader), predaje se pomoćnom direktoru FBI-eva odjela za suzbijanje terorizma Haroldu Cooperu i nudi mu Ranka Zamanija, srpskog terorista za kojeg se vjerovalo da je već godinama mrtav. Kad Red odbije daljnju suradnju dok ne dobije priliku razgovarati s Elizabeth Keene, novom agenticom koja se bavi kriminalističkim profiliranjem, agent Donald Ressler presretne Liz na putu za posao i odvede je u centar za tajne operacije gdje drže Reda. Nakon što ju je iznenadio time koliko zna o njoj, Red otkriva da Zamani namjerava oteti osmogodišnju Beth, kćer generala Daniela Rykera. Liz naziva supruga Toma i obavještava ga da neće stići na sastanak za finaliziranje postupka posvajanja djeteta. Liz vodi Beth na sigurno, no zaustave ih sumnjivi radovi na cesti za koje se ispostavi da su zapravo pomno osmišljena zamka Zamanijevih ljudi. Za sobom ostavljaju prizor smrti i uništenja te otimaju Beth...

Red FBI-u nudi neuhvatljivog ubojicu čija je iduća meta javnosti poznata aktivistica koji se bori protiv trgovine ljudima. U gostujućim ulogama pojavljuju se Isabella Rossellini i Jane Alexander. Kad mu odvjetnica iz Ministarstva pravosuđa Diane Fowler (Jane Alexander) odbije imunitet, Red ostaje pri tome da je spreman surađivati jedino ako može razgovarati s Liz. Na dojavu o stravičnoj željezničkoj nesreći u industrijskoj zoni u Marylandu, Cooper i Ressler pritisnu Diane Fowler da istraži taj događaj budući da im Red govori kako to nije bio nesretan slučaj, nego namještaljka čiji je cilj bio ubiti povjerenika za urbanizam iz Albanyja, koji je putovao vlakom. Red kaže da je počinitelj serijski ubojica poznat pod imenom "Freelancer" (Daniel Sauli) i vodi Liz u Montreal da ga upozna. Iako je Red inzistirao na tome da idu bez policijske pratnje, operacija se izjalovila kada se Cooper oglušio na to i naredio strogu pratnju. I Redu i Freelanceru je ubrzo postalo jasno da ih netko motri. Međutim, kad je nakon potjere Red došao na vrata FBI-eva kombija za praćenje, otkrio je da je Freelancerova iduća žrtva Floriana Campo (Isabella Rossellini), aktivistica koja se bori protiv trgovine ljudima.

Red vodi Liz na tajni zadatak s ciljem da uhvate kineskog špijuna čija su glavna meta CIA-ini agenti. Nakon što je sredio ubojstvo CIA-ina agenta u Šangaju, kineski špijun Wujing, 84. na Crnoj listi, angažirao je Reda za dekodiranje računalnih datoteka. No Red je odlučio predati ga FBI-u i traži da se Liz predstavi kao njegova stručnjakinja za dekodiranje kako bi mogli otkriti tko je iz redova CIA-e Wujingova iduća meta. Dok se Liz nada da će balistički nalaz s pištolja koji je pronašla u kući baciti svjetlo na prošlost njezina supruga Toma, netko se neprimijećeno ušuljao u njihovu kuću i postavio nadzorne kamere...

Kada svjedok u suđenju nemilosrdnom šefu kartela nestane, Red vodi Liz i Resslera u potragu za 161. zločincem s Crne liste, jezivim plaćenim ubojicom poznatijim kao Stewmaker. U trenucima dok Ministarstvo pravosuđa priprema Luisa Penu za svjedočenje protiv šefa kartela Hectora Lorce, Red obavještava Liz da ga je narkobos zatražio pomoć i da će vladin slučaj propasti. Kao jedini svjedok otmice svoga sina, Luis dolazi na sud svjedočiti protiv Lorce koji je naredio zločin. Lorca se sumnjiči za smrt više od stotinu drugih svjedoka koji su progovorili protiv kartela. Baš kad je Luis trebao prepoznati Lorcu, suđenje se prekida jer je sudac dobio sumnjivi srčani udar. Luisa otimaju Lorcini ljudi prerušeni u specijalce koji su ga trebali zaštiti. Red govori Liz da je Luisov nestanak djelo Stewmakera (Tom Noonan), ubojice koji svoje žrtve doslovno kemijski rastapa kako bi uništio dokaze ubojstva.

Red vodi Liz i Resslera u lov na žrtvu otmice i otmičara, koji se nalazi na 85. mjestu Crne liste. On je tajanstveni kurir iz kriminalnog podzemlja koji ne može osjetiti bol, što ga čini nezaustavljivim. Liz otkriva da skriveni pištolj povezuje Toma s neriješenim ubojstvom ruskog turista, a Red doznaje kako je redni broj 85.,mračni Kurir (Robert Knepper), angažiran da iranskom špijunu Hamidu Soroushu dostavi 20 milijuna dolara vrijednu pošiljku. Nakon što su primili upozorenje da paket može sadržavati bilo što, od genetski modificiranog virusa do glave kakve žrtve ubojstva, agenti FBI-a slili su se na tržnicu, gdje bi se trebala izvršiti primopredaja. Kad je shvatio da posao neće obaviti, Kurir ubija Sorousha, a u pokušaju bijega teško je ranjen. I dok Liz i Meera u šoku promatraju kako usprkos brojnim ozljedama Kurir i dalje teturajući bježi, Ressler doznaje da Kurir ima rijetki genetski poremećaj zbog kojeg ne osjeća bol.

U potrazi za korporativnom teroristicom Ginom Zanetakos, brojem 152 na Crnoj listi, Liz razotkriva plan za detonaciju radioaktivne bombe i pronalazi dokaze koje povezuju Toma s ubojstvom ruskog prebjega. Unatoč dokazima koje je Liz pronašla, Tom poriče da je išta imao sa smrću ruskog agenta Victora Fokina. Kad ga je privela na ispitivanje, Liz je primorana na dopust dok istraga ne završi. Odgovore traži od Reda, a on joj govori da će istinu saznati ako pronađe Ginu Zanetakos (gostujuća uloga Margarite Levieve), korporativnu teroristicu i navodnu Tomovu ljubavnicu. Dok Meera rešeta Toma o tome zašto je bio u Bostonu u vrijeme Fokinove smrti, Cooper vraća Liz na zadatak kako bi pomogla pronaći Ginu.

Red vodi Liz u potragu za poremećenim stručnjakom za kemijsko oružje koji je pustio rijetku, ali smrtonosnu bolest u washingtonsku podzemnu željeznicu. U podzemnoj željeznici u Washingtonu dogodio se smrtonosni napad kemijskim oružjem. Red je zločin pripisao Fredericku Barnesu (Robert Sean Leonard), bivšem znanstveniku iz Ministarstva obrane koji, otkako je prije pet godina napustio posao, prodaje svoje oružje onima koji su za njega spremni najviše platiti. Sad kad to oružje više samo ne prodaje, već i upotrebljava, Barnes je najopasniji čovjek na svijetu, tvrdi Red.

Red želi s Cooperom postići dogovor prije nego što pristane zaustaviti idući smrtonosni napad anonimne antikapitalističke terorističke udruge. Nakon što je bomba srušila teretni avion iznad Washingtona, Red smatra odgovornom antikapitalističku terorističku mrežu General Ludd, koju vodi njezin osnivač, Nathaniel Wolff (Justin Kirk). Kad se FBI bacio na istragu, Meera uočava da su dva osumnjičena, dostavljač Roger Gard i Arthur Denning, upravitelj tvornice umjetnih gnojiva, zapravo ista osoba. Pretragom stana u kojem osumnjičeni živi utvrđeno je da on zapravo pripada Wolffu, a Liz shvaća da im Wolff stalno izmiče jer je operacijom promijenio lice. I dok teroristička skupina sprema još žešći napad, Liz prima vijest da je njezin otac Sam Milhoan hospitaliziran u Nebraski.

Neustrašivi plaćeni ubojica brutalno napada tajni FBI-ev kompleks kako bi izravnao račune s Redom. Red se iznenadi i zabrine kad Ressler dođe po njega u München. Naime, doznaje da je meta svog nekadašnjeg partnera u zločinima, Ansla Garricka (Ritchie Coster). Ressler i Cooper su uvjereni da Garrick ne zna za postojanje tajnih prostorija, ali Redove sumnje da su agenti svojim potezima zapravo išli Garricku na ruku potvrđene su kad on i njegov tim Wild Bunch upadnu na teritorij FBI-a i isključe struju. Liz se upravo vraća na posao nakon bolnog susreta s uspomenama na pokojna oca i zaglavi u dizalu usred napada. Oglušuje se na naredbe da ostane na svom mjestu i pridružuje se borbi.

Nakon Redove otmice, Liz otkriva da u FBI-u postoji krtica zbog koje bi agenti mogli nastradati. Zbog Lizinih pitanja o prošlosti Tom se opet našao u središtu pozornosti. I dok se nastavlja okršaj između Ansla i Reda, Aram i Liz uhvaćeni su nakon što su onesposobili napadačev dekoder za komunikaciju. Kad Garrick zaprijeti da će Liz postati njegova iduća žrtva, Red prije predaje natjera ranjenog Resslera da otvori vrata sigurnosne jezgre. Garrick ostavlja Resslera i započinje sa svojim temeljito isplaniranim bijegom. Njegov je tim izbušio rupu u podu i užetom se svi spuštaju do vozila hitne pomoći koje ih čeka. Iako Liz uspijeva pobjeći, Garrick iz Redova vrata vadi čip za praćenje da FBI više ne može nadzirati svaki njegov korak te ga vodi na sigurno mjesto gdje ga namjerava mučiti...

FBI je svoju potragu za krticom suzio na agente koji rade na Crnoj listi. Liz otkriva neočekivanu vezu između serijskog ubojice i njegovih žrtava. Red ulazi u trag ljudima koji stoje iza napada na njega. Iako Cooper želi ostati usredotočen na potragu za Redom, Liz ga uvjerava da će ga najbrže pronaći ako preuzme slučaj Dobrog Samaritanca, koji je ponovno napao. Dok se Liz muči otkriti što žrtve serijskog ubojice imaju zajedničko, Red joj se javi i savjetuje da obrati pozornost na metode mučenja. Kad dozna da je posljednja žrtva umrla od iste vrste ozljeda kakve je nanijela vlastitu sinu, Liz shvaća da ubojica cilja na ljude koji fizički zlostavljaju članove svoje obitelji. Kako je Karl Hoffman (Frank Whaley), prozvan Dobrim Samaritancem, svoju iduću žrtvu pronašao u skupini za liječenje obiteljskih nasilnika, Liz otkriva da su se sve njegove žrtve liječile u bolnicama u kojima je on radio kao medicinski tehničar.

Liz je u potjeri za poremećenim znanstvenikom koji je pomogao desecima kriminalaca da pobjegnu tako što je proizveo i ubio njihove genetičke dvojnike. Red angažira aktiviste-zviždače da mu pomognu pronaći krticu. Iako su prema službenim izvješćima doušnici srpske mafije Pytor i Catherine Madrczyk poginuli u zrakoplovnoj nesreći, Red sumnja da je zločinac broj 101, genetički znanstvenik Eric Trettel (poznat kao Alkemičar) pomogao Madrczykovima da izbjegnu programu zaštite svjedoka tako što je stvorio gotovo identične dvojnike koji su potom stradali u nesreći. Nakon što Liz, Meera i Ressler pronađu Pytora koji se pritajio u Budimpešti, Trettel pronalazi i ubija njegovu ženu. Hineći da je njegov odvjetnik, Trettel želi preko FBI-a doći do Pytora kako bi i njega mogao ubiti. Kako Tom i Liz nastavljaju s postupkom posvajanja djeteta, napetost među njima raste jer je Tom zamoli da ide na dopust i posveti se bebi.

Liz vodi istragu o jednoj agenciji za posvajanje djece i razotkriva njezinu šokantnu tajnu. Red je za petama krtici i prilično ga je iznenadio novi sumnjivac. Kako Red i Liz privode kraju postupak posvajanja djeteta, Red joj skreće pozornost na agenciju Cyprus, međunarodnu organizaciju za posvajanje koju se sumnjiči da otima djecu za svoje klijente. Uz pomoć budućih roditelja Wendy i Davida Rolanda, Liz je uspjela Cyprusova odvjetnika Teda Caldwella uhvatiti u zamku. No Caldwell je počinio samoubojstvo kako ne bi morao otkriti što zna o posvojenjima. Kad vlasnik agencije Owen Mallory (Campbell Scott) zatekne FBI u pretraživanju njegova ureda, on počinje uporno tvrditi da ne zna ništa o navodnim otmicama i obećava punu suradnju. Nakon što mu je rekla da je nedužna, Meera ponudi Redu svoju pomoć u potrazi za krticom koja ga je pokušala ubiti.

Liz je u potrazi za osvetnikom koji uzima pravdu u svoje ruke i kažnjava krivce za pogrešne presude. U gostujućoj ulozi pojavljuje se Dianne Wiest. Dvanaest godina nakon nestanka pomoćnik ministra pravosuđa Mark Hastings pronađen je ošamućen i zbunjen na pensilvanijskoj autocesti. Dok FBI sumnja da je slučaj povezan s optužnicom koja je tjedan dana prije njegova nestanka podignuta protiv jednog narkobosa, Red se s time ne slaže i tvrdi da je to djelo Suca, osvetnika koji u ime pogrešno osuđenih uzima pravdu u svoje ruke. Kad im Red skrene pozornost na slučaj Leonarda Debsa koji je 12 godina proveo u zatvoru zbog pljačke koju nije počinio, Liz i Ressler moraju ispitati Franka Gordona, bivšeg zatvorenika za kojeg vjeruju da će ih dovesti do Suca.

Ressler je meta krvavog osvetničkog pohoda uslijed kojeg je na površinu isplivalo da je jedan agent FBI-a povezan s carstvom kriminala čije uzde u rukama drži mafijaš iz redova japanske yakuze. Red je sve bliže krtici i Jolene (gostujuća uloga Rachel Brosnahan) pokušava iz Toma izvući što više informacija o Liz. U gostujućoj ulozi pojavljuje se Lance Reddick. Nakon bijega iz japanskog zatvora legendarni šef yakuze Mako Tanida (Hoon Lee) želi se osvetiti agentima FBI-a koji su ga strpali iza rešetaka. Nakon što Tanida prisili agenta Sama Raima da počini ritualno samoubojstvo, ostali agenti koji su sudjelovali u uhićenju, Donald Ressler, Bobby Jonica i Pete Maguire, susreću se na sprovodu, gdje Jonica (James Colby) prstom upire u Reda. Međutim, na tajnom sastanku Red upozori Resslera da je Tanida pobjegao iz zatvora, ali ne na vrijeme da spasi Maguireov život.

Tinejdžer-haker koji se predstavlja kao kibernetički terorist s Crne liste zaprijetio je Washingtonu. Liz istražuje Jolenein nestanak i sve je bliže otkrivanju Tomove tajne. Nakon što su Liz i Ressler u olupini automobila pronašli nacrte centrifuga za nuklearne pogone, mjesto zločina preuzeo je i zaštitio tim agenata Nacionalne sigurnosne agencije koji tvrde da je žrtva radila na tajnom kibernetičkom oružju poznatom kao Skeleton Key. Budući da je prototip oružja ukraden, Red se u pratnji Resslera i Meere uputio u Bjelorusiju. Kad FBI upadne u restoran u kojem su se Red i Ivan sastali, Red se pretvara da ubija Resslera kako Ivan ne bi ništa posumnjao. Red pritisne Ivana da mu kaže što je s prototipom oružja, no Ivan tvrdi da nije on taj koji ga je ukrao, već da je to učinio varalica kojeg je Aram identificirao kao Harrisona Leeja, 17-godišnjeg srednjoškolca i kompjuterskog genija.

Red identificira poremećenog ubojicu koji uvjerava neizlječivo bolesne ljude da ubijaju za njega. Liz zahtijeva od Reda da joj pomogne istražiti Toma. Budući da zna da Tom nije onakav kakvim se predstavlja, Liz odmah postane sumnjičava kad Tom izrazi želju da obnove vjenčane zavjete. Kad zatraži odgovore, Red priznaje da prati Toma još otkako je ušao u njezin život. Nakon što joj je predao sve dokumente koje je za to vrijeme prikupio, upozorio ju je na novu metu s Crne liste, poznatog kao Pogrebnika (Damian Young) koji može potpune strance natjerati da počine ubojstvo prije nego ubiju sami sebe. Istragom dva nedavna ubojstva FBI otkriva da su ubojice bili neizlječivo bolesni, a budući da su svi financijski problemi njihovih obitelji misteriozno riješeni nakon ubojstava, Cooper je posumnjao da je to djelo Pogrebnika.

FBI je na tragu srpskog tima zaduženog za otmicu znanstvenice koja posjeduje dragocjeno znanje o kineskom projektu biološkog oružja. Kad odmetnuta znanstvenica Xiaoping Li (Natalie Kim) ponudi otkriti tajne o kineskom programu biološkog oružja, CIA odluči iskoristiti program cijepljenja Svjetske zdravstvene organizacije da je izvuče iz radnog logora u kojem je zatočena. Čim su braća Pavlovich, četvorica Srba s Crne liste koji se bave iznuđivanjem, čula za njezin bijeg, brzo su se umiješali i pobjegli s njom baš prije nego što su je Liz i Ressler stigli ispitati. Liz se trudi pratiti svaki suprugov korak. Pridružuje se Redu u Nacionalnom arhivu gdje motre Toma koji obustavlja primopredaju paketa. Kad Liz stigne kući na večeru, Tom izvede psa u šetnju te se uputi do telefonske govornice kako bi obavijestio nadređene da je otkriven i da se smjesta treba povući.

Liz mora pronaći "Kingmakera", čovjeka koji stoji iza uspona nekih od najmoćnijih svjetskih političara, i saznaje kakvu je ulogu Red imao u smrti njezina oca. U gostujućim ulogama pojavljuju se Alan Alda i Linus Roache. Kad je istaknuti češki političar uhićen nakon što se probudio u sobi s mrtvim muškim eskortom, Red je odmah posumnjao da je to djelo Malcolma Roycea, poznatijeg kao "Kingmaker" (Linus Roache). Ovaj zločinac s Crne liste već godinama pronalazi mlade nade u politici i čini sve što treba, pa čak i ubija, da se domognu moći. Milijarder Nico Demarkis upozorava Reda da su problemi češkog senatora dio velike urote protiv njihovih zajedničkih poslovnih interesa u Pragu. Red obavještava Liz o Kingmakerovu skoru dolasku u SAD i traži od nje da ga uhiti...

Kad zaprijeti smrtonosan virus, doznaje se za mutne ucjene misteriozne osobe koja manipulira Tomom. Cilj je - ubiti Reda. Kad čuvaru blindiranog vozila Paulu Blankenshipu pozli tijekom ukrcaja u Westland banci, cijela je zgrada stavljena u karantenu. Naime, otkriveno je da je Blankenship bio zaražen smrtonosnim virusom, koji je toliko opasan da su sva istraživanja u samom početku obustavljena kako bi se spriječila pandemija. Iako se isprva pretpostavljalo da šprica pronađena kod Balnkenshipa sadrži virus, Centar za kontrolu i prevenciju bolesti otkriva da se zapravo radi o protuotrovu koji je Blankenshipu ponuđen u zamjenu za Redov život. Nakon što je FBI-u rekla sve što zna o Tomu, Liz daje otkaz i odbija daljnju suradnju s Redom usprkos njegovoj molbi da mu pomogne riješiti hitan slučaj.

Dokazi iz olupine otetog aviona za prijevoz zatvorenika nagnali su FBI da svim raspoloživim snagama krene u potjeru za "Berlinom" s Crne liste. Liz želi od Reda čuti istinu o svom pokojnom ocu. Red je uhićen nakon što je avion za prijevoz zatvorenika srušen iznad Manhattana. Nakon razgovora s preživjelima, FBI usmjerava svoju potragu na čuvara čiju je ruku odsjekao kažnjenik koji je htio pobjeći. Iako agent Walter Martin ne vjeruje ni Redu ni Liz, misteriozni obavještajac g. Fitch (Alan Alda) uvjerava ga da pusti Reda jer bi ih mogao odvesti do ljudi koji stoje iza otmice aviona. Kad Tom oda imena FBI-evaca, počevši od Meere, čovjek za kojeg vjeruje da je Berlin počinje ubijati sve na popisu...