小班因為小玟和凱文離開必須與他們分別。馬克把戮克送去當小班的新搭擋，但是小班只想靠自己。小班和戮克追蹤敵人到地底下，看到一座城市。駭霸出現在地洞旁，放出他的寵物到地底。

小班和戮克為追查勒索案追蹤敵人到地底城市。找到敵人基地，發現幕後主謀是賽瘋。經過幾番戰鬥擊敗並逮捕賽瘋，小班也接受戮克成為新搭檔。

小班和戮克要一起巡邏，戮克表示想要確認小班傳說內容的真實性。兩人在街上巡邏時發現可疑使用外星科技者而前往調查，從對方車上發現那個光。在追蹤那個光以後到達一座建築，囚禁大量的那個光用來發電。兩人合作打敗拳鬼救出那個光以後，小班和戮克繼續談論傳說。

駭霸偷偷闖入天工會，並在主控電腦中看到了過去的資料。馬克、小班和小玟去找阿茲米斯，馬克要阿茲米斯修好Omnitrix。因為小班的Omnitrix已經壞了一個月，一直維持外星人型態變不回來。但是阿茲米斯叫他們兩年後再來。而阿貝多在這時候還是阿茲米斯的助手。在等待的時候，一個蓋文星變形體次級種變形魔闖進蓋文星並開始破壞，小班則跳出來阻止。小班不敵變形魔，讓它闖入了阿茲米斯的實驗室，要求阿茲米斯為它升級。它不但搶走了第二個「螺旋」，還擄走了阿貝多。在小班、馬克和阿茲米斯前去蓋文星B捕捉它時（小玟留在蓋文星上），阿茲米斯說出了他創造螺旋，還有創造出了變形魔。還提到變形魔生命密碼不完整所造成的缺陷，他能複製科技產品並加以吸收。阿貝多原想以兩個螺旋所超載的能量來消滅變形魔，但是卻使它更加強大。它不但吸取了馬克的槍，還試圖奪取Omnitrix。最後小班變身為鑽石戰神，將它封印在水晶體之中。 駭霸複製了這段記憶，並改名為「田小班」為之後留下伏筆。

小班變身閃電雪怪擊敗前來搶奪Omnitrix的巨雷。這時商人布拉尼霍星星來找小班談生意，他表示他可以解決小班的變身問題，只要小班幫他代言他的靈藥。一開始小班不答應霍星星立刻叫觀眾出來示範，但那其實是他的助手─硬硬布拉。在滴上靈藥後，立刻長出綠色的頭髮。霍星星為對小班示好，所以送他限定版的狂暴相撲公仔。小班請戮克調查，發現霍星星．T．布拉尼教授只不過是個星際騙子。後來，小班遇到派斯，聽到派斯宣稱霍星星在做危險的事。小班和派斯一起潛入霍星星的船，發現靈藥是從一個叫可可奇的外星小生物身上抽取的，霍星星發現並加以阻止，還轟掉了派斯的頭。派斯自稱是外星人人權鬥士，並將可可奇解放。但是可可奇一到外面就變成了口吐酸液的大怪獸，並開始破壞街道，派斯說可可奇接觸到氮氣就會發狂。最後小班變身積木猩困住可可奇，讓霍星星將氮氣抽出，才解決了麻煩。雖然霍星星想要回可可奇，但是戮克將可可奇帶走。

小班和戮克原本要追查一直襲擊小班的突變怪物。小班認為是董悟博士所為，但是戮克卻說明他目前在天工會總部監獄。二人前往探查，抵達後發現董悟博士已逃獄。為了要追蹤逃獄的董悟博士，他們沿著螞蟻的痕跡一路從下水道追尋著，在路上遇到了巨大並且會吐火的螞蟻怪。最後來到了董悟博士的巢穴─巨大蟻窩。駭霸的寵物又在這時出現襲擊，小班變身成為新外星英雄─炸蚱蜢成功阻止董悟將世界轉變成變種蟻的世界，也阻止駭霸的狗。

小班和戮克調查一艘神秘的外星人幽靈船，發現阿吉和維德兄弟為了佔有一個末日儀器而戰。最後因為奧圖剛不小心啟動了灰飛煙滅器，導致整個宇宙毀滅。小班變身為X超人以重新創造整個宇宙世界，只是沒有人相信。

小班和戮克在一場激烈的爭吵後分開。駭霸趁機擄走小班。

小班得知Nemetrix的由來，以及在駭霸、變形魔和神經蟹博士之間的關係。