Maintenant seul, Ben décide d'être un super-héros en solo, mais Grand-Père Max a d'autres projets...

Ben et Rook explorent une ville alien cachée, mais Khyber les suit de près...

Les Mégawhatts sont de retour, mais ne semblent pas avoir de mauvaises intentions cette fois...

Ben, Gwen et Grand-père Max rendent visite à Azmuth. Cependant, quelqu'un d'autre est là...

Ben doit capturer un alien dangereux qui sème le chaos, mais un activiste alien veut le sauver.

Le docteur Animo s'est échappé de la prison des Plombiers, et Ben et Rook doivent l'arrêter avant qu'il ne transforme le monde entier en sa ferme personnelle de fourmis mutantes.

Argit et les frères Vreedle se battent pour entrer en possession d'une arme apocalyptique.

Après une solide dispute, Rook n'accompagne plus Ben, ce qui donne une chance à Khyber de capturer le porteur de l'Omnitrix !

Captif dans le vaisseau de Khyber, Ben en apprend un peu plus sur les origines du Nemetrix et sur le lien entre Khyber, Virus et le Docteur Psychobos !