עונה שניה למותחן האפל, עמוס החידות והקונספירציות. הפרק הראשון מתרחש כולו בעבר ובו המדען המחונן פיליפ קארוול פוגש את מילנר הצעירה והשניים רוקחים תכנית רדיקלית.
הרשת מענה את ג'סיקה בנוגע לשינויים שאביה עשה ליאנוס. בינתיים, איאן וגרנט מנסים למצוא את בקי, ואילו ארבי מנסה לבנות לעצמו חיים חדשים אך מקבל מבקר מן העבר.
ארבי לוקח את איאן, בקי, גרנט, דונלדסון ואנטון למקום מוגן, ובמהרה כולם מבינינם מיהו אנטון באמת. החבורה הולכת לבן, האקר צעיר, שמאשר בפניהם את מה שהרשת תכננה. בינתיים, ווילסון ולי עובדים יחדיו על מנת לאתר את הנמלטים.
דאגדייל מסכים בחוסר רצון לתת לג'סיקה מקום מקלט לאחר שהוא מבקר את ג'ן ואליס בכלא סודי, אז זה ברור שהוא יעשה כל מה שהרשת דורשת ממנו על מנת לשמור על ביטחון משפחתו. בינתיים, ג'סיקה מחפשת אחר איאן, כאשר מילנר עושה זאת במקביל.
לאחר שארבי חוטף את אנטון וגרנט, איאן ובקי יוצאים לחפש את מייקל, מה שמוביל את ווילסון אליהם. השניים משכנעים אותן לנתח את התרשים של אנטון, וממנו ווילסון מבין שהשינויים שפיליפ בצע ביאנוס הרבה יותר גרועים ממה שהם מצפים.
ווילסון לוקח את הקבוצה לבית חולים פרטי של הרשת. בעוד הרופאים מטפלים בפצעיו החמורים של ארבי, ג'סיקה מחפשת אחר אחיה בעוד איאן, ווילסון ובקי יוצאים לחפש אחר טרנס טרומן, סוכן הרשת שמתכנן לשחרר את וירוס השפעת הרוסי.