O Gon, um jovem de doze anos, cumpre a promessa que fizera à Dona Mito, a mulher que o criou, para assim receber a permissão de partir numa jornada para a Prova dos Caçadores e assim tornar-se um como o seu pai. A caminho, num barco, rumo ao local da prova, ele se encontra com o Leorio e o Kurapika, outros que desejam tornar-se caçadores... mas os três já começam aos trancos e barrancos...

Gon, o Leorio e o Kurapika chegam na cidade onde a prova acontecerá. Lá, eles seguem o conselho do capitão e encaminham-se pelo atalho para a área da prova. No caminho, acabam passando por um subúrbio onde um grupo e uma senhora os aguarda. Ela então lhes diz que, para continuarem, eles deverão passar pelo seu questionário ou serão desqualificados.

Kiriko trouxe os nossos três heróis até a área da prova. Muitos aplicantes já se encontram no local. Encontra-se até o veterano Tonpa, o arrepiante Hisoka e um ninja falastrão, o Hanzo, além de um jovem com um skate. A primeira fase da prova está prestes a começar.

Os candidatos conseguiram chegar no fim do túnel que desboca no Banhado dos Trapaceiros. Lá, eles não conseguem enxergar um palmo na frente do nariz e ainda por cima viram alvo de vários monstros. O Gon e o Killua correm em frente a um dos grupos, enquanto o Leorio e o Kurapika ficam logo atrás, até que um grupo de aplicantes resolver cercar o Hisoka.

Depois do tumulto envolvendo o Hisoka, o Gon e os seus amigos se veem capazes de chegar na área da segunda fase da prova. Os examinadores desta são a Menchi e o Buhara. A tarefa deles é cozinhar e, mesmo sendo uma tarefa simples, os candidatos sofrem para criar um prato que satisfaça a nossa caçadora gourmet. Será alguém capaz de saciá-la?

Depois do Gon e os seus amigos passarem com sucesso pela segunda fase da prova, entraram então numa aeronave que os levará até a terceira fase. Dentro dela, o Gon e o Killua exploram o lugar e acabam cruzando pelo Netero que os propõe um jogo simples. Tudo o que eles precisam fazer é tomar a bola dele e assim se tornarão caçadores.

O dirigível chega na Trick Tower, a área da terceira fase da prova. Os candidatos devem então chegar à base dela dentro de 72 horas. O Gon, o Killua, o Kurapika e o Leorio finalmente descobrem uma maneira de seguir, contudo cinco membros são precisos antes que eles possam progredir além... mas quem será o quinto participante?

O Gon e os seus amigos devem ganhar três vezes para chegar à próxima etapa. A segunda rodada trata-se de ver de quem a primeira vela que se apagará. Acontece que a vela do Gon havia sido alterada. Na rodada seguinte, o Kurapika se vê num jogo de vida ou morte contra o matador Majitani, até que este revela uma tatuagem de aranha nas suas costas, o símbolo da Trupe Fantasma.

Uma prisioneira afirma que Majitani está apenas inconsciente, portanto, a partida de Kurapika não foi acertada. Leorio e até Killua não podem convencer Kurapika a terminar a luta, pois este se recusa a lutar contra uma pessoa que perdeu a vontade de lutar. Frustrado, Leorio decide usar a regra da maioria como uma maneira de escapar da dificuldade, mas ninguém o apoia.

Depois de vencer a aposta em Majitani, Leroute, como é chamada a prisioneira, aposta com Leorio sobre seu sexo. Apesar de parecer conspicuamente feminina, Leorio, para grande aborrecimento de Killua e Kurapika, aposta que ela é do sexo masculino.

A equipe fica dentro de uma pequena sala por cinquenta horas e evita ficar entediada. Então eles passam o tempo restante indo para uma série de armadilhas e truques.

Gon decide enviar uma carta para sua tia Mito, a fim de informá-la sobre os eventos que aconteceram durante sua jornada. Ele começou a narrar a história dos eventos, desde o exame preliminar de Hunter até o ponto em que conheceu Leorio, Kurapika, Killua e os outros examinadores.

Gon aprende a dominar sua precisão com seu mastro para tentar roubar a chapa de número de Hisoka. Finalmente, dominando-o, decide roubá-lo quando Hisoka está ocupado pegando sua presa.

Gon está confiando no Bloodcrazy Butterflies para encontrar seu alvo, Hisoka, antes de esperar o momento perfeito para usar sua habilidade com a vara de pescar para arrebatar a etiqueta de Hisoka. Enquanto isso, Leorio é enganado por Tonpa e perde sua própria marca, mas Kurapika o ajuda a recuperá-la. Agora que Kurapika e Leorio sabem que nenhum dos dois é o alvo, eles decidiram formar uma aliança.

Kurapika e Leorio estão sendo perseguidos por Hisoka, mas eles conseguiram sair da luta. No entanto, o encontro deixa Hisoka excitado, então ele sai em busca de um novo alvo. Gon é capaz de usar sua vara de pescar para pegar a etiqueta de Hisoka quando Hisoka ataca seu alvo. No entanto, quando Gon tenta escapar, ele é atacado por outro candidato e perde sua etiqueta ...

Killua se cansa de ter Imori sombreando-o, então ele desafia Imori a lutar e rapidamente o despacha. Enquanto isso, Gon se juntou a Leorio e Kurapika. Os três elaboram um plano para pegar a etiqueta de Ponzu e segui-la até uma caverna de aparência suspeita. É quando Leorio insiste em ir sozinho.

Gon e seus amigos foram presos dentro de uma caverna por cobras venenosas. Bourbon, o responsável pela armadilha, já está morto e ninguém sabe como desarmar a armadilha. Enquanto isso, Leorio, que foi picado pelas cobras, está ficando fraco. Gon consegue tirá-los da situação complicada e passar para a fase final do exame. Mas primeiro, Netero quer uma entrevista com cada um dos candidatos restantes ...

Gon e seus amigos avançaram para a fase final do exame Hunter. A fase final é um torneio em que os vencedores estão fora e os perdedores avançam. A regra é que, se você matar seu oponente, será desqualificado. O primeiro mach é Gon contra Hanzo. Gon não pode fazer nada contra Hanzo, mas ele se recusa a desistir. Hanzo está perdendo a paciência e ameaça quebrar o braço de Gon.

Gon acorda e se vê sendo parabenizado por Satotz por ser a primeira pessoa a passar no exame Hunter. Gon pergunta a Satotz se o exame ainda está em andamento e Satotz diz a ele que acabou. Satotz revela o que acontece depois que ele perdeu a consciência, e Gon descobre uma mudança chocante de eventos.

Irritadíssimo por ter o seu amigo, o Killua, forçado a matar, o Gon vai para cima do Illumi e diz estar a caminho da montanha Kukuroo resgatar o jovem assassino. Os seus amigos partem com ele e o Satotz menciona o fato da prova ainda ter sido concluída...

Após chegar na República de Podokea, o Gon, o Leoria e o Kurapika entram em uma excursão para a montanha. É lá que o Killua vive. No caminho deles, um portão enorme bloqueia a passagem. Qualquer um que ouse passar por uma porta alternativa é imediatamente comido pelo cão de guarda. Persistente, o Gon pede ao senhor que cuida do portão que deixe os seus amigos e ele entrarem para poderem visitar o Killua.

O Gon e os seus amigos decidiram passar pelo portão para ver o Killua. Primeiramente, é preciso treinar na residências dos serventes até terem a força para poderem abrir o portão. Enquanto isto, dentro da mansão, o Killua descobriu que o Gon veio vê-lo. Os três então, finalmente, conseguem abrir o portão após completarem o treinamento, mas, aí, deparam-se agora com a mordomo Canary no seu caminho.

Com a ajuda da Canary, alguém que se preocupa com o Killua, o Gon e os seus amigos se aproximam da mansão. Salvo que a Kikyo lhes diz que o Killua não pode vê-los, pois se encontra em um confinamento, na solitária. Em verdade, o Killua recebe uma convocação do Silva, o seu pai, que deseja saber se ele deseja mesmo ver o seu amigo. Respondendo-lhe com firmeza e sinceridade, ele é, enfim, liberado para vê-los...

A Canary acaba por guiar o Gon, junto dos seus amigos, para a secretária dos mordomos. Lá, todos se encontram com o Goto, mordomo chefe, que logo os desafia a um jogo de moedas para determinar se eles são pessoas dignas da amizade do digníssimo Killua. Após vencer o jogo e se reunirem com o Killua, os amigos se veem diante de um novo horizonte.

Uma carta do Gon chega para a Dona Mito, na Ilha da Baleia...

O Gon e o Killua chegaram na Arena Celeste, onde adversários tornam-se mais fortes conforme se ascende na torre para treinar e ganhar dinheiro. Ambos já avançam imediatamente para o quinquagésimo andar, após a conclusão das suas lutas no primeiro. Lá em cima, eles encontram o Zushi, jovem que, por acaso, enfrenta o Killua na sua primeira luta nos andares superiores. Sem muitos problemas, mas enfrentando muita resistência, o Killua vê o Zushi utilizando uma técnica que se assemelha à usada pelo seu irmão...

Conforme o professor Wing explica os princípios do nen para os meninos, o Killua se vê desconfiado, imaginando que tola a história não lhes foi contada. Após uma subida meteórica, os amigos chegam no 190º andar e têm a sua chance de se registrarem para uma luta no famigerado 200º andar. O que não previram foi, logo ao adentrarem no andar em questão, uma intenção de morte diferente de tudo o que já houveram experimentado.

Após alcançarem o ducentésimo andar, o Gon e o Killua se deparam barrados pelo nen do Hisoka. Então perguntam ao professor Wing como usar o método violento que despertará o seu nen junto do seu potencial. Com o prazo limite, para registro naquele andar, os pressionando, dá-se início ao treinamento dos quatro princípios do nen.

Ao se ver defronte do Gido, na sua primeira batalha no ducentésimo andar, o Gon usa o ten para se proteger, mas logo se vê totalmente incapaz de outra coisa contra a dança de piões do adversário. Desesperado, ele tenta achar uma maneira de revidar até decidir-se por uma abordagem audaciosa...

Um mês se passou desde que o Gon se feriu gravemente e o Hisoka e o Kastro estão prestes a lutar na Arena Celeste. Este último foi capaz de dar um nocaute no Hisoka em outra luta e soa, agora, muito confiante em uma entrevista. Já o seu adversário se mostra tranquilo enquanto a luta que se aproxima.

O Kastro, dispondo do seu nen, criou réplicas de si mesmo para arrancar um braço do Hisoka e ficar em vantagem durante a luta. Mesmo assim, após perder os dois braços, o Hisoka não se mostra abatido, o que, por fim, faz com que o seu adversário perca as estribeiras e parta para cima do Hisoka.

Após dois meses, o Gon e o Killua finalmente têm a permissão para praticar nen novamente. É aí que o Gido, o Sadaso e o Riehlvelt aparecem diante deles e lhes pedem para lutar com eles na arena. Os dois amigos recusam, mas o Killua estranha o comportamento do Sadaso.

O Gon tem na agenda lutas marcadas contra o Gido e o Riehlvelt. Visto que segue irritado pelo que fizeram ao Zushi, ele é capaz de suportar os ataques do Gido e prevalecer sob ele em batalha. O Hisoka parece apetecido pelo desempenho que vê.

O Gon e o Killua começam a treinar hatsu, o desembocar de tudo que aprenderam sobre nen. Então, finalmente, o Gon desafia o Hisoka para um duelo em vista de retribuir o favor que lhe foi dado durante a Prova dos Caçadores. Tudo o que passa na sua cabeça é dar uma bem dada na cara do Hisoka.

Após dar um murro no Hisoka, o Gon devolve o número que havia recebido durante a Prova dos Caçadores. Extático, o Hisoka vê o amadurecimento do Gon e resolve usar algumas das suas cartas na manga para atacá-lo. Quem prevalecerá vitorioso nesta batalha?

Após aprender nen e tornar-se um caçador de verdade, o Gon retorna à Ilha da Baleia junto do Killua. Ao chegarem lá, a Dona Mito exibe uma caixinha que havia guardado para o Gon. Ela lhe diz o seu pai havia pedido que ela lhe entregasse quando ele se tornasse caçador. Estranhamente, no entanto, a caixa não parecer querer abrir.

A caixa deixada pelo Ging para o Gon contém uma fita cassete com uma gravação com a voz do Ging. Surpresos, após escutarem a mensagem, a fita se apagou sozinha não interessassem os esforços que o Gon e o Killua fizessem para contê-la. Agora, como pista para encontrar o seu pai, só restaram ao Gon o anel e um cartão de memória.

A Trupe Fantasma é o inimigo mais odiado pelo Kurapika. Há cinco anos, eles tomaram dele os seus parentes e amigos, tudo ...

O Kurapika e outros atrás de emprego chegam na casa do colecionar de partes humanas e são atacados por força desconhecida. Conforme lutam contra os repentinos inimigos, o Kurapika identifica o indivíduo de comportamento duvidoso. Em outro caminho, o Gon e o Killua seguem para Iorque Nova à procura de informações do jogo Greed Island, tudo por uma pista do paradeiro do Ging.

O maior leilão do mundo acontece em um lugar da cidade de Iorque Nova. O líder da Trupe Fantasma, o Chrollo, instruiu os seus membros a se unirem na cidade. Por que propósito? O bando de saqueadores começa a se movimentar.

O leilão está prestes a começar. O Leorio, o Gon e o Killua estão trabalhando duro para acumular a quantia de dinheiro necessária para comprar o jogo da Greed Island. Já o Kurapika foi designado para monitorar a casa de leilões, enquanto a Trupe Fantasma se aproxima. Em Iorque Nova, todos os caminhos se cruzam!

A Trupe Fantasma ataca o leilão clandestino, organizado pela máfia. Tudo feito, não restam sinais das mercadorias ou dos convidados. A máfia então põe uma recompensa pela cabeça dos saqueadores e se começa a perseguição. Nela seguem o Kurapika e os guarda-costas na patrulha atrás da Trupe. O primeiro contato se aproxima.

Após trucidar os perseguidores da máfia, ela despacha a sua arma secreta, as Bestas das Sombras. O Uvogin, no entanto, é capaz de derrotá-las sozinho. Até que, em meio a luta, as costas dele revelam a tatuagem da aranha que incita o Kurapika a agir.

O Kurapika capturou o Uvogin com sucesso, o décimo-primeiro membro da Trupe Fantasma. O vingador enfrenta duras penas para controlar a sua ira enquanto a aranha faz exigências como se estivesse no controle da situação. É aí que o Kurapika recebe uma mensagem do Hisoka...

O Uvogin pôde escapar com a ajuda dos seus camaradas bandidos. Após exaltar o seu orgulho, no entanto, ele se vê determinado a achar e abater o Kurapika. Já este percebe que a Trupe Fantasma já desvendou a sua base e locomove a sua chefe para um lugar seguro e aguarda pela chegada do membro que não faz ideia de estar sendo convidado.

O Kurapika se vê frente a frente com o Uvogin, um membro da Trupe Fantasma a qual destruiu o clã Kurta. A aranha então lhe diz não se recordar dos Kurtas, o que enfurece o Kurapika. O confronto de um contra a um tem o seu início.

O Gon, o Killua e o Leorio seguem tentando pôr as mãos no dinheiro para comprar o jogo. Aí, ao passar por um mercado, o Gon se depara com algumas mercadorias valiosas. O plano da vez é comprar barato e vender por um preço mais justo. O que eles não sabiam é que alguém mais se encontrava na jogada.

O Gon e os seus amigos esperam obter a recompensa que foi posta pela cabeça da Trupe Fantasma. Ao mesmo tempo, a Machi e o Nobunaga foram despachados para procurar o das correntes, visto que o Uvogin não retornara. Através de uma dica, o Gon e o Killua começam a andar na cola desses dois membros da Trupe.

Capturados pela Trupe Fantasma, o Gon e o Killua passam por um interrogatório. A Trupe deseja saber se eles conhecem o das correntes, mas eles ainda não ligaram uma coisa à outra; ainda não sabem que se trata do Kurapika. Enfim, prestes a serem libertados, o Nobunaga decide que quer que eles fiquem e os segura lá. Serão eles capazes de fugir?

O leilão foi reagendado e a máfia espera que a Trupe Fantasma ataque novamente. Os Dez Dons contrataram toda a sorte de assassinos para dar cabo deles. Enfim, o senhor Light Nostrade envia o Kurapika para corroborar com os assassinos na varredura da Trupe.

A Trupe ataca o leilão com toda a sua protuberância. Os assassinos contratados pelos Dez Dons não lhe são páreos, salvo pelo Zeon e pelo Silva.

O líder da Trupe Fantasma está morto... Chocado pela notícia, o Kurapika permanece em dúvida até pôr os olhos no cadáver, enquanto todos os corpos são recuperados.

O Gon, o Killua, o Kurapika e o Leorio finalmente se reúnem. O Kurapika revela os seus poderes para os outros, embora o Killua tema que o Kurapika esteja agora em perigo, visto que um membro da Trupe consegue ler mentes. Noutro local, o Chrollo usa o seu recém roubado poder de prever o futuro para checar a sorte dos membros.

Depois do Chrollo prever a sorte de todos os membros da Trupe, suspeita-se que o Hisoka tenha os traído. Motivado pelo seu forte anseio de lutar contra o chefe das aranhas, o Hisoka aposta alto ao fazer alterações nas suas previsões. Em outro canto, após descobrir que a aranha segue firme, o Kurapika une-se ao Gon e aos seus amigos para trabalhar em um plano de captura da Pakunoda.

O Chrollo usa as informações da Neon para identificar e localizar o das correntes, melhor dizendo, o Kurapika. Nesse meio tempo, o Killua segue de olhos na Trupe Fantasma quando a Melody se junta a ele para lhe oferecer ajuda para definir que a Trupe vai em direção ao hotel do Kurapika. A aranha dispersa a sua teia atrás do vingador.

A Trupe Fantasma descobriu que o Kurapika foi o responsável pela morte do Uvogin. Será apenas uma questão de tempo para que descubram que o Gon e o Killua estão envolvidos com ele? O Chrollo os leva até o saguão do hotel, onde a Pakunona e outros membros da Trupe logo surgem. De repente, chega um blecaute. Na escuridão, o Gon e o Killua tentam fugir, mas quem acaba mesmo por sumir é o Chrollo...

O Kurapika capturou o Chrollo. Ele oferece a libertação do líder das aranhas, caso a Pakunoda traga-lhe o Gon e o Killua, porém ele se vê incapaz de controlar as suas emoções diante do líder das aranhas. Esperará ele pelos seus amigos ou executará a sua vingança?

O jogo Greed Island, o qual inclui uma pista para encontrar o Ging, vai finalmente a leilão. O Gon e o Killua perguntam ao dono do lance vencedor se é do seu interesse contratar jogadores, mas acabam ouvindo lhe dizerem que eles são muito fracos. Em vista disto, eles começam a treinar em habilidades especiais.

O Gon e o Killua tentam ser os jogadores selecionados para jogar Greed Island. O juiz é o Tsezgerra e ele diz que tomará a sua decisão conforme os candidatos exibirem o seu nen. Apenas 32 dos 200 candidatos passarão, serão dois deles o Gon e o Killua?

O Gon e o Killua finalmente adentraram no mundo proporcionado pela Greed Island, onde se encontra uma pista para a procura do Ging. Lá, porém, tudo o que encontram é uma mensagem do Ging dizendo ao Gon que aproveite o jogo. O primeiro passo deles então é procurar uma cidade e coletar informações. Ao chegar em uma, eles recebem um convite para entrarem em um grupo que deseja zerar o jogo.

O Gon e o Killua partem para Masadora à procura de cartas feitiços. No caminho, de deparam com vários tipos de diferentes de monstros, mas sofrem nas mãos dos mais fortes. É aí que, após se irritar, uma jovem chamada Biscuit resolve interferir na jornada dos jovens. Qual será o seu objetivo?