Попав в прошлое, команда SG-1 меняет будущее. В новой реальности Дениел и Картер никогда не слышали звёздные вратах и не являются членами военной организации SGC.

Команда SG-1 отправляется в прошлое, что бы украсть «нулевой модуль» древних.

Галактика вновь находится под угрозой гоа`улдов. Дениел стоит перед выбором умереть либо стать одним из расы древних. О`нилл и Картер выясняют личные отношения между собой.

Репликаторы начинают наступление на Землю. Саманта Картер и её отец пытаются активировать единственное оружие против репликаторов.

Репликатор-двойник Самнаты крадет Даниела на свой корабль где подвергает пыткам пытаясь выяснить тайны древниx. Тилк и мастер Брайтак, организовывают взятие священного города Джафа , в это же время лорд Баал просит помощи у SGC для борьбы с репликаторами.

Обычный парикмахер из Индианы, из обычного маленького американского города, начинает видеть приключения секретной команды SG1.

Русская армия приведена в полную боеготовность, полковник Чехов отправляется в SGC для разъяснения сложившейся ситуации. Дениел в это же время отправляется в Россию.

Токра сообщают О`ниллу, что его старому другу Мельборну угрожает опасность, к его планете направляется космический корабль гоа`улдов. Прибыв на планету О`нилл узнаёт, что Мельборн стал королём местного поселения, также оказывается, что Мельборн знал о приходе SG1 и пообещал свои “поданным” о победе над гоаулдами.

Космический корабль Прометей подвергся атаке. Весь экипаж Прометея был транспортирован на другой корабль, единственный кто не был транспортирован это Дaниел.

Репликатор-двойник Саманты Картер, связывается с SGC с тем, что бы они её уничтожили, поскольку у них есть оружие против репликаторов, но за этой “просьбой” кроется нечто другое.

Бывшие работники ЦРУ с помощью учёного из Зоны 51 забирают врата и начинают их использовать против гоа`улдов как оружие массового уничтожения, применяя биологическое оружие от Токра.

Тилк вновь встречается со своей подружкой Ишта. Ишта недовольна движением Джафа воинов и пытается убедиться Тилка в том что наступило время для решающих действий – восстания джафа против гоа`улдов. В то же время Раек сын Тилка собирается жениться, но будущую жену Раека не устраивают старые обычаи венчания.

Миллионер по имени Колсон сообщает общественности о существовании пришельцев на Земле. Командование SGC взволнованное этим сообщением пытается дискредитировать миллионера использую помощь Тора. Полковник Картер пытается убедить Колсона в не раскрытии секретной информации.

Генерал О`нилл даёт Тилк-у “добро” на переезд в новую квартиру. Тилк начинает встречаться с привлекательной соседкой у который проблемы с её бывшим парнем. В то же время Пит друг Картер делает ей свадебное предложение.

Учёные из SGC предлагают Тилку сыграть в компьютерную игру, которая симулирует боевые действия в виртуальной реальности (устройства из 3го сезона “Хранитель игры”) , но во время тестирования новой технологии Тилк оказывается в западне и вынужден заново и заново переживать одни и те же события, к нему на помощь приходит Дениел.

Дениел оказывается на чужой планете где идёт гражданская война, вызванная активацией звёздных врат. Генерал О'нилл пытается наладить контакт с новой властью с тем что бы вернуть Дениела, но всё оборачивается другим образом.

SG1 попадает в плен к гоа`улду Баалу, в то же время в SGC один исследовательский эксперимент проходит неудачно и генерал О'нилл должен успеть решить все эти проблемы до официального визита президента Америки.

В SGC происходят странные события, Анубис захватив человеческое тело пытается пройти через звёздные врата, генерал О'нилл вынужден перевести базу на карантинный статус.

В то время как Гоа'улды угрожают атаковать Землю, SG-1 и Асгард делают последний отчаянный бой против репликаторов, которые захватили майора Картера и вторглись на последний форпост цивилизации Асгарда.

Картер и Тил'к отправляются на поиски Асгарда, чтобы попытаться спасти полковника О'Нила, но обнаруживают, что враг Асгарда вернулся с местью. Лорды Системы стремятся к союзу с Землей против общего врага.