Nadat O'Neill en Carter na hun avontuur op de Beliskner terugkeren, blijkt één replicator de crash te hebben overleeft en valt een Russische onderzeeër aan.

Een buitenaards ras heeft de Stargate ontdekt en vraagt SG-1 voor hulp in hun oorlog in ruil voor technologie.

De Tok'ra brengen apparaten mee die superkrachten geven.

Een Jaffa priesteres genaamd Shau'nac vertelt dat ze contact kan maken met haar symbioot en deze wil bij de Tok'ra.

Na een aanslag op een Tok'ra leider blijken er Za'Tarc te zijn. Een Goa'Uld hersenspoelmethode.

De aarde is in een tijdslus geraakt en O'Neill en Teal'c zijn de enige die hiervan bewust zijn.

De Russen hebben de Stargate vanuit het wrak van de Beliskner gevist en zijn hun eigen Stargate programma begonnen. Helaas is een complicatie het geval en ze roepen de hulp in van SG-1.

Daniël wordt gevangengenomen door een Unas. SGC zet een reddingsoperatie in gang maar ontdekken een ander gevaar.

Stargate SG-1 begeleidt een kolonisatiepoging van een erg gevoelig ras. Het blijkt dat een ander buitenaards ras de planeet ook voor kolonisatie geschikt acht, en daartoe de hele planeet steriliseert.

Een man die overal complotten in ziet, weet verdacht veel van het Stargate programma.

De luchtmacht heeft een Death Glider omgebouwd om er gebruik van te maken. O'Neill en Teal'c gaan een testvlucht maken, maar dan gaat er iets mis.

Daniël gaat naar een begrafenis van zijn vroegere mentor. Hij komt erachter dat zijn mentor Goa'uld technologie bezat.

Daniël, O'Neill en Carter proberen een verbond tussen Apophis en Heru'ur te voorkomen. Teal'c wordt gevangengenomen.

General Hammond neemt ontslag van het SGC. O'Neill vermoedt dat er meer aan de hand is en gaat op onderzoek uit.

Het is het jaar 2010. De Goa'uld zijn verslagen door een verbond met een geavanceerd ras.

Daniël wordt herenigd met het Harsesis kind, hij bezit alle kennis van de Goa'uld.

SG-1 vindt een mysterieuze machine die een verslavende werking heeft op hun.

Samantha Carter ontdekt een briljante studente op de militaire academie. Ze probeert haar naar het SGC te krijgen.

Een buitenaardse entiteit neemt de SGC en majoor Carter over.

SG-1 probeert een planeet te veroveren van de Goa'uld met behulp van robotklonen uit 'Tin Man'. Teal'c probeert wraak te nemen op Cronus voor de moord op zijn vader.

SG-1 heeft het moederschip van Cronus veroverd. Ondertussen valt Apophis de Tok'ra aan en SG-1 helpt hen met hun evacuatie.