כשס"ג-1 לכודים על ספינתו של קלורל, נראה כי כדור-הארץ נידון לחורבן בזמן שספינות הפירמידה מתכוננות להשמיד את הכוכב.

קרטר נתונה לשליטתה של גאולד הטוענת שהיא אויב של אדוני המערכת, טוקרה בשם ג'ולינאר, הנמצאת במנוסה מפני מתנקש מיומן של הגאולד המבקש לשים קץ לחייה.

ס"ג-1 עומדים למשפט ומוגלים לעולם המשמש כבית-כלא. שם הם פוגשים באישה מבוגרת, שמשום מה מצליחה לשלוט בכל האיסרים ביד רמה ויחדיו הם זוממים לברוח דרך הסטארגייט.

ס"ג-1 כלואים במציאות וירטואלית בעודם נאלצים לחיות מחדש את הרגעים הגרועים ביותר של חייהם שוב ושוב - דניאל חוזה במות הוריו, אוניל במות חברו לצוות וקרטר במות אימה, והכל בשם הבידור.

הצוות מגיע לכוכב שנשלט על-ידי מה שנראה כגאולד, אך טומן בחובו הרבה יותר מהנראה לעין. ג'קסון הופך מכור להשפעת סרקופג של הגאולד ונופל לרגליה של הנסיכה המניפולטיבית של הכוכב.

ס"ג-1 חוזרים לסימריה, הכוכב בו אוניל וטיאלק נלכדו במבוך תת-קרקעי, ומגלים כי הכוכב בסכנת פלישה מידייהם של הגאולד ללא ההגנה שהציבו האסגרד.

ס"ג-1 מגיעים לעולם קר ונטוש ומגלים חפץ עתיק ומסקרן ובמביאים אותו לכדה"א. לאחר התבוננות בו מחליט אוניל להשיב אותו לכוכב, אך בדיוק אז הוא שובה את אוניל ואת מפקדת הסטארגייט כבני ערובה.

צוות ס"ג-1 מנסה להציל את הבן של טיאלק אשר נחטף ומוחו נשטף על-ידי אפופיס, בעוד טיאלק לומד חדשות מטרידות על אשתו.

ג'קסון מגלה שאשתו חזרה לאבידוס, אלא שכעת היא בחודש התשיעי להריונה מידיו של אפופיס. בעוד שעל כדה"א, אוניל חייב למנוע את חשיפתה של תוכנית הסטארגייט לעולם.

טיאלק נעקץ ע"י חרק ענק וקטלני ומוחדר לגופו ארס רעיל, טיאלק שמתחיל טרנספורמציה נוראית שבסופה גופו ישרוץ חרקים נמצא במנוסה. כעת ס"ג-1 חייבים למצוא אותו לפני קולונל מייבורן.

ס"ג-1 מאתרים את הטוקרה, תנועת התנגדות של גאולד המתנגדים לאדוני המערכת ומנסים ליצור ברית. במקביל, הסרטן של ג'ייקוב קרטר, אביה של סם, מביא אותו לסף מוות.

בעוד ס"ג-1 מנסים ליצור ברית עם הטוקרה, מתגלה מרגל בקרב הטוקרה שמעביר מידע לידיי הגאולד וג'ייקוב קרטר מגלה כי הטוקרה עשויים להיות תקוותו היחידה להישרדות

ס"ג-1 מוצאים כוכב לכת המאוכלס על ידי מה שנראה כמו צאצאי האינדיאנים של כדה"א, כשהם מוגנים על ידי רוחות שמתגלות כמשני-צורה חוצניים מתקדמים וברשותם מחצבים גדולים של נקוואדה.

ס"ג-1 מואשמים בגניבת מכשיר לשליטה על מזג האוויר, דבר המוביל את כוכב הלכת הפרימיטיבי לכאוס. במהלך החקירה, הצוות מגלה כי נעשה שימוש לרעה בסטארגייט השני שעל כדה"א.

אוניל, בעל כורחו, הופך להיות כלי קיבול לספרייה של ידע זר. עד מהרה הוא מבין שעליו להיפטר מהידע שבראשו בטרם יקרוס תחת העומס על מוחו והוא מתחיל לבנות מכשיר שיעזור לו בכך.

לאחר שהצוות מגיע לעולם על קצהו של חור שחור, מפקדת הסטארגייט לא מצליחה לנתק את הסטארגייט. כעת כל כדור-הארץ נמצא בסכנה בגלל שדה כבידה מעוות-זמן.

ס"ג-1 מגיעים למעבדתו של אדם מבוגר וגוסס שידוע בפיתוח טכנולוגיה להילחם בגאולד. דניאל מרומה להחליף את גופו עם אותו אדם, מאצ'לו, שמאמין שזה גמולו על מלחמתו בגאולד.

אפופיס, האויב הגדול ביותר של ס"ג-1, מחפש מפלט מסוקאר ומגיע לסף מותו במפקדת הסטארגייט, שם סוקאר דורש את נקמתו באפופיס ומאיים להחריב את כדה"א באם לא ייענה.

קבוצה של חייזרים פרימיטיביים מתחילים ליפול למשכב וקרובים למוות לאחר שס"ג-1 מגיעים לכוכבם, וכשהצוות אובד עצות, נדמה כי את הדבר שגרם לאסון לא ניתן לעצור.

ילד צעיר מגיע דרך הסטארגייט ומזהיר מפני מזימה של חייזרים בלתי-נראים להרוג את כל המין האנושי וזאת כדי למנוע מבני האדם לשמש את הגאולד כמארחים פוטנציאליים.

תאונה קוסמית גורמת לצוות ס"ג-1 להישלח לאחור 30 שנה לתוך העבר של כדור-הארץ, שם הם חייבים לאתר את הסטארגייט ולמצוא את דרכם הביתה.

אוניל, קרטר וג'קסון מתעוררים מתוך קפאון במה שנראה כמפקדת הכוכב - כמעט 80 שנה בעתיד, ללא ידעתם של אנשי הצוות האחרים ועם ספקות גדולים במה שסופר להם.