Jack O'Neill pozvan je iz mirovine kad nepoznata sila aktivira portal Zemljinih Zvjezdanih vrata i kroz njega otme jednog vojnika.

O'Neill vodi tim SG-1 na planet Chulak gdje ih zarobi sistemski lord Apophis. Jedina im je nada jedan od stražara.

SG-1 saznaje da je su Goa'uldi zarazili bojnika Kawalskog tijekom svoje misije. Liječnici ga operiraju u očajničkom pokušaju da ga spase.

SG-1 stiže na planet gdje žene smatraju pokornima i poniznima. Nazočnost kapetanice Samanthe Carter smjeta dovodi do meteža.

Nakon istrage planeta koji je podijeljen na svijetlu i mračnu stranu, baza Zvjezdanih vrata postaje zaražena smrtonosnom infekcijom.

SG-1 traži SG-9 kad se ne vrate kući. Saznaju da se kapetan SG-1 postavio za boga na planetu primitivnih.

Kad Jacka udari energija iz kristalnog izvanzemaljca, izvanzemaljac preuzme Jackovo oblik i vraća se na Zemlju umjesto njega.

Tim odlazi na jedan planet pronaći stvorenje s moći nevidljivosti i nailazi na Apophisa i njegove stražare. Poslije upoznaju zagonetnog Noxa.

Na planetu Argosu SG-1 otkriva da Argožani boluju od brzog starenja. Kad se zarazi O'Neill, tim traži lijek.

Na planetu koji su Goa'uldi stavili u karantenu Jack i Teal'c ostanu zarobljeni u podzemnom labirintu, gdje jedini izlaz vodi kroz Thorov malj.

Tim otkriva da je jedan istraživač Zvjezdanih vrata prošao kroz Vrata 1945. godine, ali se nikad nije vratio.

Teal'c zamoli tim da mu pomognu spasiti sina. Mogu li spriječiti da dječaka integriraju Goa'uldi i da postane rob Apophisa?

O'Neill, Carter i Teal'c vraćaju se kroz Zvjezdana vrata i objavljuju da je Daniel mrtav. No nije sve kako se čini. Može li tim spasiti Daniela?

Drevna egipatska božica i Goa'uld, Hathor, budi se i smjesta preuzima SGC i sve njegove muškarce. Na ženama je da spase situaciju.

Tim SG-1 dolazi spasiti djevojčicu koja je jedina preživjela bolest koja je pobila stanovnike cijelog planeta.

Kad tim SG-1 dovede nekoliko pripadnika umiruće izvanzemaljske vrste na Zemlju, moraju donijeti iznimno tešku odluku.

O'Neill i Carter zarobljeni su u ledenoj pustoši kad se Zvjezdana vrata pokvare. O'Neill je ozlijeđen pa ih Carter mora oboje spasiti.

Neznanac pokuša popraviti tim SG-1 zamijenivši njihova ljudska tijela robotskim replikama, no to poboljšanje na Zemlji ne funkcionira najbolje.

Daniel Jackson ulazi u alternativnu stvarnost, gdje Zemlju napadaju Goa'uldi, a O'Neil je prinuđen da uđe u borbu sa Teal'com.

Projekt Zvjezdana vrata doveden je u sumnju kad moćni senator odluči prekinuti financiranje unatoč opasnosti od invezije Goa'ulda.

Vlada inzistira na zatvaranju projekta Zvjezdana vrata pa tim poduzima drastične korake u pokušaju da spriječi invaziju Goa'ulda.