Jack O'Neill pozvan je iz mirovine kad nepoznata sila aktivira portal Zemljinih Zvjezdanih vrata i kroz njega otme jednog vojnika.

O'Neill vodi tim SG-1 na planet Chulak gdje ih zarobi sistemski lord Apophis. Jedina im je nada jedan od stražara.

SG-1 saznaje da je su Goa'uldi zarazili bojnika Kawalskog tijekom svoje misije. Liječnici ga operiraju u očajničkom pokušaju da ga spase.

Na planetu Argosu SG-1 otkriva da Argožani boluju od brzog starenja. Kad se zarazi O'Neill, tim traži lijek.

Na planetu koji su Goa'uldi stavili u karantenu Jack i Teal'c ostanu zarobljeni u podzemnom labirintu, gdje jedini izlaz vodi kroz Thorov malj.

Teal'c zamoli tim da mu pomognu spasiti sina. Mogu li spriječiti da dječaka integriraju Goa'uldi i da postane rob Apophisa?

O'Neill, Carter i Teal'c vraćaju se kroz Zvjezdana vrata i objavljuju da je Daniel mrtav. No nije sve kako se čini. Može li tim spasiti Daniela?

Tim SG-1 dolazi spasiti djevojčicu koja je jedina preživjela bolest koja je pobila stanovnike cijelog planeta.

Kad tim SG-1 stigne na Chartago, Teal'cu sude za ubojstvo čovjeka kojega je ubio dok je radio za zle Goa'ulde.

Kad tim SG-1 dovede nekoliko pripadnika umiruće izvanzemaljske vrste na Zemlju, moraju donijeti iznimno tešku odluku.

Taking after the author's vision of the pilot, visual effects have been enhanced, the soundtrack has been updated to include an entirely original score, and the new final cut features a more self-contained storyline.

Picking up the story nearly a year after the original 1994 Stargate film, Jack O'Neill and Sam Carter join a formidable Stargate team on a mission to Abydos to defeat fierce warriors led by the vicious Ra. With the threat of the brutal Gou'ald hanging over the galaxy, the team must succeed - or General Hammond will unleash an apocalyptic solution!