נאטסו, האפי ולוסי בדרכם אל לאמיה סקייל כדי לבקר חברה ותיקה. אחרי שהגיעו, הם מופתעים לגלות שהסיטואציה והנסיבות השתנו במהלך השנה שחלפה ושהחזרתה של פיירי טייל תהיה הרבה יותר מורכבת ממה שהיה נדמה להם.

וונדי ושליה מנסות לעצור את המתקפה על ידי הבסת מאלף המפלצות של אורוצ'י פין אך אויב רב עוצמה עומד בדרכן. לאחר הקרב, אחיות השמיים נפרדות בהבטחה שלעולם לא יפסיקו להיות חברות והחבורה ממשיכה ליעד הבא: ג'וויה.

נאטסו וחבריו מוצאים את ג'וויה לבד בכפר נטוש. אחרי שהיא מספרת להם על התנהגותו המשונה של גריי והיעלמותו, נאטסו ממהר לסייברטות' כדי למנוע מאירוע טרגי לקרות.

נאטסו, האפי ולוסי מתגנבים אל המפקדה של אווטאר בחיפושם אחר גריי. לרוע מזלם, הם מגיעים הישר אל חדר העינויים של הכת ונתפסים. הקבוצה מוצאת את עצמה מוכרחה להילחם במכשפים השחורים של אווטאר וביניהם גריי.

גריי וארזה חושפים את הפרטים לגבי המשימה הסודית שלהם. בינתיים, חברי הכת אווטאר מתכוננים להשמדת עיר שלמה של אנשים תמימים כדי להשלים את תכנית הטיהור שלהם. נאטסו, גריי והאחרים ממהרים אל שדה הקרב לפני שזה יהיה מאוחר מדי.

בדיוק כשנראה שהקרב כבר נגמר, אלוק מזמן את איקסאטסונאגי, אל המלחמה רב העוצמה, כדי לטבוח בחבריו שלו. מתברר לנאטסו שזו הייתה התכנית שלו מלכתחילה. נאטסו לא מוכן לסלוח לאדם שמזלזל בחייהם של חבריו ומתעמת ראש בראש עם איקסאטסונאגי ואלוק.

זרף מספר על תולדותיו והדרך בה קיבל את קללת הסתירה. בינתיים, לוסי מודאגת מכך שאולי חברי פיירי טייל הותיקים עברו כבר הלאה ואינם מעוניינים לבנות מחדש את הגילדה.

חברי הגילדה שהתאחדו בונים יחד את מבנה הגילדה מחדש. בינתיים, עולות תהיות בקרב החבורה מי יהיה המאסטר בזמן היעדרותו של מאקרוב. לאחר שהמאסטר נבחר, אדם מסוים עם הסמל של הגילדה מופיע ולוקח את המאסטר החדש אל הלומן היסטואר ושם מספר לו על איום חדש מהמערב שמאקרוב מנסה בכל כוחו למנוע מלהתממש.

נאטסו וחבריו יוצאים למשימה סודית לחילוץ מאקרוב שמצבו לא ידוע באימפריית אלברס. בדרך הם עוצרים באי קאראקול ונקלעים לעימות לא רצוי. בינתיים, שלושת המכשפים הקדושים הראשונים נחשפים במהלך פגישת מועצה.

ברנדיש, אחת מ-12 הספריגנים, מגיעה וקוטעת את הקרב של גריי ונאטסו נגד מארין. לפני שהיא עוזבת, ברנדיש מזהירה אותם לא להתעסק עם אימפריית אלברס משום שזה קרב שהם לא יכולים לנצח. בינתיים, מאקרוב ממשיך במשא ומתן בויסטאריון, בירת אלברס, ומגלה את זהותו המפתיעה של הקיסר ספריגן.

לאחר שהם סוף סוף מתאחדים עם מאקרוב, נאטסו וחבריו מנסים לברוח במהרה מהיבשת המערבית. הם נתקלים בדרכם באז'יל, הידוע בכיוניו "מלך המדבר" ואחד מ-12 הספריגנים. אז'יל לא מתכוון לתת להם לברוח.

מייביס מסיימת לספר את העבר שלה יחד עם זרף ומגלה את המקור והסוד של לב הפיה. בינתיים, זרף ו-12 הספריגנים מתכוננים למתקפה כוללת על ישגאל, בעוד שאקנולוגיה לא מתכוון להישאר מחוץ לתמונה.

לפני שהקרב על קיום פיירי טייל מתחיל, חברי הגילדה מעבירים את הלילה בניסיון להרגיע את הרוחות. אך כאשר הצבא הענקי של אלברס פותח במתקפת פתע, קשר הסולידריות של פיירי טייל נעמד למבחן.

פיירי טייל מוקפת מכל הכיוונים ונמצאת בחסרון מספרי עצום. לוסי מתעמת עם ברנדיש באמבטיה שלה וארזה מוצאת את עצמה נאבקת על חייה במהלך הקרב נגד אג'יל.

אג'יל מ-12 הספריגנים סוף סוף הובס אך עכשיו אדם אחר מ-12 הספריגנים שהצליח לחדור למגנוליה מהווה איום. גריי, ג'וויה, מירה ג'יין, ליסאנה ואלפמן נלחמים נגד אויב שמתמחה בזיהוי חולשות יריביו בעוד ששבט הרעם מנסה להגן על פריד בכל מחיר.

גילדות מכשפים מכל רחבי פיאורה חוברות לפיירי טייל בקרב על ישגאל נגד הצבא של זרף. במקביל, האפי ונאטסו עפים במהירות אל זרף כדי ליישב את העימות איתו אחת ולתמיד.

זרף, שחש שמותו קרב ובא, חושף בפני נאטסו את הסוד שעומד מאחורי לידתו. לאחר שנאטסו מגלה את האמת המפתיעה, הוא מניף את אגרופיו פעם אחת נוספת. במקביל, גילדות המכשפים של פיאורה מתחילים את העימות נגד צבא אלברס ו-12 הספריגנים.

ברנדיש מצליחה בקושי להימלט ממוות, תודות ללוסי וקאנה. לאחר שהיא מתעוררת, היא מגלה ללוסי מה הקשר שלה לליילה, אמה של לוסי. לא עובר זמן רב עד שברנדיש מוציאה את הכעס והעצב שלה על לוסי.

גוד סרנה מביס את ארבעת הקיסרים של ישגאל ונראה שהקרב במזרח הסתיים. במקביל, גאג'יל, ארזה, לאקסוס ושאר חברי פיירי טייל הולכים אל קצוות היבשת כדי לעזור לשאר הגילדות בקרב שלהן מול צבא אלברס העצום.

בשיא הקרב נגד וואל, הזיהום שחלקיקי חסימת הקסם יצרו הגיע לרמה מסכנת חיים. במקביל, שארל, וונדי ושליה מתעמתות נגד מלכת הלוחמים, דימריה. אף על פי שקיבלו עזרה מבעלת ברית ותיקה, דימריה מתגברת עליהן בקלות באמצעות הכוח שהסתירה בשרוולה.

ונדי נחושה להשתמש במיכל השלישי שלה כדי להביס את דימריה רבת העצמה, אך שימוש בטכניקה הזאת גובה מחיר כבד: היא לא תוכל להשתמש בקסם יותר. לאחר מכן, חבר אחר מ-12 הספריגנים תוקף לבדו את הבסיס של פיירי טייל.

ג'ייקוב משחרר את זעמו האמיתי אחרי שלוסי ונאטסו סכלו את התכנית שלו, ומתכוון לכוונו כלפי חברי פיירי טייל הכלואים במימד המקביל. במקביל, שדה הקרב שבעיר הנמל הרג'יאון נעטף באפלה מוחלטת כאשר יריב חדש נחשף.

ההיסטוריות של ניינהארט משנות את כל מאזן הכוחות בקרב על הרג'יאון. יריבים רבי עוצמה שבים מן העבר ונלחמים נגד חברי הגילדות שמנסים לשחרר את העיר. ארזה, שנאבקת בשלוש היסטוריות ביחד, מוצאת את עצמה משתוקת אל מול הכאב האיום שהיא מוכרחה לחוש בו פעם נוספת.

ברנדיש, לוסי, האפי ונאטסו יוצאים לנסות לנהל משא ומתן עם אוגוסט על בסיס הידיעה שאינם יכולים לנצח אותו בקרב. מתחת לגילדה, קאנה ממשיכה לנסות לחלץ את גופה של מייביס מהלאקרימה. בצפון, חברי סייברטות' ובלו פגסוס חוזרים לפעולה אחרי שגאג'יל, לוי, לילי, אלפמן, מירה וליסאנה הגיעו לחלץ אותם. למרות זאת, אין לדעת האם תוספת הכוח שפיירי טייל סיפקה תהיה מה שיעזור להתגבר על שלושת הספריגנים שהביסו ללא בעיה את הנמרים וסוסי השמיים.

גאג'יל ממשיך להילחם בכל כוחו בבראדמן כדי שלוי תפסיק לנשום ולספוג אל גופה חלקיקי חסימת קסם ותחילה נראה שידו על העליונה, אך לבראדמן יש עוד קלף בשרוול שעדיין לא נחשף. המשא ומתן שברנדיש מנהלת מול אוגוסט נגמר בדרך שאף אחד לא ציפה לה. איירין שנתקלה באקנולוגיה, מבינה במהרה שזה קרב אבוד מראש ונוקטת במהלך שישנה את כל כללי המשחק.

ה"יוניברס וואן" שאיירין הטילה שינה את הצורה של כל ממלכת פיאורה. מכשפי ישגאל מנסים להתאחד חזרה ולצאת מהבלבול שמהלך זה יצר. במקביל, מייביס נקלעת לצרה חדשה מיד לאחר שהיא שבה לצורה הגשמית שלה.

לאחר שמירה הביסה את שתי הילדות, איירין מגיעה בדיוק בזמן כדי להרוס לה את החגיגה. בינתיים, חברי פיירי טייל המפוזרים בכל רחבי יבשת ישגאל החדשה מנסים להגיע לגילדה כדי להגן על מייביס. מה שהם לא יודעים זה שצבא האויב מחכה להם שם בכל כוחו ועוצמתו.

להפתעת כולם, גילדארטס חוזר בדיוק בזמן כדי להתעמת עם גוד סרנה. נאטסו וחבריו ממשיכים להתקדם לכיוון הגילדה, אך השנים עשר המאוחדים עוד לא אמרו את המילה האחרונה שלהם בעניין.

אינבל השתלט על הדעת של גריי וג'וויה. למרות הקרבה שיש ביניהם, הוא מכריח אותם להילחם אחד בשנייה למוות. בשיא הקרב, ג'וויה מחליטה להקשיב לרגשות שלה כלפי גריי ומתנגדת בדרך שרק היא יכולה להתנגד.

בדיוק כשגריי מגלה מיהו אנ"ד, לוסי וברנדיש מתעמתות אחת עם השנייה. לוסי מנסה להימנע מקרב, אך ללא הצלחה. שתי הבנות אינן מוכנות להתפשר על עקרונותיהן והקרב שלהן מוביל למשבר חדש ובלתי צפוי.

נאטסו וגריי נלחמים ומוציאים אחד על השני את כל השנאה המוכלת בהם. במקביל, ארזה ושאר חברי הגילדה נאבקים על חייהם מול הצבא העצום של האויב לאחר שאיירין משתמשת עליהם בקסם מיוחד. אולם, מאקרוב עדיין לא אמר את המילה האחרונה שלו בעניין...

הדמעות של ארזה עוצרות את הקרב בין גריי לנאטסו. במקביל, הנותרים מהשנים עשר נלחמים ללא רחם - אוגוסט נגד קרים סורשייר וראקייד אשר מתקיף גם את אויביו וגם את חבריו.

סטינג מגיע לעזרת קאגורה והאחרים אשר נאבקים על שפיותם נגד המתקפות האכזריות של ראקייד. בינתיים, נאטסו מאבד את הכרתו ויוצא למסע בתוך ליבו. שם הוא נזכר בזיכרונותיו האבודים שמגלים לו את עברו.

סטינג שאב את הכוח של רוג ומצליח להמם את ראקייד עם שילוב הקסם הלבן וקסם הצללים. בתגובה, ראקייד משתמש בקסם החזק ביותר שלו - "נוח על משכבך בשלום". בינתיים, ארזה ואיירין נלחמות אחת בשנייה עד שאיירין מחליטה לגלות לה מה הקשר ביניהן.

איירין מספרת לוונדי וארזה על עברה. הסיפור מכיל את הסוד שעומד מאחורי הלידה של ארזה, מקור קסם קטילת הדרקונים, הקשר שלה לזרף והגורל האכזר שנגזר על משתמשי קסם קטילת הדרקונים. בינתיים, נאטסו ממשיך במסעו בתוך ליבו.

ארזה נלחמת באיירין בעזרת הכישופים של וונדי. בעיצומו של הקרב, איירין לפתע מגיעה לתובנה שתחרוץ את גורלה של וונדי.

איירין מזמנת את ה"דאוס סמה", כוח שחוצה את התפישה האנושית. ארזה מנסה להתמודד עם הקסם הזה, שמאיים על כל האנשים שבאזור, עם ידה הימנית בלבד. במקביל, נאטסו נאלץ להחליט החלטה חשובה ובלתי הפיכה שתשנה את העתיד שלו.

לאחר התבוסה של איירין, יבשת ישגאל חוזרת לצורה הנכונה שלה. דבר זה מכעיס את אוגוסט והוא מפנה את זעמו על מגנוליה וכל מי שנמצא בה. בינתיים, גריי מגיע לזרף וזוכה להיות הראשון ששומע מהי המטרה האמיתית שלו.

גריי מחליט להקריב את חייו ואת כל הקיום שלו במטרה לכלוא את זרף בקונכיית הקרח האבוד לנצח. בינתיים, אקנולוגיה סוף סוף מגיע למגנוליה וגורם לדאגה ולחשש לשני הצדדים הלוחמים.

אוגוסט מנסה להבין את האהבה שבן הורה לילדיו ומעמיד את קאנה בסכנת חיים כדי לבדוק איך גילדארטס, אביה, יגיב לכך. בינתיים, נאטסו וזרף ממשיכים להילחם אחד בשני עד שמישהו מגיע ומפריע לקרב שלהם.

ראקייד מתפתל מכאבים אחרי שזרף מסרב לקבל אותו כבנו. אוגוסט מתחיל להשתמש בקסם רב עוצמה שמאיים להרוס את כל ממלכת פיאורה, יחד עם עצמו. במקביל, וונדי וארזה כמעט מאבדות את חייהן בעימות נגד אקנולוגיה, עד שאדם מסוים נחלץ לעזרתן.

ארזה, וונדי וג'לאל פוגשים אישה מסתורית אשר רקמה תכנית שעשויה להביא לסופו של אקנלוגיה. במקביל, לוסי, גריי והאפי מנסים בכל כוחם להבין כיצד הם יכולים לעזור לנאטסו בעזרת הספר של אנ"ד שבידיהם, אשר מקושר אליו בקסם קישור חיים.

אנה, בלו פגסוס, ג'לאל, וונדי וארזה מנסים להעלים את אקנולוגיה בעזרת קרע שנוצר בזמן. במקביל, זרף סוף סוף מצליח לסיים את כל ההכנות שדרושות על מנת שיוכל לאפס את הזמן ולחיות מחדש את חייו הישנים, לפני שנהפך לבן אלמוות.

זרף משיג כוח של אלים שמתעלה אפילו על הזמן. נאטסו רותח מזעם בעודו מחזיק במייביס מחוסרת ההכרה. במקביל, אקנולוגיה ממשיך להתקיף את כריסטינה ונוסעיה בעוד שאנה מתקשה לפתוח מחדש את הקרע שבזמן.

פיירי טייל ובלו פגסוס ממשיכים להילחם באקנולוגיה. עכשיו כשהקרע שבזמן נפתח מחדש, הם חלקם נאלצים לקחת החלטה קשה. בגילדה, נאטסו מתרפא באופן פלאי ונלחם בזרף בפעם האחרונה בהחלט.

מייביס מתעמת עם זרף בתוך פיירי טייל. בעוד שהיא חושפת בפניו את הסתירה שברגשות שלה, זרף מבין משהו. במקביל, גריי, האפי, ולוסי ממשיכים להתעסק עם הספר של אנ"ד עד שהוא לפתע נעלם מידיהם...

זרף מת ואקנולוגיה כלוא בתוך הקרע שבזמן. בדיוק כשזה נראה שהכל נגמר, קרע משונה נפער בשמיים וכל קוטלי הדרקונים לפתע נעלמים.

הקרב של שבעת קוטלי הדרקונים נגד אקנולוגיה שעתיד לקבוע את גורל העולם מתחיל בתוך הקרע שבזמן. מחוצה לו, הגוף הגשמי של אקנולוגיה ממשיך לזרוע הרס. המצב נראה אבוד עד שלוסי עולה על תכנית מבריקה.

התכנית של לוסי לעצור את הגוף הגשמי של אקנולוגיה מלהרוס את העולם נכשלת אך המכשפים מסרבים לאבד תקווה. בתוך הקרע שבזמן, נאטסו ושאר קוטלי הדרקונים נלחמים מול הנשמה של אקנולוגיה.

נאטסו משחרר מכה אחת אחרונה אשר מכילה את כוחם של כל שבעת הדרקונים ומלאה ברגש של כל אנשי העולם, על אקנולוגיה. שנה לאחר מכן, לוסי מספרת כל מה שקרה לאחר סיום הקרב.