Um repórter de "The Weekly Sorcerer" vem entrevistar Fairy Tail. Cana diz a Lucy que ela terá um encontro fatídico.

O amor está no ar quando Lucy pensa que Natsu tem sentimentos secretos por ela. Enquanto isso, toda a guilda Fairy Tail é virada de cabeça para baixo, porque Juvia, que acredita que seu relacionamento não vai aonde, emprega ajuda mágica de uma poção do amor, que na verdade acaba sendo uma poção que faz a pessoa que a bebe pensar que a primeira coisa que eles ver é o seu rival; Juvia tenta usar Gray, mas erra várias vezes, fazendo com que todos na guilda tenham rivais.

Alguém segue Lucy há um tempo e toma cuidado. Ela descobre que seu perseguidor não é outro senão seu pai, que narra que Heartfilia Railways foi confiscada. Ele conta que foi a Lucy pedir 100.000 jóias, mas ela se recusa. Quando Lucy está prestes a decidir sobre um emprego, ela ouve os outros membros da guilda discutindo sobre um lugar chamado Acalypha, onde uma guilda comercial, Love e Lucky, está sendo realizada por um grupo de ladrões armados. Lucy lembra que seu pai mencionou a decisão de ir trabalhar em uma associação comercial em Acalypha, o que a deixa preocupada. Ela chega lá, na esperança de salvar seu pai. Com a ajuda de seus espíritos celestes, ela salva as vítimas dos ladrões, mas fica surpresa ao descobrir que seu pai não era uma das vítimas e só chegou depois que as vítimas foram salvas, pois ele teve que andar. O pai de Lucy pede desculpas a Lucy, lamentando o que ele havia dito no dia anterior, por pedir dinheiro a Lucy.

Fairy Tail está se juntando a outras guildas - Blue Pegasus, Lamia Scale e Caitshelter - para derrotar uma guilda sombria chamada Oración Seis. Essas quatro guildas enviarão membros para derrubar os seis membros da Oración Seis. De Fairy Tail, Natsu, Lucy, Gray e Erza são escolhidos. Eles são enviados para a casa do mestre Bob (do Blue Pegasus) para se encontrar com outros membros de outras guildas. Eles se encontram primeiro com os representantes de Blue Pegasus, os Trimens - Hibiki, Eve e Ren - e Ichiya. Depois, eles conhecem Lyon e Shelly, com quem brigaram antes, e Jura da Lamia Scale. O episódio termina com todos surpresos ao ver Wendy de Caitshelter, uma pequena garota que chega por último.

Wendy faz sua entrada, mas ela não está sozinha. Seu gato, Charle, chegou com ela, para o prazer de Happy. Os membros do Pégaso Azul explicam que o Oración Seis estava atrás de um feitiço extremamente poderoso selado em Worth Woodsea - O Nirvana.

Wendy é capturada pela Oración Seis, e também é Feliz! Erza está envenenada, e o veneno está se espalhando por seu corpo, o que acabará por levar à sua morte. Erza pede que seu braço seja cortado, mas Charle diz que Wendy pode salvá-la. Acontece que Wendy é a Sky Dragon Slayer, que tem poderes de cura. Os representantes pretendem salvar Wendy e Happy, a fim de poder curar Erza. Oracion Seis pretende usar o poder de cura de Wendy para ressuscitar uma certa pessoa. Lucy fica para trás com Hibiki para cuidar de Erza, enquanto os outros partem para resgatar Happy e Wendy. No caminho, Natsu, Gray e Charles estão cercados por Naked Mummy, que trabalha para a Oracion Seis, e precisam derrotá-los. Wendy recebe ordens para reviver uma certa pessoa, e essa pessoa é ... Jellal!

Natsu e Gray enfrentam a guilda Naked Mummy. Enquanto isso, Wendy é instruída a reviver Jellal, a quem ela "deve sua vida". Wendy, apesar de ter ouvido falar das más ações de Jellal antes, não acredita nelas. Em vez disso, ela decide ressuscitar Jellal, quem salvou sua vida.

Hibiki consegue se comunicar com Natsu através de sua magia, Archive, e informa como chegar aonde Erza está. Enquanto isso, Gray está tendo problemas para derrotar Racer e seu Dead Grand Prix, uma tonelada de motocicletas mágicas. Gray entra em uma das motos e inicia uma batalha de corrida com Racer.

Jura começa uma batalha com o Olho Quente do Olho Celestial, e Wendy acorda e cura Erza. Enquanto isso, Cobra segue Jellal, sendo incapaz de ler sua mente, para ver que Jellal encontra o Nirvana. Natsu corre para encontrar Jellal, determinado a não deixá-lo conhecer Erza. Erza ouve o nome "Jellal" e sai sozinha sem que os outros saibam.

Embora Angel seja derrotado, Lucy e Natsu acabam caindo em uma cachoeira gigante; quando recuperam a consciência, são atacados por Sherry, que é interrompida por Gray e Lyon. Wendy revela a Charle seu passado sobre Jellal e como ela veio para Cait Shelter. Enquanto isso, Erza encontra um Jellal amníaco no local do Nirvana; Jellal revela que colocou um feitiço autodestrutivo no Nirvana, que Oración Seis mage Cobra é incapaz de dissipar. Vendo a dor que causou a Erza, Jellal coloca uma magia autodestrutiva sobre si mesmo.

Brain consegue ganhar o controle do Nirvana e ativa seu segundo estágio - um monstro que começa a marchar em direção a Cait Shelter, fazendo com que Natsu, Gray, Lucy e Happy se apressem e o derrotem. Quando Natsu e Happy tentam avançar, eles são forçados a uma batalha aérea contra Cobra. Enquanto isso, Erza salva Jellal e o convence a viver para o futuro, e eles começam a planejar um plano para destruir o Nirvana.

Como Cobra pode prever todos os seus movimentos, Natsu não pode ganhar vantagem até que ele lute instintivamente. Quando Cobra usa sua nova geração "envenenando" a magia de matar dragões, Natsu perde sua mobilidade, mas vence a batalha com um rugido ensurdecedor.

Jura mostra seu verdadeiro poder e mostra por que ele é um dos dez santos bruxos. Ele luta com Brain, o líder de Oracion Seis e em uma curta batalha o derrota. Por outro lado, Hot-Eye está vencendo sua batalha contra a Meia-noite e logo o vence completamente. Quando Brain está prestes a cair inconsciente, ele pensa em sua oração - para que Midnight nunca desapareça. E com essa meia-noite é mostrado para ser revivido e depois esmaga Hot-Eye em um instante dizendo que a magia não o afeta. Natsu e os outros se perguntam como eles serão capazes de impedir o Nirvana de seguir em direção a Cait Shelter.

Meia-noite luta uma batalha com Erza e Jellal; sendo enfraquecido pela magia da destruição, Jellal perde a luta facilmente. Depois de inicialmente ficar impressionado, Erza descobre a verdadeira forma da magia da Meia-noite e se prepara para lutar com ele novamente. Enquanto isso, Wendy procura por Jellal para encontrar as informações necessárias que ajudarão Natsu e os outros a parar o Nirvana.

Erza consegue superar a magia ilusória de Midnight, enquanto Natsu, Gray, Lucy e Happy enfrentam a equipe de Brain, Klodoa. Percebendo a derrota da Meia-noite, Klodoa explica que o Cérebro tem uma personalidade destrutiva alternativa chamada Zero, que foi mantida selada pelos membros da Oración Seis usando a magia do vínculo corporal. O selo é liberado e Zero surge e derrota Natsu, Gray, Lucy e Happy com facilidade. Erza, Jellal, Wendy e Charle se apressam quando Zero inicia o Nirvana para disparar contra Cait Shelter.

Quando Zero dispara contra o Nirvana, Christina, navio do Blue Pegasus, mantido por Lyon, Sherry e Ren, destrói uma das pernas do Nirvana e faz com que ele erre. Hibiki transmite os detalhes do plano para parar o Nirvana: em 20 minutos, as seis pernas do Nirvana devem ser destruídas ao mesmo tempo. Como Natsu vai para o primeiro Lacrima para lutar contra Zero, Jellal o segue depois de recuperar parte de sua memória.

Tendo dito a Wendy para destruir o sexto Lacrima em seu lugar, Jellal aparece no primeiro Lacrima e dá a Natsu a "Chama da Culpa". Natsu consome a chama e entra em Dragon Force para sua luta contra Zero e eles aumentam o poder para o golpe final. Enquanto isso, todos alcançam seus respectivos destinos e esperam o momento certo para atacar.

Enquanto todos juntam suas forças para o golpe final, Natsu é consumido pelo ataque de "Genesis Zero" de Zero. Enquanto ele flutua no mundo do nada, a voz de Igneel fala com ele e ele se liberta, derrotando Zero e consegue destruir as pernas do Nirvana junto com seus aliados, resultando na destruição do Nirvana.

Agentes do governo enviados para o local da prisão preventiva do Nirvana em Jellal; enquanto todo mundo resiste, Erza os interrompe e pede aos oficiais que levem Jellal embora ela esteja devastada com o resultado. Enquanto todos se recuperam em Caitshelter, é revelado que toda a guilda era uma ilusão criada pelo espírito de seu mestre da guilda por causa de Wendy. Com a destruição do Nirvana, o espírito cumpriu seu propósito e Caitshelter desapareceu. Como Wendy é deixada para trás chorando, Erza a convida para se juntar à Fairy Tail.

Depois de se despedir da Aliança, o grupo volta para Fairy Tail, onde Wendy e Carla recebem calorosamente sua nova guilda. Erza encontra um mago com Requip magia semelhante à dela, enquanto Gray diz a Natsu que uma mulher chamada Daphne diz que conheceu um dragão. Quando Natsu e Wendy vão para a pousada onde ela mora, eles são pegos em uma armadilha organizada por Daphne. Depois de tentar escapar, Gray de repente entra e desafia Natsu para sua luta final.

Gray e Natsu estão lutando com todo seu poder, enquanto todos na Fairy Tail começam a se preocupar. Quando Erza e Lucy decidiram ir e encontrar seus amigos, eles encontraram bestas que imitam suas habilidades. Quando Natsu é finalmente capturado, Daphne revela um dragão feito à mão, projetado para drenar o poder de Natsu.

Enquanto Daphne absorve o poder mágico de Natsu, Erza está lutando contra cópias de si mesma em diferentes armaduras em forma de monstro. Elfman, Wakaba e Macau vêm e batalham suas cópias também. Natsu se lembra de uma voz fraca. Ele se lembra de como prometeu uma cidade para matar ou derrotar alguém que controla dragões. Sabendo disso, ele estourou um rugido alto. Gray foi chamado para o quarto do mestre porque traiu Fairy Tail. Todos os membros da cauda de fadas ajudam a destruir o dragão quando Natsu tomou sua decisão, ele planeja morrer com o dragão.

Enquanto Natsu ainda estava dentro do dragão artificial, Fairy Tail tinha o dilema de salvar Natsu ou impedir que Magnolia fosse destruída. Enquanto isso, Mestre Makarov confrontou Gray por que ele havia traído Fairy Tail, mas Gray revelou suas razões para o ato e Mestre Makarov deu a ele o plano de salvar Natsu e Magnólia.

A equipe Natsu, juntamente com Wendy e Charle, está em uma missão nas montanhas. Por causa da neve, Lucy pega um resfriado e ela não pode assistir a flores anuais da Fairy Tail. Natsu não se diverte por causa disso e ele e Happy desenrolam uma das cerejeiras para que Lucy possa vê-la.

Wendy se acostumou a fazer trabalhos na Fairy Tail e quer tentar algo maior para poder ajudar mais a todos, mas entra em uma discussão com Carla.

A corrida de 24 horas começa quando todos os membros da Fairy Tail correm para obter Wyvern Scales do topo do Monte. Ivor. Não há desistência e nenhuma Magia Voadora é permitida, então Happy está em uma posição difícil, mas isso o impede de vencer. Natsu, Jet Gray e Gajeel perdem e têm que fazer fotos embaraçosas para o Weekly Sorcerer por duas semanas como punição! E Happy é esmagado pelo fato de que seu prêmio é um brinde de alegria e a honra de vencer.

Gildarts finalmente voltou a Fairy Tail após uma missão de cem anos e tem notícias para Natsu sobre Igneel.

Wendy finalmente conhece Mystogan, que ela havia conhecido como Jellal em sua infância. Ele a alerta sobre a Anima, mas quando Wendy tenta avisar Fairy Tail sobre a destruição de Magnólia, a luz brilha do céu e a cidade desaparece. Wendy descobre que Natsu, Happy, Charle e ela mesma são os únicos que restam.

Sabendo que todos os membros da Fairy Tail desapareceram, Natsu, Happy, Wendy e Charle foram para Edolas usando os traços restantes da Anima. Eles finalmente entraram em Edolas, vendo um cenário muito diferente. Depois de um tempo, eles finalmente encontraram uma guilda Fairy Tail. No entanto, o que encontraram não é o mesmo que imaginavam.

Natsu, Wendy, Happy e Carla estão assustados com a Lucy de Edolas, até que ela confunde Natsu por sua contraparte de Edolas e o cumprimenta - com vários movimentos de luta. Todo mundo é muito diferente ... mas onde está Erza? Por que esta Fairy Tail está nessa corrida? E quem é o caçador de fadas?

Após uma fuga por pouco de Erza Knightwalker, o grupo de Natsu decide ir à capital de Edolas por conta própria para salvar seus amigos, apesar dos avisos da Fairy Tail de Edolas. No entanto, eles logo se vêem guiados por Lucy Ashley, a colega de Lucy em Edolas, e Natsu e Wendy ficam chocados ao descobrir que sua mágica não funciona em Edolas.

Na capital, Natsu e Wendy ficam surpresas ao encontrar sua Lucy viva e totalmente capaz de usar sua mágica. Depois que Edolas Lucy e Lucy da Terra da Terra se conhecem, o grupo de Natsu escapa do Exército Real e se refugia em um hotel. Quando seu plano de esgueirar-se a bordo de um dirigível do Exército Real falha, eles são salvos pela chegada oportuna do motorista de um veículo de quatro rodas - a versão Edolas do Natsu.

Terra da Terra Lucy, Natsu, Wendy, Charle e Happy chegam à Cidade Real, onde encontram um Lacrima feito da energia mágica da Magnólia. Para salvar seus amigos, Charle revela que ela tem informações sobre Edolas fluindo em sua cabeça desde que chegaram, e o grupo planeja um plano baseado em se aproximar do rei de Edolas e fazer com que Lucy use Gêmeos para aprender a transformar o Lacrima de volta. . Seu plano é frustrado quando eles são emboscados por Erza Knightwalker, cujas forças exaltam Happy e Charle como seres conhecidos como "Excede".

Como Natsu e Wendy são assassinos de dragões, eles são presos e descobrem um segredo sobre o Exceed. Happy e Charle são levados para Extalia, a casa dos Exceed, e aprendem a verdadeira razão pela qual eles foram enviados para a Terra da Terra em primeiro lugar. Enquanto isso, Edolas Gajeel planeja uma distração para que Earthland Gajeel possa tentar destruir a lacrima que mantém seus amigos.

Depois de ouvir a verdade sobre sua missão, Happy e Charle fogem do reino e acabam com dois gatos misteriosos, Lucky e Marl, cujo ovo foi levado pela rainha para ser usado no Projeto de Extermínio do Extermínio do Dragão. E os corações de Happy e Charle foram abalados pelo reino e pelo que eles pensam que haviam feito. Happy e Charle encontram força em seus próprios corações para salvar seus amigos? Está implícito que Lucky e Marl são realmente os pais de Happy.

Feliz e Charle correm de volta à cidade para salvar seus amigos. Enquanto isso, Lucy está presa e pede a Erza Knightwalker que a deixe ir e salve seus amigos. O Edolas Erza tenta matar Lucy, deixando-a cair da torre com sua lança. Mas Happy e Charles salvam Lucy de sua queda. Charles descobre a localização de Natsu e Wendy. O rei louco por magia ativa o Código ETD (Exceda a destruição total) nos excede que estavam atrás de Charles e Happy, transformando-os em lacrima. Erza emboscou os três, mas Earthland Erza e Gray intervêm para salvar seus companheiros.

Gray, Lucy e Charle foram resgatar Natsu e Wendy, enquanto Terra da Terra Erza segurava Erza Knightwalker. Happy foi buscar Gajeel para que ele pudesse resgatar o resto dos membros da Fairy Tail que foram transformados em lacrima. Em Edolas, o poder do Dragon Slayer é capaz de fazer isso. Aparentemente, o rei planeja usar a lacrima flutuante como uma bomba para destruir Extalia. Após o resgate dos Dragon Slayers, Wendy e Charle foram a Extalia para avisar os Excede sobre o perigo que está prestes a ser trazido. Enquanto procuram pelo rei, Natsu, Gray e Lucy são interceptados por Hughes e Sugarboy. Enquanto isso, Gajeel está sendo impedido por Panther Lily.

Natsu, Gray e Lucy se envolvem em uma batalha para salvar os amigos e os Exceed de serem destruídos contra os capitães do Exército Real, Hughes e Sugarboy, e o Chefe do Estado Maior do Exército Real de Edolas, Byro. Coco rouba a chave do Dragon Chain Cannon, a arma necessária para fundir a ilha lacrima com Extalia. Enquanto Lucy pensava que ainda era perseguida por monstros, ela e Coco se chocavam. Coco pensa duas vezes se dá a chave para Lucy ou não. Byro persegue Coco e diz a ela para lhe dar as chaves. Para a confusão de Lucy, ela pensou que ele queria suas chaves. Ela então se envolve em uma batalha contra Byro.

Depois que Lucy chama vários espíritos seguidos para lutar com Byro, sua magia é rapidamente drenada, embora Virgem dê a Lucy um chicote do Mundo Espiritual que pode se estender e contrair para ajudar na luta. Quando Byro é derrotado pela chegada oportuna de Natsu, Coco dá a chave para Lucy, mas é roubada por Sugarboy, forçando Gray a persegui-lo.

Gray derrota Sugarboy e destrói a chave depois de aprender seu objetivo, pois ele pode criar outra chave a partir do gelo. No entanto, Erza Knightwalker captura Gray e Natsu e os traz diante do rei, a quem ela rapidamente se torna refém, revelando-se como Erza Scarlet. O plano de Erza para forçar os guardas a redirecionar o canhão dá errado quando o verdadeiro Erza Knightwalker aparece.

A rainha do Exceed revela que sua imagem divina era uma mentira perpetuada pelos Anciões para proteger o Exceed dos humanos, mas sua força interior convence o Exceed a tentar salvar Extalia com sua própria força. Quando o lacrima desaparece subitamente, Mystogan chega para explicar que ele restaurou Magnólia e agradece à Pantera Lily por salvar sua vida, enquanto Lily revela que Mystogan é o príncipe Jellal de Edolas.

Os magos da Terra da Terra conseguem impedir a extinção de Extalia, mas a batalha ainda não acabou. Erza Knightwalker lidera uma emboscada pelo Exército Real de Edolas, enquanto o rei Faust desencadeia um dragão mecânico superpoderoso, Dorma Anim. Os Assassinos do Dragão enfrentam o rei, Erza Scarlet enfrenta Knightwalker, os outros lutam contra o exército enquanto Mystogan e Pantherlily cuidam de outros assuntos.

As batalhas contra o Reino Real Edolas continuam. O exército, Knightwalker e o próprio rei estão todos lutando contra os Magos da Terra que desejam recuperar seus amigos. Enquanto isso, Edolas Fairy Tail tenta chegar a uma decisão de qual lado eles escolherão.

No meio da exaustiva batalha entre o exército de Edolas e os membros de Fairy Tail nos dois mundos, os combatentes de Edolas entram em pânico ao perceber que sua mágica está desaparecendo graças a Mystogan, que inverte a Anima. No entanto, para garantir a estabilidade de Edolas, Mystogan se declara vilão de Edolas e ordena que Pantherlily o mate e surja como um herói entre o povo.

Por devoção, Pantherlily se recusa a aceitar o plano de Mystogan, mas logo eles descobrem que Natsu, Wendy e Gajeel capturaram o rei Faust e começaram um tumulto. Quando Mystogan confronta Natsu e o derrota, Mystogan revela ser o príncipe de Edolas para o povo. Enquanto o Anima invertido leva todos os magos da Terra e o Exceed to Earth, todos se despedem enquanto Mystogan fica para trás, anunciado como o novo líder de Edolas.

Na Earthland, a rainha do Exceed revela que os ovos do Exceed foram enviados à Terra para salvá-los depois que ela previu que Extalia cairia; Charle, possuindo os mesmos poderes, confundiu essas visões como missão. Quando o Exceed sai para encontrar os ovos restantes, a Pantera Lily fica para trás como parceira de Gajeel e para honrar a dedicação de Mystogan à Fairy Tail. No entanto, a Pantera Lily lhes trouxe um cativo incomum: Lisanna, que explica que ela é realmente a Lisanna da Terra da Terra.

O resultado das aventuras de Natsu e de seus amigos em Edolas é revelado: Edolas Fairy Tail se aproxima do reino para ajudar a reconstruir a cidade destruída, enquanto Mystogan bane o arrependido Fausto e condena os demais membros do Exército Real para ajudar na reparação da cidade. . Na Terra da Terra, Lisanna retorna à Fairy Tail da Terra, enquanto Natsu e seus amigos contam aos outros membros da guilda sobre suas aventuras em Edolas. Enquanto isso, um jovem de cabelos pretos é mostrado vivendo em uma floresta, onde ele faz com que todos os seres vivos ao seu redor morram contra sua vontade, e diz que quer ver Natsu.