여기는 닌자의 나라 나뭇잎 마을. 닌자 학교의 낙제생 소년 나루토는 오늘도 장난이 한창이다. 그리고, 또다시 졸업시험에 낙제해 버린다. 그러던 어느날, 마을의 영웅인 초대 호카게가 남긴 봉인의 서를 도둑맞는 사건이 발생했다!! 범인은 나루토였지만…

나뭇잎 마을의 대표는 대대로「호카게」라는 이름으로 불리고 있다. 현재 호카게는 3대. 그리고 이 3대 호카게 에게는 코노하마루 라고하는 손자가 있다. 우여곡절끝에 닌자 학교를 졸업할 수 있던 나루토가 닌자 등록서를 제출하러 갔을 때, 코노하마루와 마주치게 된다. 코노하마루는 곧바로 나루토를 「두목」이라고 부르더니, 마음대로 뒤를 따라 다니기 시작한다. 그것은, 나루토만이 코노하마루를 「호카게의 손자」로서 특별 취급 하지 않았기 때문이다. 그리고 코노하마루는, 어서 빨리 호카게가 되어 모두에게 인정할 수 있는 닌자가 되고 싶다고 생각하고 있었지만…

드디어 닌자가 된 나루토는, 새로운 수업을 위해 3인 1조가 되었다. 나루토와 같은 조가 된 것은, 「하루노 사쿠라」와「우치하 사스케」. 나루토는 귀여운 사쿠라를 좋아하고 있지만, 그 중요한 사쿠라는 사스케에게만 열중한다. 게다가 사스케는 나루토와 다르게, 쿨하고 멋질 뿐만이 아니라 실력도 뛰어난 엘리트. 이에 심술이 난 나루토는, 사스케를 골탕먹이려고 뭔가를 준비하는데.......

3인 1조로 팀을 짜게 된 나루토, 사스케, 사쿠라. 이들을 지도하기위해 새로운 선생님, 「하다케 카카시」가 왔다!! 어딘가 수상한 카카시는, 첫날부터 지각을 한다. 게다가 나루토가 설치해 놓은 장난에 간단하게 걸려 버릴 정도로 수상한 냄새가 풀풀~ 그런데 그 카카시가 갑자기 어려운 수련을 나루토들에게 내놓는다. 그것은, 셋 중 한명 밖에 합격할 수 없다고 하는 「서바이벌 연습」이었다!? 게다가 이 시험에 떨어지면 다시 학교로 되돌아가게 된다니!!?

카카시가 내놓은 수련은 굉장한 것이었다. 그리고, 나루토들을 상대하는 카카시는 지금까지와는 완전히 다른사람!? 온 힘을 다해 달려드는 나루토를 가볍게 다루고, 학교 제일의 엘리트인 사스케조차도 당해 낼 도리가 없다. 사쿠라는 이미 말 다했다! 상급닌자인 카카시의 진정한 실력 앞에, 하늘과 땅 정도의 차이를 느껴 어찌할 방법이 없는 셋. 이대로는 셋다 전원 학교로 돌아가게 되어 버린다! 서두르기 시작하는 나루토들이었지만, 실은 카카시는 이 수련 안에 숨겨져있는 중요한 일을 모두에게 깨닫게 하려는 것이었는데…

드디어 첫번째 임무를 맡게 된 나루토들. 그러나 그 임무 라는 것은, 잃어버린 고양이를 찾아주는 등등 따분한 일들 뿐이었다. 차츰 불만이 쌓이는 나루토는, 마침내 3대 호카게 앞에서 때를쓰기 시작한다. 토라진 나루토에게 조금 당황한 호카게 였지만, 나루토의 의지를 느끼고는 보다 중요한 임무를 내리기로 한다. 새로운 임무는, 타즈나 라고 하는 인물을 조국의 「파도의 나라」까지 호위 하는 것. 첫 본격적인 호위 임무에 의욕이 넘치는 나루토였는데......

파도의 나라에 가까스로 도착한 나루토들은, 이 나라가 가토라고 하는 악덕 상인에게 지배되고 있는 것을 알게된다. 방금전의 추격자도, 타즈나의 생명을 노린 가토가 보낸 자객이었던 것이다. 게다가, 다음에 나타난 적은「무음살인술의 달인」이라고 불리는 안개마을의 탈주닌자 모모치 자부자. 생각치 못한 강적 출현에 흥분하는 나루토! 하지만 그런 나루토에게 카카시는 아까와는 비교도 안될만큼 강한 상대라며 물러서게 한다. 평상시와는 다른 모습의 카카시에게 보통이 아닌 살기를 느끼는 나루토들···!

자부자의 뒤를 노린 카카시! 마침내 자부자의 목에 쿠나이를 들이댄다. 배후로부터 자부자을 막은 카카시의 승리는 틀림없는 것으로 생각되었다. 그러나, 이 자부자의 육체는 또 「물 분신술」에 의해서 만들어진 가짜였다! 한순간에 형세는 역전, 이번에는 카카시가 자부자에게 몰려 「물감옥」에 갇혀 버린다. 이미 타즈나를 지키는 것은 나루토들 3인뿐, 게다가 나루토와 사스케의 공격도 전혀 통하지 않는다. 압도적인 힘의 차이에 당하기만 하는 나루토들은 패닉이 되어 도망치려고 한다. 그러나 왼손의 맹세, 두 번 다시 도망치지 않겠다고 한 일을 생각해 내어 용기를 내는 나루토였다.

나루토의 작전에 의해 물감옥이 깨져 자유롭게 된 카카시가 다시 자부자를 공격한다. 마침내 사륜안의 진정한 힘이 발휘될 때가 온 것이다! 카카시는 자부자의 기술을 한순간에 카피해, 자부자를 쓰러트린다. 자신의 행동의 모든 것을 읽어낸 자신의 기술로, 그것도 수배의 파괴력을 가지는 카카시의 공격에 의해 중상을 입은 자부자. 마지막으로 끝을 내려는 그 순간. 어디선가 갑자기 날아 온 철침이 자부자의 목을 관통하고...!!

간신히 타즈나의 집에 도착한 나루토들. 사륜안을 사용했기 때문에 힘을 소진한 카카시는 당분간은 꼼짝 못하게 되었지만, 자부자을 쓰러뜨렸다는 사실이 나루토들에게는 안도감과 여유를 주었다. 그러나, 냉정한 카카시에게는 하나의 의문이 있었다. 본래의 헌터닌자 라면, 죽인 상대를 그 자리에서 흔적도 없이 처리 할텐데, 왜 그 소년은 자부자의 사체를 가지고 돌아갔지...? 라고...

타즈나와 함께 파도의 나라의 거리에 나간 사쿠라는, 가토에 의해서 사람들의 생활이 몹시 괴롭힘 당하고 있는 것을 알게된다. 그러한 이유로 타즈나는, 바다를 건너는 다리를 건설하려고 목숨을 걸어 노력하고 있는것이었다. 이 다리가 생기면 해운 교통을 지배하는 가토로부터 사람들을 구해낼 수 있다고 굳게 믿으면서.... 한편 나루토와 사스케는 카카시가 낸 과제, 차크라를 이용한 나무 타기 수업에 여념이 없었다. 그날의 수련을 마치고 타즈나의 집에 돌아온 두 사람은 너덜너덜. 그런 두 사람을 차갑게 바라보는 아이 이나리는, 나루토에게 「가토에게 이길 수 있는 날은 오지 않는다」라고 해 버리는데...

차크라를 컨트롤하기 위한 수업에 돌진하는 나루토의 앞에, 수수께끼의 인물이 모습을 나타냈다. 「소중한 것을 지키기 위해서는 어디까지나 강하게 될 수 있다」라고, 말하는 인물. 그것은, 나루토가 가슴속에 품고있던 것과 완전히 같은 기분이었다. 서로 어딘가 공감하는 두 사람. 하지만 그 이상은 말하지 않고, 어딘가로 사라져 갔다. 그 인물은 누구인가?　그리고, 무엇 때문에 나루토에게 나타난 것 일까!?

마침내 자부자와의 재결전의 날이 찾아 왔다. 게다가 요전날의 「가면의 소년」도 자부자과 함께 나타났다. 자부자들은 사스케를 보고 한눈에 그 실력을 깨닫고 사스케 또한 가면의 소년이 보통 사람은 아닌 것을 실감하게 된다. 그리고, 마치 서로의 힘에 이끌리는 것 처럼 사스케와 소년이 전투를 개시한다. 그 시각, 가토의 부하가 츠나미를 인질로 하려고 타즈나의 집으로 찾아오고 있었다. 악당들이 엄마를 데려갈 것 같지만 공포에 질려 무서워만 하는 이나리. 그러나 나루토의 말을 떠올려, 이나리는 용기를 내어 악당들에게 향한다.

카카시는 알고 있었다. 「닌자」에게 가장 필요한 「실전」의 경험이 없는 지금의 나루토들에게는, 자부자과 함께 몇번이나 죽음의 선을 넘어 온 하쿠를 쓰러뜨릴 힘이 없다는 것을… 시간이 얼마 남지 않은 것을 깨달은 카카시는, 자부자를 쓰러뜨리기 위해서 다시한번 사륜안을 사용할 결심을 한다. 그러나, 자부자는「사륜안은 이제 통하지 않는다」라고 말한다! 자부자 또한 수많은 아수라장을 빠져 나온 닌자! 한 번 본 사륜안에 대항하는 방법을 벌써 마련해 놓았던 것인데.....!?

하쿠의 마경빙정에 의한 공격을 계속 받는 나루토와 사스케! 나루토는 벌써 일어서는 것도 할 수 없게 되었다. 그러나 사스케는 이 싸움 중에 자신이 가지고 있는 「사륜안」의 능력에 눈을 떠, 조금씩이지만 확실히 하쿠를 공격하고, 방어도 할수 있게 되었다. 그것을 눈치챈 하쿠는, 사스케가 싸우면서 자신의 능력에 눈떠 가는 것에 놀란다. 그리고 이대로 장기전이 되면 사스케에게 유리하다고 판단해, 단번에 승부할것을 결심하는데…

마침내 나루토가 각성 했다! 적에게 공격당해 사스케가 쓰러졌다는 것에대한 분노가 봉인되어 있던 구미호의 능력을 깨워버린 것이다. 나루토의 굉장한 차크라는 밖에서 싸우던 카카시와 자부자에게도 느껴질만큼 강력한 것이었다. 나루토의 압도적인 힘 앞에 꼼짝없이 쓰러지는 하쿠. 패배를 깨닫은 하쿠는 나루토에게 자신을 죽여달라고 부탁한다. 이기는 것만이 자부자의 기대에 부응하는 것이고 하는 하쿠는 나루토에게 진 지금, 자신의 가치가 없어진 것을 알고 있었던 것이다...

하쿠는 망설이고 있는 나루토에게 계속 자신을 죽여줄것을 강요한다. 하지만, 싸우는 것, 이기는 것만이 자신의 존재 이유라고 하는 하쿠 생각에 나루토는 격렬한 의문을 가진다. 그것이 닌자의 길이라고 하는 것을 알고 있지만… 그 무렵, 자부자과 카카시의 싸움도 마지막을 맞으려 하고 있었다.

하쿠를 생각하며 치미는 분노를 이기지 못해 자부자를 추궁하는 나루토. 그런데 아무것도 느끼고 있지 않는 것처럼 보이는 자부자 였지만, 실은 눈물을 흘리고 있었다. 말과는 반대로 자부자는 하쿠를 누구보다 소중히 생각했다. 마음을 기댈수 있는 단 한명의 존재였던 하쿠를 잃은 자부자의 분노와 슬픔은 매우 큰 것이었다. 그리고, 이 비정함 이야말로 닌자의 숙명인 것을 나루토는 알게된다.

파도의 나라로부터 돌아온 나루토들. 주어진 임무를 해내고 있는 그들이었지만, 나루토는 그런 날에 불만 투성이. 처음으로 마을을 벗어나, 자부자 · 하쿠와의 사투를 격음으로 성장한 나루토들은, 지금부터 스스로가 부딪혀 가지 않으면 안 되는 세계가 매우 넓고, 또 강적이 얼마나 많이 있을까를 피부로 느꼈던 것이다. 「이런 임무만 해서는 전혀 강하게 될 수 없어―…」라고, 초조해하는 나루토. 하지만 그 때, 나뭇잎 마을에 속속 다른 마을의 닌자들이 모이고 있었는데...

나뭇잎 마을에서도「중급닌자시험」에 나갈 닌자들을 뽑게되었다. 그리고 그 중에는 나루토, 사쿠라, 사스케들도 포함되었다. 하지만, 나루토들의 참가에 이루카가 강하게 반대한다. 아직 나루토들은 너무 어린데다가 경험·실력 모두 너무 미숙하다는 것이다. 똑같이 신인이면서 참가하는 팀에는 지난회 시험도 넘겨버리고, 그 사이에 충분한 실력을 단련해 온 팀도 있을 정도다. 간단하게는 합격할 수 없다… 그것을 이루카는 잘 알고 있었던 것이다. 「나루토들의 가능성을 부수어 버릴 생각인가!?」라고, 이루카는 카카시에 묻는다. 그러나 카카시는 「그들은 충분히 성장했다」라고 단언하는데…

중급닌자시험에 임하려고 하는 나루토·사스케·사쿠라의 3인의 앞에, 바가지 머리의 송충이 눈썹「록·리」가 나타났다! 리는 사스케에게 돌연「승부하지 않겠습니까?」라고 대련을 요청. 우치하 일족의 능력을 가진 사스케에게 전의를 불 태우는 리! 그리고 사스케는 리의 도전을 받아 들인다!

중급닌자 시험장으로 향하는 나루토, 사스케, 사쿠라 3인. 사실 이 시험은 3인이 1조가 기본으로, 누군가 하나라도 빠진다는 것은 시험을 볼 기회도 없다는것. 동료와의 팀워크가 지금보다 중요하게 된다. 교실에 들어서자 벌써 많은 수험생들이 있었다. 분위기에 압도되는 나루토들. 그들 역시 자신만의 꿈을 가지고 이 장소에 와있는 것인데....

제1시험의 필기시험에 임하는 나루토들! 제1시험의 시험관 모리노 이비키는, 고문과 심문의 프로라는 명칭 답게 얼굴에는 그의 과거를 짐작하게 하는 많은 상처를 지닌 특별상급닌자였다. 금새 긴장하는 수험생들. 그리고 이비키로부터 이 시험의 방식이 설명되었다. 문제는 10문제. 모든 문제가 정답이라면 10점으로, 하나가 틀릴 때 마다 １점씩 감점된다. 합격인지 불합격인지는 팀 3인의 합계로 결정되지만, 컨닝에 적발된 사람이 있으면 팀 전원이 불합격이 된다고 하는데.....

제1시험은 수험생들의 「정보 수집 능력」을 조사하기 위해서 행해지고 있었다. 시험관들에게 들키지 않게 컨닝을 하여 시험을 보는 것이었던 것! 그리고 드디어, 제1시험 최대의 난문인 제10번 문제. 만약 이 문제를 틀리게 되면, 제1시험에 불합격이 될 뿐더러 지금부터 평생 중급닌자 시험의 수험 자격까지 잃는다고 하는데...!!

나뭇잎의 마을 3대 호카게 의 손자인 코노하마루가, 중급 닌자 선발 시험의 회장에 나타났다. 닌자 아카데미의 학급 신문에서 중급 닌자 시험의 특집 기사를 맡아, 친구들과 함께 취재하러 왔던 것이다. 나루토들에게의 인터뷰를 하는 형식으로 지금까지의 그들의 활약을 정리하는 장!!

중급닌자 선발 시험, 제2시험의 시험장 「죽음의 숲」에 온 나루토들과 수험자 일동. 시험관인 앙코가 시험 내용을 설명하지만, 무려 그 내용은 서바이벌게임이었는데.....

「죽음의 숲」에서 제2시험이 시작되었다! 소변을 보고 숲에서 나온 나루토를 난데없이 쓰러뜨리는 사스케. 사스케는 적이 나루토로 변신한 것을 알고 있었던 것! 상대를 몰아넣는데 성공했지만 놓쳐 버린다. 그리고 3인은, 뿔뿔이 흩어지게 되었을 때를 위해서 암호를 정한다. 그 때, 나루토들은 또 다시 습격 당해 또 나루토만 멀리 떨어지는데…

사스케와 사쿠라의 위기에 순간 나타난 나루토!! 하지만 사스케는 그런 나루토가 도움이 되지 않을거라고 판단해, 두루마기를 상대방에게 주려고한다. 이에 나루토는 불같이 화를 내며 두루마기를 낚아채고 말한다. "지금의 사스케는 가짜야! 내가 아는 우치하 사스케라는 녀석은 이렇게 멍청한 겁쟁이가 아니야!!"

쓰러진 나루토 앞에서 다시한번 마음을 다잡는 사스케. 비슷한 시각 제 2의 시험관 앙코는 "그"가 돌아왔음을 알아채고 서두르고 있었다. '오로치마루'란 자는 사스케의 혼연의 일격에도 불구하고 상처하나 없는 모습으로, 사스케의 몸에 표식을 남기고 사라진다. 극심한 고통으로 정신을 잃은 사스케와 나루토. 그리고 홀로남은 사쿠라는.....

밤을 지새며 나루토와 사스케를 지키고 간호하는 사쿠라. 그런 그들을 노리는 세개의 그림자가 있었으니... 같은 시각 송충이 눈썹 록리의 팀도 움직임을 개시하고! 점점 지쳐가는 사쿠라에게 소리마을의 세 닌자가 나타난다! 만들어둔 함정들도 간파당하고 위험에 빠진 사쿠라앞에 나타난 그사람은!?

사쿠라를 지키기위해 힘을 다했지만, 꼼짝없이 당해버린 리… 항상 나루토와 사스케의 뒷모습만을 보며 그들에게 지킴받고, 지금은 리 마저도 목숨을 걸고 자신을 지키다가 쓰러졌다. 모두를 지키겠다는 일념으로 다시 일어선 사쿠라! "나도 너희들처럼 강해지고 싶어, 모두들 이번에는 나의 뒷모습을 잘 봐줘!!"

홀로 소리마을의 닌자들과 싸우는 사쿠라 앞에 라이벌 이노의 팀이 나타났다! 록리는 물론, 사쿠라가 싸우는 모습을 지켜보다못한 나머지 사쿠라를 도우러 왔던 것이다. 포메이션「이노시카쵸」로 소리마을의 닌자들을 막아내려고 하는 이노의 팀이었지만…

굉장한 힘을 가진 사스케를 당해내지 못하고 소리마을 닌자들은 도망쳤다. 그리고, 몸과 마음이 지친 나루토 일행에게 잠시동안의 휴식이 주어졌다. 한편, 탑에 도착한 키바조는 수시간전에 이미 탑에 도착해 조금전에 만났던 모래 마을의 가아라를 생각하고 있었다…

소리마을 닌자들과의 싸움이 끝난뒤, 나루토들은 상처 치료하기위해 잠시동안의 휴식을 취하고 있었다. 그러나, 시험이 시작된지 벌써 4일째. 남은 시간은 앞으로 하루정도가 남아있다. 그런 중에, 나루토가 제안을 하는데...바로 자신이 가지고 있는 두루마리로, 필요한 「하늘의 서」를 만들어 버리자고 한다. 게다가 내용까지 똑같이 해야한다며 열어서는 안 되는「땅의 서」를 열어 보려고 하는데!!

카부토와 탑까지 함께 하기로 한 나루토들. 하지만 그 도중에 비 마을 닌자의 술법 함정에 빠져 버린다. 계속 같은 곳을 빙빙 돌아 체력이 떨어진 가운데, 술법으로 만들어진 분신에 둘러싸인 나루토들은 고전을 면치 못하고... 나루토는 상대의 분신을 차례차례로 쓰러뜨리려고 하지만 아무리 쓰러뜨려져도 사라지지 않는다. 한편 사스케도 사륜안으로 적의 본체를 찾아내려고 하나, 오로치마루에게 받은 주인이 반응해 힘을 잘 사용할 수 없다! 초조해진 나루토는, 그림자 분신으로 적의 환영을 한번에 쓰러뜨리려고 하는데…!

간신히 탑에 도착한 나루토들이 두개의 두루마리를 열자, 이루카가 나타났다! 이루카는 나루토들에게 제 2 시험의 합격을 알린다. 그것을 듣자 뛸듯이 기뻐하는 나루토! 그러나, 이루카에게는 시험 합격 외에 또 하나 전하지 않으면 안 되는 것이 있었다. 그것은,「중급닌자」로서의 마음가짐 이었다.

합격자들 앞에 3대 호카게가 나타나 말한 중급닌자 시험의 진짜 목적. 그것은,「동맹국간 전쟁의 축소판」이었다. 사쿠라의 눈물어린 만류에도 불구하고 시합을 하려는 사스케, 한편 앙코는 오로치마루에게 당한 사스케가 시험보는것을 강제로라도 막으려하고…

1 대１의 개인전이 된 제3 시험 예선의 최초 대전은, 사스케와 오로치마루의 부하 요로이. 금년의 ＮＯ.１위 루키인 사스케에게 모두 주목한다. 그러나, 시합을 개시하자마자 요로이에게 당하는 사스케! 사스케는 챠크라에 반응하는 주인 때문에, 특기인 사륜안을 쓰지도 못하고 요로이에게 챠크라를 흡수당해가고…

사스케의 주인을 봉인한 카카시의 뒤에, 오로치마루가 나타났다! 오로치마루는 스스로의 야망을 위해서, 사륜안을 가진「우치하」의 힘을 가지고 싶다고 하는데… 한편, 제3시험 예선에서는 사스케에게 공격당해 한쪽 팔밖에 사용할 수 없는 소리마을의 자쿠 아부미와 나뭇잎 마을의 아부라메 시노가 싸우고 있었다. 두 사람의 싸움은, 챠크라를 먹는 대량의 기괴충을 생각하는 대로 조종하는 시노가 유리하게 보였는데!

예선은 순조롭게 이어져, 다음 대전은 모래마을의 칸쿠로 와, 오로치마루의 부하 미스미로 결정되었다. 시합이 개시되자마자 모든 관절을 마치 뱀처럼 움직일수 있는 미스미가 칸쿠로 를 포박했다. 그런데 사실 그가 잡은 것은, 인형이었던 것이다! 칸쿠로는 인형을 조종하는 괴뢰사였고, 형세는 단숨에 역전되 칸쿠로 의 승리로 끝이난다. 그리고 발표된 다음 대전, 사쿠라VS이노. 소꿉친구이자 라이벌인 두 사람의 대전이 시작되었다.

제4회전은, 소꿉친구이며 사스케를 사이둔 연애의 라이벌이기도 한 사쿠라와 이노의 시합. 사쿠라는 어릴 때 이노에게 동경과도 같은 감정을 품고 있었지만, 지금은 마음을 다해서 진심으로 대결!! 이노는 사쿠라의 도발에 빠진척 연극하고, 이혼술로 사쿠라의 몸속에 들어가려고 한다. 이는 본인의 입으로 시합을 기권한다는 말을 하게하려는 작전이었다…

제5회전은 텐텐 VS 테마리. 무기의 달인 텐텐은 다양한 닌자도구로 테마리에게 도전하지만, 거대부채를 사용하는 테마리는 바람으로 모조리 뒤엎어버린다. 텐텐의 무기공격을 완전히 막은 테마리는 승자가 되고, 모래마을의 무서움을 과시했다. 제6회전은 시카마루 VS 킨! 소리마을의 킨이 언듯 유리하게 되는것 같았지만, 시카마루가 특기인 그림자흉내술을 사용한 것에 의해…

제7회전은 나루토 vs 키바. 아카마루를 데리고 있는 키바는, 짐승둔갑술로 나루토를 공격! 위기인가! 라고 생각되는 나루토 였지만, 여기서 끝날 나루토가 아니야!! 연막을 편친 나루토는 그림자분신술에 새로운 기술을 응용해서 키바에게 반격하고 자신의 강함을 주변에 과시했다. 그러나, 아카마루와 키바 도 만만치 않은데…

환을 먹고 차크라를 증가시킨 키바와 아카마루는, 단숨에 나루토에게 반격한다. 한편 나루토는 의외성닌자 랭킹1위 답게 뛰어난 후각을 가진 키바를 혼란시키고, 새로운 필살기로 쓰러뜨린다고 큰소리 치는데! 거기에서 내놓은 나루토 최후의 수단은…?!

제8회전은 히나타 vs 네지. 그들은 같은 일족인 휴우가의 종가와 분가, 즉 친척끼리의 싸움이 되었다. 마음이 약한 히나타는 네지의 박력에 압도 되지만, 나루토의 격려하는 목소리를 듣고, 싸울것을 결심한다. 휴우가가 계승하는「백안」이라고 하는 기술을 가진 2명은, 어떠한 싸움을 하게될것인가…?

네지와의 싸움을 정면에서 도전한 히나타 이지만, 월등한 네지의 실력앞에서 무너진다. 그러나 히나타는 무슨일에도 포기하지 않고 자신의 닌자의 길을 향해 나가는 나루토의 모습을 생각하며, 용기를 쥐어짜 일어선다. 이전의 히나타 와는 다르게, 한계를 넘어서려는 그 모습에 모두가 놀라지만…

제9회전은 드디어 모래마을의 가아라가 등장. 대전 상대는 체술의 스페셜리스트, 리! 표주박 속의 모래를 생각한대로 조종하는 가아라에게, 리는 초인적인 체술을 사용해서 몰아넣는다. 그리고, 드디어 가아라의 절대방어「모래갑옷」이 풀리는듯 하였으나…!?

리 가 금단의 기술인 연화로 가아라를 공격. 승부가 결정된 걸로 보였지만, 그것은 가아라의 빈 모래껍질이었다. 이에 가아라는, 연화에 의해 몸을 움직일 수 없는 리 를 가지고 놀기 시작한다. 궁지에 몰린 리 이지만, 선생님 가이의 격려에 힘입어 다시 일어서고… 연화이상의 금단의 기술로 여겨지는 두번째 연화로 승부를 가리려고 결의하지만… !

목숨을 걸고 금단의 기술 두번째 연화로 공격을 시작하는 리. 이것은, 차크라혈이 밀집한 팔문을 3개 이상 여는 것을 가리킨다. 팔문 모두를 연 상태는, 사용한 닌자의 죽음을 의미한다고 할정도로 이것은 상당히 위험한 금단의 기술이다. 제5의 문까지 연 리 는, 초인적인 고속연속체술을 사용하여 있는힘을 다해 목숨을 걸고 가아라를 공격하지만, 가아라는 모래관으로 맹 반격. 기절해버린 리 는, 자신의 닌자의 길을 증명하기 위해서 또 일어서서려고 하지만…

예선 최종전의 쵸지와 오로치마루의 부하 도스 키누타의 대전은, 쵸지의 육탄전차가 소리공격에 어이없이 무너지면서 도스의 승리로 끝났다. 예선은 모두 무사히 끝나고, 드디어 본선의 내용이 호카게로부터 발표되었다. 그리고 그시각, 오로치마루는 다른계획을 짜고있었는데…

나루토의 선생님이었던 카카시는 1개월 후의 본선에 대비해 나루토의 새로운 선생님으로 에비스를 선택했다. 에비스로 부터 챠크라의 컨트롤이 원활하지 못하다는 것을 지적받은 나루토는 물위를 걷는 수행에 몰두한다. 의외로 빨리 요령을 파악하는 나루토에게 감탄하는 에비스. 바로 그 때, 돌연 두사람의 앞에 어떤 인물이 등장하는데…!