I Team Genin continuano la ricerca dei due rotoli del cielo e della terra all'interno della Foresta della Morte. Nel frattempo il Team 7 è inseguito da un nemico molto potente.

Naruto ed il resto del Team 7 continuano la loro battaglia contro Orochimaru all'interno della Foresta della Morte. Per salvarsi Sasuke decide di consegnare al nemico il Rotolo ma Naruto glielo impedisce e poi esprime la delusione per il comportamento da coniglio dimostrato dal suo compagno. Orochimaru evoca un altro serpente gigante e, contro di lui, Naruto rivela la forza dello Spirito del Volpe a nove code sorprendendo Orochimaru. Quando il serpente attacca Sasuke Naruto riesce a fermarlo con le braccia ma, per aver salvato Sasuke, viene bloccato dal nemico che usa il sigillo pentastico sul sigillo del 4° Hokage facendo svenire Naruto. Per fortuna le parole di Naruto fanno riprendere fiducia a Sasuke che, ripensando a suo fratello, decide di continuare a lottare.

Sasuke cerca di sconfiggere il Kusanin con il Triplice attacco del Mulino Sharingan combinato alla tecnica del Drago di Fuoco e, proprio quando pensa di esserci riuscito, l'uomo rivela le sue vere sembianze: si tratta in realtà di Orochimaru.

Sakura ha passato la notte ad assistere Naruto e Sasuke, ancora svenuti. All'alba viene sorpresa dal gruppo di Dosu che ha intenzione di eliminare tutto il team 7.

Rock Lee e Sakura si alleano per riuscire a sconfiggere i Genin del Suono e proteggere Naruto e Sasuke.

I ragazzi del Team 10 prendono coraggio ed tentano di aiutare Sakura a tenere a bada i ninja del Suono. Non riescono e in loro soccorso arrivano anche Neji e Tenten, che non hanno però bisogno di intervenire in quanto il Segno Maledetto prende il sopravvento su Sasuke, che dimostra una personalità totalmente diversa, perversa, e riesce a calmarsi solo quando Sakura lo fronteggia.

Gli altri Genin continuano la ricerca dei rotoli. Nel frattempo il Team 8 scopre la grande potenza di Gaara. Il giovane ninja è in grado di controllare la Sabbia, e senza battere ciglio fa fuori con la massima facilità 3 ninja più grandi del villaggio della Pioggia.

Naruto pensa di aprire il rotolo. Kabuto si unisce al Team 7 per riuscire a raggiungere la torre al centro della Foresta della Morte.

Il Team 7 e Kabuto combattono contro i ninja della Pioggia dopo essere riusciti a smascherare le loro tecniche illusorie.

Il Team 7 recupera l'ultimo rotolo e completa la seconda fase dell'esame Chūnin. Tuttavia, i Genin restanti devono affrontare un esame preliminare per riuscire ad entrare nella terza fase dell'esame Chūnin.

Viene scoperta la vera identità di Kabuto, ossia quella di un traditore di Konoha. Nel frattempo inizia l'incontro tra Sasuke e Yoroi Akado.

Prosegue lo scontro tra Sasuke e Yoroi Akado. Sasuke resiste, nonostante il forte dolore provocato dal Segno Maledetto. Sasuke è in difficoltà e ricordandosi di Rock Lee nel loro precedente scontro, usa lo stesso calcio che il ragazzo usò contro di lui e che Sasuke aveva copiato con lo Sharingan, che sfrutta per una nuova tecnica inventata da lui. Kakashi decide di aiutare Sasuke alla fine dello scontro creando un ulteriore sigillo attorno al Sigillo Maledetto.

Misumi e Kankuro si preparano alla sfida per le eliminatorie. Sasuke e Kakashi incontrano Orochimaru, che decide di venire allo scoperto.

Kankuro riesce a sconfiggere Misumi grazie alla tecnica del marionettista. Naruto non è molto d’accordo, ma il maestro Kakashi gli fa notare che rientra tutto nelle regole. Intanto sta per cominciare lo scontro tra Ino e Sakura.

La battaglia tra Sakura e Ino si intensifica man mano che vengono svelati i legami di amicizia e rivalità tra le due ragazze. Lo scontro si conclude in parità.

Le sfide preliminari continuano con lo scontro tra Temari e Tenten e con la sfida tra Shikamaru Nara e Kin Tsuchi.

Naruto ha finalmente la possibilità di combattere contro Kiba Inuzuka del Team 8 e durante lo scontro dimostra il suo notevole miglioramento rispetto all'accademia. Ma Kiba e il suo cane Akamaru sono molto forti agendo in coppia.

Lo scontro tra Naruto e Kiba continua. Naruto riesce a liberarsi di Akamaru facendolo colpire dallo stesso Kiba grazie ad un trucco geniale. Naruto vince lo scontro con la sua nuova tecnica.

Neji Hyuga ed Hinata Hyuga combattono per difendere il proprio onore e quello delle rispettive famiglie.

Hinata è decisa a dimostrare il proprio valore a Naruto, continuando a combattere.

Rock Lee viene sorteggiato per combattere contro il potente e pericoloso Gaara della Sabbia. Durante lo scontro Rock Lee si libera dei pesi che aveva sulle gambe e diventa rapidissimo. Rock Lee usa il Loto frontale su Gaara.

L'attacco di Rock Lee è andato a vuoto e Gaara inizia a colpirlo ripetutamente con la sabbia. Rock Lee, ormai prossimo alla sconfitta, sceglie di sbloccare le porte del chakra giocandosi il tutto per tutto.

Rock Lee finalmente mostra la sua tecnica migliore: l'apertura delle Otto Porte. Gaara si prepara per una prova di forza sanguinaria. Rock Lee colpisce Gaara con la potentissima tecnica, ma lui risponde stritolando il braccio e la gamba sinistra di Rock Lee con la sabbia, vincendo lo scontro: I medici dicono che a causa delle ferite provocate da Gaara, Rock Lee non sarebbe più potuto essere un ninja.

L'ultimo incontro dei preliminari del terzo esame vede come sfidanti Choji Akimichi e Dosu Kinuta. Naruto scopre che avrà un nuovo maestro per prepararsi al terzo esame per diventare Chūnin.

Naruto, per prepararsi al terzo esame Chūnin, inizia ad allenarsi con Ebisu, con alcune conseguenze inaspettate.

A stendere Ebsu è stato l’eremita dei rospi, Jiraiya. Naruto vorrebbe che lo seguisse nell’addestramento, ma Jiraiya si fa pregare un po’, prima di accettare.

Hayate riesce a origliare una conversazione tra Kabuto e Baki e scopre che il villaggio della Sabbia è in realtà in combutta con il villaggio del suono per distruggere il villaggio della Foglia. Ma mentre cerca di scappare per riferire il messaggio all’Hokage, viene attaccato da Baki.

Sakura decide di andare a trovare Sasuke in ospedale e ovviamente Ino decide di accompagnarla per non lasciare i due da soli. Ma Sasuke è sparito, nonostante le sue condizioni siano precarie.