O plano de Orochimaru para destruir a Vila Oculta da Folha é interrompido, mas será necessário muito trabalho para consertar toda a extensão do dano causado.

Kakashi chega em cima da hora para ajudar Asuma e Kurenai, e Itachi também entra na briga. Começa a sensacional batalha entre dois usuários de Sharingan.

Jiraiya e Naruto partem numa jornada para encontrar Tsunade, uma das Três Ninjas Lendárias, para proteger Naruto das garras da misteriosa organização Akatsuki e para treinar seu pupilo.

Decidido a enfrentar Itachi, Sasuke corre para a cidade onde está Naruto. No caminho, trágicas lembranças do passado vêm à tona.

Por pouco, Jiraiya salva Naruto de Kisame, e descobre que Itachi e a Akatsuki estão atrás de Naruto para obter o poder do Nove Caudas.

Profundamente ferido física e mentalmente, Sasuke é levado de volta à Vila Oculta da Folha graças a Guy. Se ao menos Tsunade, especialista em medicina, estivesse aqui...

Naruto finalmente começa a treinar com Jiraiya. A técnica que Naruto vai aprender é a marca registrada do Quarto Hokage, uma técnica que até um gênio como ele levou três anos para dominar.

Naruto consegue completar o primeiro passo do seu treino. Mas o passo seguinte, que consiste em explodir uma bola de borracha com chakra, mostra-se extremamente difícil.

Orochimaru e Kabuto aparecem para Tsunade e Shizune. Ferido pelo Selo Mortal do Ceifador usado pelo Terceiro Hokage, Orochimaru pede ajuda à antiga Ninja Lendária.

Para retribuir o tratamento de seus braços, Orochimaru se oferece a trazer de volta dos mortos Nawaki, irmão mais novo de Tsunade, e Dan, seu antigo namorado.

Naruto fica furioso com o desrespeito que Tsunade exibe contra os Hokages e a desafia a um duelo.

Naruto treina com afinco para ganhar o colar da Tsunade. Enquanto isso, Tsunade reflete sobre a oferta de Orochimaru.

Seduzida pelo desejo de rever Nawaki e Dan, Tsunade quase sucumbe à oferta tentadora de Orochimaru.

Orochimaru e Kabuto usam um jutsu para invocar uma cobra gigante. Envenenado e incapaz de usar plenamente seu chakra, Jiraiya invoca o pequenino Gamakichi.

Nunca voltar atrás no que diz é o jeito ninja do Naruto! Ferido gravemente por Kabuto, o pobre garoto está à beira da morte.

Jiraiya, Tsunade e Orochimaru utilizam seus jutsus de invocação, e uma feroz batalha se inicia.

Tsunade, Naruto e o resto do grupo começa a voltar para a Vila da Folha, onde Tsunade se tornará a Quinta Hokage. A pedido de Tsunade, eles passam uma noite numa cidade de fontes termais.

Naruto pede a Tsunade que trate Sasuke e Lee antes de assumir como Hokage. Após examinar Lee, ela lhe aconselha a procurar outra carreira e deixar de ser ninja.

Lee hesita quando Tsunade lhe pergunta se prefere deixar de ser ninja ou arriscar uma cirurgia com apenas 50% de chance de sucesso.

Ao receber o conselho de Tsunade, Lee relembra seu primeiro encontro com seu professor Guy. Incapaz de dominar ninjutsu e genjutsu, Lee sempre foi desprezado pelos outros.