בפרק הפותח את העונה השלישית והאחרונה לסדרה, נעצרים מקס וליז ונכלאים בעוון שוד של חנות מכולת. במקביל, מנהלת איזבל רומן חשאי עם פרקליט, בעוד מייקל מנסה לארגן מחדש את חייו.

מייקל מוצא עבודה שנייה כבתור שומר ביטחון, אבל כשהוא מנסה ל-"שחרר" קצת את עמיתיו לעבודה, הוא גורם לפיטור כל המחלקה. בינתיים, מקס וליז ממשיכים להתראות אחד עם השני למרות בקשותיהם של הוריה.

בהדרכת רוחו של אלכס, מתמודדת איזבל עם פחדיה מאהבה ועם רגשותיה החצויים כלפי ג'ס; מריה מגלה לשמחתה פן חדש ואנושי במייקל, בעוד ליז ומקס נאבקים להישאר יחד חרף התנגדותו של אביה.

מקס נוסע להוליווד לחקור רצח שהוא מאמין שבוצע ע"י חייזר. הוא מוצא קשר כלשהו אל סדרת מדע-בדיוני ומוצא את עצמו נבחן לתפקיד בסדרה. בינתיים, איזבל וג'סי נאבקים כיצד לחשוף את אירוסיהם למשפחותיהם.

מקס מאלץ חייזר משנה-צורה שהפך למפיק הוליוודי (ג'ו פנטוליאנו, "הסופרנוס") לעזור לו באיתור ספינת החלל שהביאה אותם לכדוה"א; איזבל וג'ס נאלצים להתמודד עם התגובות העוינות לבשורת נישואיהם.

ממש לפני חתונתה, איזבל נשארת עם ספק כשהיא חולמת חלומות על אהובה הקודם, החייזר קיוואר. בינתיים, מקס חסר הרצון מסכים להיות השושבין של ג'סי, בזמן שהוא מנסה לחקור אותו במסיבת הרווקים.

איזבל וג'סי יוצאים לירח דבש, אך אושרם נקטע ע"י קיוואר, הזומם להחזיר את איזי לכוכב הולדתם. מקס ומייקל יוצאים לעצור את קיוואר, כשבינתיים מגלות ליז ומריה שפיליפ פצח בחקירה סודית אודות מקס והיעלמותה של טס.

חבר-לשעבר של מריה מגיע העירה ומעורר מחדש את אהבתה הגדולה למוסיקה - מה שמעמיד בסכנה את יחסיה עם מייקל. בינתיים, ממשיך אביו של מקס בחקירתו, בעוד איזבל ומקס מנסים לעצרו.

ילד אוטיסט מתיידד עם מקס, וגורם לו לתהות האם ילדו האבוד מנסה לתקשר איתו. מייקל מתחפש לסנטה קלאוס באירוע צדקה, ואילו איזבל וג'סי מבלים יחד חופשה ראשונה כזוג נשוי.

בערב השנה החדשה, יוצאים מקס ומריה למצוא את הרייב האגדי המתקיים מדי שנה במיקום סודי שונה. במקביל, נשארת ליז בעיר ומחזקת את קשריה עם אביה, ואיזבל מוצאת לקייל את הדייט המושלם.

חבר ותיק של ג'סי העובד כעיתונאי מגיע לביקור ומתחיל לחשוד באיזבל, מקס ומייקל לאחר שמזדמן לו לחזות בכוחותיו המיוחדים של מייקל. איזבל מפנטזת על האפשרות לגלות לג'ס את סודה.

גופה של ליז מתחיל לעבור שינויים חייזריים, והיא מחליטה שעליה להתנתק ככל האפשר ממקס – ומרחיקה עד ורמונט. במקביל, מקבלת מריה הצעה לחוזה הקלטות בניו יורק.

מייקל חושף קנוניה ומגייס את עזרתם של מקס ואיזבל כדי לחקור את רציחתו של אחד מעמיתיו בעבודה. בינתיים, מנסה ליז לפתוח בחיים חדשים בוורמונט ומריה, שהתאכזבה מניו-יורק, נוסעת לבקרה.

איזבל נלחמת על חייה לאחר שנורתה, ומייקל נאלץ לגלות לג'סי את האמת על מוצאה החייזרי. קלייטון ווילר עובר שינוי תהומי ומגלה שהוא כלוא בגופו של מקס. אורחת: מורגן פיירצ'יילד.

החייזרים מנסים לחזור לשגרה, אך מגלים שחייהם הפכו רק מסובכים יותר - בעוד מייקל מסתמן כמנהיג החייזרים החדש במקום מקס "המנוח", מגלה ג'סי שהוא נמצא תחת מעקב צמוד של האף-בי-איי.

טס שבה עם בנו של מקס, והאף-בי-איי בעקבותיה. מקס ואיזבל נאלצים לחשוף בפני הוריהם את מוצאם האמיתי. החייזרים מנסה להגן על התינוק, וטס מחליטה להקריב את חייה למען בנה.

בפרק הסיום של הסדרה, מבינים החייזרים שאינם בטוחים עוד ברוזוול ומחליטים לעזוב מייד לאחר טקס סיום הלימודים. במקביל, רואה ליז בחזיונותיה את עתידם - ומותם - שלה ושל חבריה.