El comienzo del segundo semestre, Tsubasa Hanekawa conversa con la niña fantasma Mayoi Hachikuji de camino a la escuela. Poco después, Tsubasa tiene un encuentro con una aparición en forma de un enorme tigre blanco y al llegar a la escuela, le cuenta a Hitagi al respecto.

Algún tiempo después, Tsubasa y Hitagi ven humo saliendo a lo lejos y Tsubasa descubre que su casa está en llamas. Con su casa destruida y sin lugar para dormir, Tsubasa le dice a sus padres que va a dormir en casa de un amigo, pero ella decide pasar la noche en la escuela abandonada donde Oshino solía vivir.

Mientras sus padres todavía no han encontrado otro lugar para vivir, Tsubasa sigue quedándose en la casa de Hitagi. Sin embargo, más tarde se revela que los recientes acontecimientos tuvieron tal impacto en Tsubasa que está poseído de nuevo por el Gato Maldito.

Tsubasa poseída se escabulle de la casa de Hitagi para enfrentar al tigre que había conocido con anterioridad, ya que, según ella, el fuego en su casa fue causado por este. Después de un enfrentamiento feroz con la aparición, Tsubasa regresa a la casa de Hitagi sólo para encontrar que ella estaba despierta y esperando por ella. Como Hitagi ya era consciente del Gato Maldito, ella no se sorprendió al encontrarse con él.

Al día siguiente, Tsubasa vuelve a la normalidad, sin recuerdos de su posesión como de costumbre y por alguna razón, Hitagi le pregunta una vez más si está realmente enamorada de Araragi.

Hitagi le señala a Tsubasa que a pesar que ella y Araragi son similares en querer ayudar a los demás, son demasiado diferentes en todo lo demás, incluyendo cómo Tsubasa es demasiado inocente para darse cuenta de si alguien se acerca a ella con malicia.

El mismo día, Tsubasa se reúne con Suruga en la escuela y se entera por ella que Araragi le ha enviado un mensaje. Tsubasa deduce que él quiere reunirse con ella más tarde esa noche en la escuela abandonado.

Al regresar a la casa de Hitagi, Tsubasa le cuenta lo que dijo Suruga y las das acuerdan no inmiscuirse en los asuntos de Koyomi esta vez. Más tarde ellas son visitadas por Karen y Tsukihi quienes le ofrecen su casa a Tsubasa. Tsubasa acepta su oferta, sólo para darse cuenta más tarde que ella debe dormir en la habitación de Araragi.

En medio de la noche, Tsubasa es poseído de nuevo y Shinobu aparece ante ella, alegando que su conexión con Araragi se rompió y ella lo está buscando. Tsubasa poseída no sólo revela acerca de la reunión de Araragi con Suruga, sino también se ofrece a ayudarla a llegar más rápido, pero al momento en que las dos llegan a la escuela abandonada, ellas encuentran todo el lugar quemado hasta los cimientos.

Tsubasa despierta al día siguiente en la casa de Araragi y descubre que ella estaba poseída de nuevo. Mientras sale de la casa, ella es detenida por la madre de Araragi. Esta le explica que para ellos tener a Tsubasa como invitado no es ninguna carga, así que debería considerarlos como su propia familia. La señora Araragi también explica que apartar los ojos de la verdad no es huir del problema, mencionando la tensa relación de Tsubasa con sus padres.

Más tarde, mientras caminaba por un parque, Tsubasa se encuentra con un hombre llamado Episode, quien es mitad vampiro y una vez casi la mata. Él aparece acompañado por una mujer llamada Izuko Gaen, a quien Meme se refería como su senpai. Gaen afirma que lo sabe todo y sorprende a Tsubasa cuando ella muestra su conocimiento sobre los sentimientos de Tsubasa hacia Araragi, así como su problema con el tigre. Gaen y Episode se marchan, después de decir que el problema de Tsubasa es solo suyo y sólo ella puede resolverlo.

Tsubasa va a la biblioteca a investigar sobre "Kako", la forma en que Gaen llamó al tigre, pero no encuentra nada. Ella llama a Hitagi, quien expresa su preocupación de que Gaen nombrara al tigre como "Kako", al enterarse de que Gaen era el apellido de soltera de la madre de Kanbaru. Hitagi explica que Tsubasa y los incendios están vinculados, pues siempre que Tsubasa duerme, el lugar se incendia poco después, lo que eventualmente puede incluir las casas de Hitagi y de Koyomi.

Tsubasa regresa a la casa Araragi y es forzada a una partida de cartas con Karen y Tsukihi. Ellas discuten lo que las palabras "fuego" y "llama" significan, y acerca de los novios de las hermanas. Tsubasa explica que Araragi se niega a reconocer a los novios de sus hermanas a causa de la envidia y luego se da cuenta de que ella está siendo celosa.

Mientras se prepara para enfrentar al tigre, Tsubasa cree que nunca podrá ser capaz de ver a Araragi otra vez y luego de intentar dejar su propia marca en el cuarto de Araragi para que él la recuerde, ella se toma una foto y la envía a alguien, escribiendo una nota a su otro yo, con la esperanza de que puedan compartir conocimientos y sentimientos.

En su carta al espíritu gato, Tsubasa revela que al igual que ella, Kako es otra aparición engendrada por sus sentimientos reprimidos, esta vez por los celos y le pide que regresen ambos a su corazón, ya que ella es ha decidido cargar con todos sus sentimientos negativa, sin importar como la cambien a ella.

Cuando Kako está a punto de quemar el apartamento de Hitagi, Tsubasa aparece para hacerle frente. A pesar de no tener ninguna posibilidad de derrotar a Kako, Tsubasa logra ganar el tiempo suficiente para que Araragi aparezca y lo derrote con Heartspan. Antes de absorber tanto el espíritu del gato como del tigre, Tsubasa finalmente confiesa su amor por Araragi, y como se esperaba, él la rechaza con el pretexto de que su amor por Hitagi es más fuerte.

Después de que su familia finalmente alquila otra casa para vivir, se revela que el cabello de Tsubasa desarrolló rayas blancas como un tigre, lo cuales ella tiñe de negro, y ella le había pedido al fin a sus padres una habitación para ella, como una señal de que por fin se había convertido en un verdadero miembro de su propia familia.

Es el último día de vacaciones de verano y Araragi busca a Mayoi para devolverle la mochila que dejó en su casa. En el camino, tiene un encuentro con Yotsugi quien revela que al igual que él y Mayoi, ella una vez murió, pero mientras que Araragi se transformó en un ser inmortal y Mayoi se convirtió en un fantasma, ella fue revivida por Yuzuru como shikigami para servirle.

Con ninguna señal de Mayoi y con las palabras de Yotsugi en su mente, Araragi regresa a casa y se queda pensando en lo que podría hacer por Mayoi hasta que Shinobu le recuerda que sólo tiene unas horas para terminar su tarea de verano. Luego él reflexiona si pudiera volver al pasado para terminarla a tiempo y para su sorpresa, Shinobu revela que es posible.

En un templo abandonado, Shinobu abre un portal al pasado y pasan por él con la intención de alcanzar el día anterior, pero un poco más tarde, se dan cuenta de que han viajado once años en el pasado.

Al darse cuenta de que él viajó a un día antes de la muerte de Mayoi, Araragi decide salvarla y evitar que ella se convierta en un fantasma. Mientras buscan direcciones, él y Shinobu conocen a Tsubasa de seis años de edad, quien los guía a la estación de policía cercana. Ahí ellos dan con la dirección de Mayoi y van al siguiente día planeando guiarla con seguridad a la casa de su madre, pero después de horas de espera, el padre de Mayoi aparece y se se dan cuenta que ella se había ido de casa temprano en la mañana.

Araragi logra reunirse con Mayoi en el mismo lugar donde se conocieron, pero después de asustarla, él la salva de ser atropellada por un camión y su plan para evitar su muerte tiene éxito. Sin embargo, después de regresar al presente, Araragi se da cuenta de que sus acciones cambian drásticamente el curso de la historia ya que, según él, que llevó al mundo a su destrucción

Al regresar al presente, Araragi y Shinobu encuentran toda la ciudad desierta y se dan cuenta de que fue una consecuencia de salvar la vida de Mayoi en el pasado. Con base en el periódico más reciente que encontraron, llegan a la conclusión de que algo grave sucedió durante los acontecimientos de Gato Tsubasa y vuelven a la capilla a buscar una manera de volver al pasado. Sin embargo, se encuentran con que Oshino había puesto un encanto diferente que les impide utilizar sus poderes y cuando cae la noche están rodeados de muertos vivientes.

Después de escapar, Shinobu se da cuenta de que los muertos vivientes una vez fueron vampiros que perdieron a su amo y que dicho maestro no debe ser otro más que ella misma. Según sus conclusiones, cuando Shinobu se escapó de casa, fue Mayoi quien ayudó a Araragi a encontrarla y como ella no se convirtió en un fantasma en la línea de tiempo actual, ella nunca se hizo amiga de él, por lo que no logró encontrar a Shinobu, que lo llevó a ser asesinado por el Gato Maldito y Shinobu inició una infección vampiro en todo el mundo antes de suicidarse.

Buscando supervivientes, Araragi y Shinobu deciden utilizar algunos fuegos artificiales para traer la atención de todo el que logró escapar con vida, pero terminaron atrayendo los muertos vivientes hacia ellos una vez más

Una mujer aparece para expulsar a los muertos vivientes arrojándosle arroz. Para su asombro y alegría, Araragi se entera de que la mujer es de hecho Mayoi, la cual le hace entrega de una carta de Oshino, quien de alguna manera descubrió toda la situación.

De la carta, Araragi y Shinobu se enteran que han viajado a una línea de tiempo diferente y antes de regresar a su línea de tiempo original, se les pide a confrontar a la versión alterna de Shinobu que todavía está viva, y deben destruirla para detener la plaga muertos vivientes y evitar que el mundo sea destruido para siempre.

Después de despedirse de la versión adulta de Mayoi, el parregresa a las ruinas del templo y se reúnen con la otra Shinobu, quien llora de alegría al ver que en otra línea de tiempo, se las arregló para reunirse con Araragi y ofrece sacrificarse para que puedan regresar a su propia línea de tiempo.

Al volver a su propio tiempo, Araragi se da cuenta que echaba de menos la ceremonia de apertura muy a su pesar y después de que Shinobu regresa a su sombra, Mayoi aparece delante de él y se toman su tiempo mientras caminan juntos a la casa con el fin de regresar su mochila.

Los compañeros de clase de Nadeko Sengoku están muy tensos debido al "engaño" del estafador Deishu Kaiki. Por eso, Nadeko va a la escuela todos los días con el corazón apesadumbrado; pero un día, comienza a ver serpientes blancas por todos lados.

Nadeko pasó la noche en la residencia Araragi después de que Koyomi la confunde con huir de casa y la lleva de regreso a su casa. A la mañana siguiente, habla con la hermana menor de Koyomi, Tsukihi, una amiga de la escuela primaria.

Nadeko finalmente encontró el objeto de adoración. Kuchinawa, ahora de buen humor, le dice a Nadeko que le concederá un deseo. Pero Koyomi aparece en ese momento y comienza su intento de convencer a Nadeko de que deje de lado ese objeto de adoración.

Koyomi regresó del túnel del tiempo con Shinobu. Desde el Santuario de Shirahebi Norte, se dirigió a su casa junto con Mayoi Hachikuji y le devolvió su mochila. Sin embargo, justo después, ambos son asaltados por una misteriosa "Oscuridad".

Con la ayuda de Yotsugi Ononoki, Koyomi y Mayoi pudieron escapar de la "oscuridad". Dentro de las ruinas de la escuela intensiva a la que escaparon, se consulta a Shinobu sobre la "oscuridad". Empieza a hablar de lo que pasó hace 400 años.

Koyomi termina de escuchar la historia de Shinobu hace unos 400 años. Yotsugi se une a ellos en el lugar y Mayoi se despierta de su letargo. Los cuatro estaban hablando dentro de las ruinas de la escuela intensiva, pero la "oscuridad" aparece por segunda vez en ese lugar.

Koyomi y compañía bajaron la montaña en la que se escondían después de escapar de la "oscuridad". Al visitar una aldea entre las montañas, se encuentran con Izuko Gaen y reciben una explicación sobre la "oscuridad".

El 1 de enero, Hitagi Senjyogahara hace una llamada telefónica a Deishu Kaiki, su supuesto archienemigo. Fue una decisión difícil de su parte, para salvarse a ella y a Koyomi Araragi de su "sentencia de muerte".

Kaiki, que decide aceptar la solicitud de trabajo de Hitagi, visita la ciudad donde viven Koyomi y sus amigos. Comienza a investigar sobre Nadeko Sengoku, la chica de secundaria que se convirtió en dios del Santuario de Shirahebi del Norte, quien es el objetivo actual del engaño.

Kaiki se encuentra con Nadeko Sengoku cara a cara en el Santuario de North Shirahebi. La personalidad de Nadeko se volvió mucho más brillante una vez que se convirtió en el dios serpiente, y comienza a hablar con Kaiki de manera despreocupada sobre cómo iba a matar al hermano mayor Koyomi pronto ...

Kaiki se dirige al Santuario del Norte de Shirahebi todos los días para engañar a Nadeko, el dios serpiente, pero lo siguen de camino a casa. Además, recibe una misteriosa amenaza que le dice que "salga de este caso".

Tsubasa Hanekawa, supuestamente en el extranjero en busca de Meme Oshino, de repente se acercó a Kaiki para hablar con él. Después de intercambiar información con Tsubasa, Kaiki prepara los toques finales para sus preparativos para engañar a Nadeko, el dios serpiente.

Kaiki procede a engañar a Nadeko Sengoku. Sin embargo, Nadeko con sorprendente facilidad ve a través de las mentiras y los ataques de Kaiki con numerosas serpientes blancas. ¿Qué será lo último que saldrá de la lengua de un estafador cercano a la muerte: una mentira o la verdad?