Koyomi Araragi, un jeune lycéen japonais, découvre un secret troublant lorsqu'il aide sa camarade de classe Hitagi Senjougahara. Un secret qu'il ne doit jamais révéler.

Mal à l'aise après une dispute avec sa sœur le jour de la fête des Mères, Koyomi quitte la maison. Hitagi tombe sur lui dans le parc et lui fait une proposition.

Au parc, Koyomi et Hitagi rencontrent une fille appelée Mayoi Hachikuji. Elle semble égarée. Ils essaient donc de l'aider à retrouver le chemin de sa maison.

C'est à cause d'une apparition que Mayoi ne peut pas rejoindre la maison de sa mère. Sur les conseils de Meme, Hitagi avoue la surprenante vérité à Koyomi.

Suruga Kanbaru, une fille plus jeune et très populaire au lycée, suit Koyomi partout où il va. Ses motifs demeurent un mystère.

Suruga aime bien Hitagi avec qui elle a joué au basket à l'école autrefois. Mais bizarrement, ses émotions attirent le surnaturel.

Koyomi rend visite à Meme pour découvrir comment se débarrasser de l'apparition qui hante Suruga. Meme commence le récit d'une terrible vérité.

Koyomi est envoyé par Meme jusqu'à un temple isolé. Il y découvre un serpent sans vie, découpé en cinq.

Koyomi puise dans les pouvoirs de Meme pour libérer Nadeko Sengoku, une fille mystérieuse qu'il a rencontrée au temple, de la malédiction du serpent.

Nadeko vient remercier Koyomi. Ils se trouvent tous deux un intérêt commun. Tsubasa Hanekawa est de passage. Elle se plaint soudain de violents maux de tête.

Koyomi est aux anges lorsque Hitagi annonce qu'ils vont avoir un rendez-vous. Mais le jour J, il se rend compte qu'elle n'est pas venue seule.