Mientras el equipo del NCIS busca a Gibbs después de aparecer los restos de su barco, descubren que estaba rastreando a un asesino en serie con la periodista Marcie Warren, que escribió una denuncia sobre él.

Gibbs y Parker hacen un viaje para encontrar a una de las víctimas del asesino en serie. Además, el agente Knight se infiltra en una gran empresa manufacturera para investigar la posible vinculación de la compañía con los asesinos.

Gibbs y McGee se dirigen a Alaska mientras el equipo trabaja en casa para descubrir la conspiración detrás del asesino en serie.

El equipo investiga la muerte de un comandante de la marina tras la repentina explosión del cadáver antes de que Jimmy pudiera examinarlo.

El equipo investiga la muerte de un querido comandante de la Armada que entrenó a algunos de los mejores atletas del país.

El equipo investiga la muerte de un hombre en un crucero cuyo cuerpo es descubierto en la sauna del barco por la suegra de McGee.

El equipo investiga el caso de un reservista de la Marina cuyo cuerpo es encontrado en un coche destrozado en un campo de tiro. Además, Kasie sopesa los pros y los contras de comprar un arma.

Cuando se encuentra el cuerpo de una asesora financiera de prestigio en una estación naval, el equipo investiga el caso entrevistando al holograma tridimensional de la víctima, que ella misma creó antes de su muerte.

El equipo investiga un caso en el que un suboficial de la marina es sospechoso de intentar vender software clasificado robado utilizado para pilotar drones de combate.

Tras el rescate de un pequeño bote con oficiales de la Armada heridos, el equipo se ve obligado a esconderse después de descubrir terroristas a bordo.

El equipo investiga el cuerpo de un teniente de la marina al que le falta un ojo, llevándoles al mundo de las luchas enjauladas.

Mientras investigan la muerte de un intruso en Quantico, Jimmy y Kasie se ven expuestos a una biotoxina mortal y deben pedir ayuda a la doctora Carol Wilson para encontrar el antídoto.

Mientras el equipo investiga la muerte de un cirujano reservista voluntario de los Navy SEALs, se ven obligados a solicitar la ayuda de Kayla (Naomi Grace), la hija de Vance, para llevar a cabo una misión de alto riesgo.

El pasado delictivo de Parker resurge cuando el NCIS es llamado a Filadelfia para investigar la muerte de un suboficial de la Marina.

Un espantoso percance en la fiesta de revelación de sexo de un suboficial de la Marina lleva al NCIS al caso de una profesora desaparecida que se popularizó en un podcast de crímenes reales.

El NCIS investiga el aparente suicidio de un oficial retirado de la Marina que estaba en el grupo de duelo de Palmer y Knight. Torres recibe una llamada de la agente especial del NCIS Jane Tennant para que vaya a Hawai.

El crossover continúa en NCIS: Hawai'i S01E18 T'N'T (II).

Cuando un infame traficante de armas, Reymundo Díaz, sale de la cárcel y los cadáveres empiezan a acumularse, Torres se ve obligado a enfrentarse a las repercusiones de sus acciones durante una operación encubierta en la que trabajó hace años.

El NCIS investiga una red de adolescentes astutos cuando se produce una serie de robos en la Base de Marines de Quantico. Mientras trabaja en el caso, el agente especial McGee establece un vínculo con una de las adolescentes, Teagan Fields.

El NCIS investiga la inesperada muerte de un reservista de la Marina que era periodista de investigación. Además, el incipiente romance de Knight y Jimmy queda en suspenso cuando una transferencia de órganos vitales sale fatalmente mal.

Cuando el agente Parker es acusado de asesinato, el equipo pone en juego sus trabajos y sus vidas para ganar tiempo y descubrir la verdad.