2004: Nach der Landung von Oceanic Flug 415 in L. A. erfährt Jack, dass der Sarg mit der Leiche seines Vaters verschwunden ist. 2007: Jack, Kate, Hurley und Jin bringen Sayid zum Tempel und werden dabei von "den Anderen" gefangen genommen.

Sawyer begräbt Juliet, und Miles überbringt ihm eine Botschaft von ihr. Hurley, Jack, Kate und Jin ziehen los, um den Tempel zu finden und Sayids Leben zu retten. Auf dem Weg zum Tempel wird die Gruppe von "den Anderen" gefangen genommen.

Der zur Freude seiner Freunde wiederauferstandene Sayid wird von Dogen gefoltert. Er erschießt eine "der Anderen", und Kate findet sich auf der Flucht wieder. Jack muss etwas tun, was das Leben eines Freundes in Gefahr bringen könnte.

Auf der Insel sorgt der Mann in Schwarz für Fragen, als er Richard aus einer Falle befreit und Sawyer betrunken in dem Haus findet, in dem er mit Juliet gewohnt hat. Jenseits der Insel ist Locke wegen seiner Situation frustriert.

In Los Angeles will Jack seinem Sohn David näherkommen, was ihm nicht leicht fällt. Auf der Insel bewahrt Claire Jin vor einer Falle im Dschungel. Hurley erforscht den Tempel, und Jack wird wütend auf Jacob.

In der alternativen Realität, in der das Flugzeug nicht abgestürzt ist, besucht Sayid die Familie seines Bruders Omer. Auf der Insel folgen Sayid, Claire, Kate und die überlebenden "Anderen" dem Mann in Schwarz in den Dschungel.

In der alternativen Realität arbeitet Ben in Los Angeles als frustrierter Highschool-Lehrer, der seinen kranken Vater pflegt. Auf der Insel trifft Ben mit Sun, Ilana, Lapidus und Miles im Dschungel außerhalb des Tempels zusammen.

Auf der Insel befinden sich Jin und Sawyer in Claires Camp. Auf der vermeintlich verlassenen Hydra-Insel besucht Sawyer die Käfige, in denen Kate und er in der dritten Staffel gefangen gehalten wurden.

Jack, Hurley, Ilana, Sun, Ben, Lapidus und Miles versuchen herauszufinden, was sie tun bzw. wohin sie gehen sollen. In Rückblenden ins 19. Jahrhundert ist Richard als Landarbeiter auf den Kanarischen Inseln zu sehen.

Jack fragt sich, warum der Mann in Schwarz als Locke erscheint. Sawyer und Kate brechen zu einem geheimen Treffen mit ihren Freunden auf. In der alternativen Realität führen verschiedene Umstände die Charaktere immer wieder zusammen.

Lockes Camp gerät in einen Hinterhalt und er bittet Sayid um Hilfe, bevor er sich zur Hydra-Insel aufmacht. In der alternativen Realität verlassen Sun und Jin den Flughafen von Los Angeles, nachdem Jins Bargeld konfisziert wurde.

Desmond erwacht auf der Hydra-Insel. Widmore weist sein Team an, mit dem "Test" zu beginnen. Im Los Angeles der alternativen Realität ist Desmond ein enger Mitarbeiter von Widmore und bekommt einen ungewöhnlichen Auftrag.

Hurley bekommt Besuch von Michaels Geist, der ihn davor warnt, zur Hydra-Insel zu gehen. Sawyer und Kate werden langsam ungeduldig. Locke besteht darauf, noch auf ihre Freunde zu warten, damit sie gemeinsam die Insel verlassen können.

Jack wurde von Sayid und Locke auf die Hydra-Insel gebracht, um seine Freunde zu retten. Widmores Team hat Sawyer und dessen Gruppe in einen Käfig gesperrt. In der alternativen Realität wurde Locke an der Wirbelsäule operiert.

Jack, Hurley, Kate und Sawyer erholen sich von der Explosion auf dem U-Boot von Widmore und ihnen wird klar, dass sie Locke töten müssen. Derweil will Ben mit Richard und Miles Sprengstoff aus seinem alten Haus holen.

Locke setzt seinen großen Plan für die Insel in die Tat um. Kann Jack ihn noch aufhalten? In der alternativen Realität erfahren die Passagiere von Flug 815 in der Zwischenzeit, dass das Leben jedes Einzelnen nicht ist, was es scheint.

Auf der Insel suchen Sawyer, Locke und Ben nach Desmond, während Jack seine eigenen Ideen bezüglich Desmond hat. In der alternativen Realität tun Desmond und Hurley alles, damit die Überlebenden des Flugs und ihre Freunde einander treffen.