Pozostali na wyspie rozbitkowie doświadczają przedziwnego skoku w czasie w momencie przesunięcia wyspy. Jack oraz Ben rozpoczynają poszukiwania, mające zjednoczyć uratowaną szóstkę z lotu Oceanic 815. Hurley oraz Sayid wpadają w zasadzki w swych kryjówkach. W tym samym czasie, Kate wraz z Aaronem ucieka z własnego domu, zaraz po tym jak dwóch prawników prosi o przeprowadzenie testów macierzyńskich.

Hurley oraz Sayid uciekają przed ścigającymi ich policjantami. Hurley wyznaje swojej matce, że szóstka uratowanych rozbitków kłamała na temat pozostałych. W tym czasie rozbitkowie na wyspie walczą z uzbrojonymi mężczyznami. Ben dowiaduje się, że ma tylko 70 godzin na zebranie wszystkich uratowanych i sprowadzenie ich na wyspę.

Desmond poszukuje matkę Daniela Faradaya i dowiaduje się od Charlesa Widmore’a, że jest ona w Los Angeles. Rozbitkowie na wyspie przenoszą się do roku 1954, gdzie Locke usiłuje przekonać Richarda Alperta, że jest z przyszłości. W tym czasie Faraday rozbraja bombę wodorową.

Podczas drogi do Stacji Orchidea, rozbitkowie na wyspie przenoszą się w czasie do dnia, gdy urodził się Aaron, a następnie do 1988. Jin zostaje odnaleziony przez członków załogi Danielle Rousseau. W 2007 roku, Jack, Kate, Sayid oraz Ben spotykają się, a Kate uświadamia sobie, że to Ben przysłał do niej prawników w sprawie Aarona.

W 1988, Jin oraz załoga Rousseau zostają zaatakowani przez Czarny Dym podczas drogi do wieży radiowej. Charlotte, tuż przed śmiercią, wyznaje, że dorastała na wyspie. John Locke opuszcza wyspę po przekręceniu koła w zamrożonej komnacie. Poza wyspą, Ben zabiera Jacka oraz Sun do Eloise Hawking, która okazuje się matką Daniela. W tym samym czasie odnajduje ją także Desmond.

Eloise Hawking mówi, że szóstka uratowanych musi powrócić na wyspę. Jack, Kate, Hurley, Sun, Sayid oraz Ben wchodzą na pokład lotu 316 linii lotniczych Ajira Airways, które pilotuje Frank Lapidus. Na pokładzie przewożona jest także trumna z ciałem Johna Locke’a. Podczas lotu, po krótkim rozbłysku, rozbitkowie zostają z powrotem przeniesieni na wyspę. Jin odnajduje Jacka, Kate oraz Hurleya.

Locke, który ożywa bezpośrednio po powrocie na wyspę, jest wypytywany przez innych rozbitków. Odnajduje się także ranny Ben. W retrospekcjach pojawia się nieudana misja Locke’a aby sprowadzić ocaloną szóstkę na wyspę. Misja ta wspierana przez Charlesa Widmore’a oraz Matthew Abaddona kończy się zamordowaniem Locke’a przez Bena.

Jack, Kate, Hurley oraz Jin pozostają w roku 1974. Wkradają się potajemnie do zabudowań projektu Dharma po uratowaniu ciężarnej Amy z rąk Innych. Okazuje się, że od trzech lat przebywają już tam Juliet oraz zakochany w niej Sawyer, który jest szefem ochrony projektu Dharma.

W roku 1977, Sawyer organizuje dla Jacka, Kate oraz Hurleya możliwość przyjęcia do projektu Dharma. Sayid zostaje odnaleziony przez Jina, jednakże musi udawać, że należy do Innych i dlatego zostaje uwięziony przez projekt Dharma. W 2007, zaraz po rozbiciu się lotu 316, Sun oraz Frank dowiadują się od Christiana Shepharda, że pozostali z ich lotu (Jack i inni) są uwięzieni w przeszłości.

W roku 1977, Sayid nie chce współpracować z Sawyerem oraz członkami projektu Dharma. Chcą oni skazać go na śmierć. 12 letni Ben uwalnia Sayida, gdyż wierzy, że ten pomoże mu dołączyć do Innych. Jednakże podczas ucieczki, Sayid strzela do dziecka. W retrospekcjach Sayid zostaje pojmany przez Ilanę, która jest łowcą głów i ma za zadnie sprowadzić go z powrotem na Guam.

Juliet nie jest w stanie uratować Bena po postrzale, a Jack odmawia pomocy. W wyniku tego Kate zabiera Bena do Innych aby to oni pomogli uleczyć młodego Bena. Richard wyjaśnia, że leczenie odmieni Bena na zawsze. W retrospekcjach Kate decyduje się powrócić na wyspę pozostawiając Aarona pod opieką jego babci.

W roku 2007, Ben oraz Locke podróżują do świątyni gdzie Ben ma zostać osądzony za nieuratowanie od śmierci Alex. W międzyczasie Frank powraca na wyspę Hydra i bierze zakładników z rozbitków lotu 316. W retrospekcjach widzimy Bena porywającego Alex pod koniec lat 80. oraz jego konfrontację z Desmondem oraz Penny przed wejściem na pokład lotu 316.

W roku 1977, Roger, ojciec Bena, podejrzewa Kate w związku ze zniknięciem Bena. Miles zostaje obarczony zadaniem zawiezienia zwłok jednego z pracowników do stacji Łabędź, do swojego ojca, doktora Changa. W retrospekcjach, Miles dowiaduje się o własnych zdolnościach do rozmowy ze zmarłymi i dzięki temu zostaje zatrudniony przez Charlesa Widmore’a do podróży na wyspę na frachtowcu.

W roku 1977, Daniel Faraday powraca na wyspę z zamiarem ostrzeżenia jej mieszkańców przed katastrofą spowodowaną przez stację Łabędź. Jack, Kate oraz Daniel rozpoczynają strzelaninę z członkami projektu Dharma, co prowadzi do zdemaskowania Sawyera oraz Juliet. W retrospekcjach widzimy Daniela wraz z jego rodzicami Eloise Hawking oraz Charlesem Widmorem.

W roku 1977, Jack decyduje się podążyć wskazówkami Faradaya i zdetonować bombę wodorową, mimo że Kate nie zgadza się z tą radą. Doktor Chang przekonuje projekt Dharma do ewakuacji z wyspy, pozwalając Sawyerowi, Kate oraz Juliet wejść na pokład łodzi podwodnej i opuścić wyspę. W roku 2007, Locke powraca do Innych oraz do Richarda, którzy towarzyszą mu w podróży mającej na celu zabicie Jacoba.

W roku 1977, rozbitkowie starają się zdetonować bombę na stacji badawczej Łabędź. Dochodzi do zakłóceń elektromagnetycznych, w wyniku których Juliet zostaje wciągnięta do szybu wiertniczego. To właśnie ona detonuje bombę w ostatniej scenie odcinka. W roku 2007, Locke oraz Inni podróżują do miejsca gdzie znajduje się dziwny posąg o czterech palcach. Spodziewają się tam znaleźć Jacoba. Locke okazuje się jednak oszustem, gdyż w jego postać wcielił się dawny znajomy Jacoba, który zmanipulował Bena tak, aby to on zabił Jacoba. W retrospekcjach widzimy Jacoba który odwiedzał wcześniej wielu późniejszych rozbitków.

W roku 1977, rozbitkowie starają się zdetonować bombę na stacji badawczej Łabędź. Dochodzi do zakłóceń elektromagnetycznych, w wyniku których Juliet zostaje wciągnięta do szybu wiertniczego. To właśnie ona detonuje bombę w ostatniej scenie odcinka. W roku 2007, Locke oraz Inni podróżują do miejsca gdzie znajduje się dziwny posąg o czterech palcach. Spodziewają się tam znaleźć Jacoba. Locke okazuje się jednak oszustem, gdyż w jego postać wcielił się dawny znajomy Jacoba, który zmanipulował Bena tak, aby to on zabił Jacoba. W retrospekcjach widzimy Jacoba który odwiedzał wcześniej wielu późniejszych rozbitków.