Miután Lock súlyosan megsebesíti Naomit, eltűnik a dzsungelben. Jack a műholdas telefonnal kapcsolatba lép a mentőhajóval, de azok nem tudják bemérni a helyzetüket. Közben megérkezik a szigetre Desmond is, aki Charlie utolsó üzenetét hozza a túlélőknek. A hír, miszerint a hajón lévő emberek nem a megmentésükre érkeznek, megosztja a szigetlakókat. Eközben a sebesült Naominak sikerül megadnia helyzetüket a hajón lévőknek és nemsokára megérkezik egy helikopter is.

A mentőhelikopter viharba kerül és a rajta lévő négy utasból három kiugrik az irányíthatatlan járműből. Jack és Kate talál az első utasra, Danielre, aki meglehetősen furcsán viselkedik. Később a nála lévő műholdas telefonnal elkezdik keresni társait is. Társát Milest, valamint a pilótát a helikopterrel együtt megtalálják, de negyedik utassal már nincs szerencséjük, mert a nő Lockék csapatának fogságába esik. Sayid, Kate és Miles vállalkozik arra, hogy kiszabadítják a fogságba esett nőt.

Lock csapata ellenségesen fogadja Sayidot és Kate-et. A kis mentőalakulat Lock fogságába esik, aki vonakodik elegedni értékesnek vélt túszát. Sayid mindenáron vissza akarja vinni társaihoz a tudósnőt, hisz csak így juthat fel a hajóra visszarepülő helikopterre. A párhuzamos valóságban futó jelenetekben Sayid és Ben rejtélyes kapcsolatába nyerhetünk rövid bepillantást.

Desmond teljesen megzavarodik a helikopter fedélzetén útban a hajó felé. Össze-vissza ugrál múlt és jelen között, amellyel halálos veszélynek teszi ki szervezetét. Sayid, akit ebben az állapotában nem ismer fel, igyekszik segíteni neki. A tragédiát csak úgy akadályozhatja meg, ha keres magának egy biztos pontot, amelyet, vagy akit ismer mindkét időben, és kapcsolatba tud vele lépni a jelenben.

Charlotte és Faraday titokban a sziget belsejébe indul. Jackék utánuk erednek, hogy kiderítsék, miben sántikálnak. Útközben Julietet manipulatív módon befolyásolja Ben és arra kéri, hogy ölje meg a két embert. Terve szerencséjükre nem sikerül, így hála a két jövevénynek mindannyian megmenekülnek Ben egyik titkos vegyi fegyverétől.

Ahogy múlik az idő és közeledik a Juliet által beharangozott határidő, úgy lesz egyre idegesebb a terhességét féltő Sun. Mivel nem kap kielégítő válaszokat az idegenektől megmentésükkel kapcsolatban, úgy határoz, hogy férjével a biztonságosabbnak vélt Lock-féle táborhoz csatlakoznak. Juliet minden eszközt bevet, hogy lebeszélje Sunt és Jint tervükről, mert úgy gondolja, hogy a baba csak akkor maradhat életben, ha sikerül elmenekülniük a szigetről.

Sayid és Desmond egyre jobban megismeri a hajó legénységét és megdöbbenéssel felfedeznek fel egy régi ismerőst. Kiderül számukra, hogy Ben beépített embere, aki szabotálja a hajó működését, nem más, mint Michael. A férfi elmeséli nekik, mi mindenen ment keresztül megmenekülése óta és hogyan vette rá Ben erre a képtelen utazásra. Eközben Locke táborában Ben egy biztonságosabb helyre küldi lányát, ahol Alex életben maradhat egy gyanított, közelgő támadás esetén.

Ben lányát foglyul ejtik a teherhajó katonái. A zsoldosok ezután megtámadják Lockék táborát, és bekerítik őket. Bent a lánya megölésének lehetőségével próbálják meg jobb belátásra bírni, de a férfi nem hajlandó megtenni nekik ezt a szívességet.

A parton úrrá lesz a pánik, miután megszakad a kommunikáció a hajóval. Közben Jack is megbetegszik. Először csak kisebb rosszullétre, ételmérgezésre gyanakszik, de Juliet kideríti, hogy vakbélgyulladása van. Jacket meg kell műteni, ezért Juliet elküldi Jinéket az orvosi bázisra a szükséges eszközökért. Sawyer, Claire és Miles a tábori incidens után elválik Lockéktól és az éjszaka közepén elindulnak a partra.

A teherhajón pattanásig feszül a helyzet. A szigetről visszaérkező kommandósok azonnal újabb invázió előkészítésébe kezdenek. A tervet ellenző hajóskapitány közben segít Sayidnak visszajutni a szigetre. A feszültség azonban odáig vezet, hogy a kommandósok vezetője megöli a kapitányt és átveszi az expedíció parancsnokságát. Lock álmában megjelenik egy korábbi szigetlakó, aki segít neki Jacob házának megtalálásában, ahol Lock különös emberekkel találkozik és megtudja, hogyan mentheti meg a szigetlakókat a pusztulástól.

Lock, Hurley és Ben elindul az Orchidea állomás felé, ahol Jacob tanácsának megfelelően megmenthetik a szigetet. A part felett elszálló helikopterből egy csomagot dobnak ki, amelyben egy nyomkövetőt találnak. Jack és Kate a helikopter után indul, majd a dzsungelben összefutnak Sawyerrel, Aaronnal és Miles-szal. Ekkor Sayid is megérkezik egy motorcsónakon a partra és tanácsára elkezdik a szigetlekók evakuálását a hajóra.

A zsoldosok Bent a helikopterhez viszik. Az értékes foglyot azonban nem tudják elvinni a szigetről, mert eddig bujkáló társai rajtaütnek az egységen és kiszabadítják vezetőjüket. Ben szabad elvonulást biztosít Jackéknek, akik segítettek neki a kiszabadításban. Lock és Ben ezután hozzálát a sziget áthelyezéséhez.

Ben végzetes hibát követ el, amikor megöli a zsoldosvezért, akinek halála működésbe hozza a hajón elhelyezett pokolgépet. Desmondéknak nem sikerül megállítani a szerkezet felrobbanását, amelynek Jin és Michael esik áldozatául. A többiek a helikopterrel az utolsó pillanatban tudnak csak elmenekülni, de üzemanyag híján ők sem jutnak túl messzire és az óceánba zuhannak.