得知查理临死前的信息后，部分幸存者开始思索到底是否该信任娜欧米等人，因此从大队分裂了出来。前叙里，赫利获救之后，几位他不愿意见的人来探望他。

幸存者们遇到了来访的娜欧米队员——麦尔斯、弗兰克、丹尼尔和夏洛特。回忆里描述了娜欧米和以上四人生活中奇妙的故事。

凯特从麦尔斯获得了一些资料，结果令她被洛克赶走。在前叙中，凯特养育著克莱尔的儿子艾伦，和她接受审判。

萨伊德和德斯蒙德在前往货轮时遇到乱流，结果令德斯蒙德出现了一些出乎意料的副作用。在时间旅行的闪影中，德斯蒙德回到他当军人的时候。

一个茱莉叶不喜欢的旧人探访了她，并带给她指令：找到夏洛特和法拉第，不计代价，必须阻止他们完成其任务。同时，宾向洛克叙述了关于查尔斯·威德摩的资料。回叙中显示茱莉叶与古德温的外遇，以及她和古德温的妻子哈柏、宾的关系。

茱莉叶为了阻止善华搬去洛克的营地，结果向真秀透露了一些善华的秘密。同时，萨伊德和德斯蒙德在见识到货轮的船长后，开始了解到货轮上人员的企图。回叙中，真秀必须完成送礼的工作。前叙中，善华生下了一个女儿。

萨伊德遇到宾在货轮上的间谍，另外宾劝导他女儿艾莉克斯和丹妮艾尔、卡尔一同逃走，以避开即将来临的攻击。回叙显示，麦可在离开小岛和登上货轮的过程。

洛克的营地遭到攻击，宾的女儿艾莉克斯被俘作人质，克米以她威胁宾投降，最后杀害了她。而杰克想找出被冲上海岸的尸体的身份。在前叙中，宾招揽了萨伊德作为刺客，以及他遇到查尔斯·威德摩。

当杰克的健康十分恶化时，凯特和茱莉叶必须要合作，以拯救杰克。而索耶、克莱尔和米尔斯则离开了洛克，正在返回沙滩营地的路途上。前叙中，杰克开始失去他的理智，并从赫利中得知查理给他的口信，而且他和凯特的关系亦开始崩解。

洛克在探访雅各的小屋后，得知他必须移动小岛。另外，货轮上的人们的生命变得十分危险，因为雇佣兵在船上发生兵变。回叙中，年轻的洛克遇到理查，以及他瘫痪后遇到马修·亚巴顿。

幸存者们绝望地试图逃离小岛，而宾谋划去迎击Kahana上的雇佣兵。前叙则显示海洋航空六人组回到世界的情况。

在潘妮的拯救下，杰克、凯特、萨伊德、赫利、善华、艾伦、德斯蒙德和法兰克逃离了小岛，而宾和洛克则成功移动了小岛。前叙中，洛克探访了海洋航空六人组和华特。