Trosečníci začínají poznávat tajemství ostrova. Jack, Charlie a Kate se vydávají do temného nitra džungle, aby se pokusili najít leteckou vysílačku. Brzy však zjistí, že i hrdinové mají svá tajemství.

Poté, co trosečníci uniknou stvoření, které je pronásledovalo, a získají vysílačku, vydají se do vyšších poloh, aby mohli vyslat signál. Brzy zachytí záhadnou zprávu a setkají se s jedním z obyvatel ostrova.

Jack a Hurley odhalí tajemství o Kate. Šerifův život visí na vlásku. Někteří trosečníci přemýšlejí o záhadách ostrova, které odhalili. Michaela trápí, že se Walt spřátelil s Lockem.

Locke jde ulovit něco k jídlu a při této výpravě je jeden z trosečníků zraněn. Tajemství o Lockovi je odhaleno. Někteří trosečníci jsou zděšeni Jackovým plánem, jak naložit s mrtvými těly, která jsou stále roztroušena mezi troskami letadla.

Jack má problém překonat události, které ho přivedly do Austrálie. Boone se dostane do zrádného vlnobití, když se snaží zachránit ženu, která si šla zaplavat. Claire je velmi dehydrovaná a někdo asi ukradl poslední zásoby vody.

Když je Michael zbit, jsou ostatní v šoku, ale pravdu o útoku znají jen Jin a Sun, kteří neumějí anglicky. Kate, Jack, Sawyer a Sayid se dohadují o tom, kde by se měli trosečníci utábořit. Locke odhalí Charlieho tajemství.

Charlie si začíná s Lockovou pomocí odvykat od závislosti na drogách. Trosečníci se snaží najít a osvobodit Jacka pohřbeného zaživa v sutinách zavalené jeskyně. Někdo asi maří plány trosečníků pokoušejících se zjistit původ zprávy, kterou zachytili.

Shannon potřebuje nový inhalátor a Boone se domnívá, že zbývající tři má Sawyer ve svých věcech. Když je Sawyer odmítne vydat, Jack a Sayid se rozhodnou ho mučit.

Sayidův život se ocitne ve vážném nebezpečí poté, co narazí na zdroj záhadné francouzské zprávy z vysílačky – Danielle Rousseauovou.

Claire trápí strašlivá noční můra o tom, že jejímu už narozenému dítěti někdo ublížil nebo ho unesl. Flashbacky odhalují Claiřinu minulost.

Trosečníci přemýšlejí, kdo mohl unést Charlieho a Claire, a z jakého důvodu. Následně se do zrádné džungle vydává pátrací skupina, aby dvojici našla. Hlavním podezřelým je Ethan.

Locke se dozví, že Boone chce Shannon prozradit jejich tajemství, a rozhodne se dát mu lekci. Temná minulost Boona a Shannon je odhalena. Kate nejde do hlavy Sunino záhadné chování a zjištění, že umí anglicky.

Když se Michael a Locke nepohodnou kvůli Waltově výchově, dojde k násilnému konfliktu a znovu se objeví tajemná šelma. Charlie je mezitím v pokušení přečíst si deník zmizelé Claire.

Poté, co se Claire vrátí a nepamatuje si, co se událo od jejího nástupu na palubu havarovaného letadla Oceanic 815, vypracují Jack a Locke plán na obranu proti jejímu únosci.

Kate a Sawyer si navzájem prozradí temná tajemství, zatímco stopují kance, o kterém si Sawyer myslí, že ho záměrně obtěžuje.

Vor, který trosečníci stavěli, záhadně shoří a Michael je přesvědčen, že v tom má prsty Jin. Sun učiní překvapivé přiznání. Boone varuje Sayida před Shannon. Dozvídáme se podrobnosti o problematickém manželství Jin a Sun.

Když Hurley začne být posedlý Francouzkou a vydá se ji hledat do džungle, nezbývá Jackovi, Sayidovi a Charliemu než ho následovat.

Locke si myslí, že mu někdo poslal znamení, jak otevřít poklop, a vydá se s Boonem do vnitrozemí.

Jack ošetřuje těžce zraněného Boona poté, co ho Locke odnese zpátky do jeskyně. V nastalém zmatku se Locke vytratí, aby se vypořádal s pocitem viny.

Po dalším pohřbu vzrůstá napětí, trosečníci se začínají navzájem podezřívat a jeden z nich přísahá pomstu.

Když se Michaelovi při stavbě voru udělá hrozně zle, tuší v tom Jack něco nekalého. Mezi podezřelými jsou i Sawyer a Kate, kteří soupeří o poslední místo na voru.

Zatímco Michael a Jin připravují vor na plavbu, objeví se znenadání Francouzka a ohromí trosečníky hrozivým varováním před „těmi druhými“.

Na moři překvapí výpravu na voru něco nečekaného. Ti, co zůstali na ostrově, se snaží vyhodit do povětří poklop. Ve finále první série by jistý návštěvník tábora mohl ohrozit Claiřina novorozeného syna.