Een golf van spanning: Loïs, ChIoë en Lex zijn in gevaar als de Reeves Dam doorbreekt. De ontsnapte gevangene uit de Phantom Zone, die Clarks DNA heeft gestolen, moet worden tegengehouden. Maar hoe? Martian Manhunter heeft een idee.

Blond, mooi en een foute houding. Als ze eindelijk stopt met Clark het volgende millennium in te slaan, heeft Kara nog het een en ander in te halen. Ze komen tenslotte uit dezelfde Kryptonfamilie.

Clark waarschuwt Kara om zich gedeisd te houden en leert haar hoe ze haar krachten onder controle kan houden. En dus schrijft ze zich in voor de badpakkenverkiezing Miss Sweet Corn, niet helemaal wat Clark in gedachten had. De liefde, en Lana, keren terug in Clarks leven.

Een probleem met een meteoor? Een neurochirurg beweert dat hij door een meteoor geïnfecteerde mensen weer normaal kan maken. Lana verbergt een geheim van 10 miljoen dollar en ChIoë en Jimmy koersen af op ruzie.

Lichten, camera - Smallville is in rep en roer wanneer een filmploeg een film komt opnemen die gebaseerd is op de strip Warrior Angel. Wanneer Clark dezelfde heldhaftige avonturen als de stripheld beleeft, blijkt Lionel nog in leven te zijn!

Als ze gevangen wordt genomen en een Kryptonietwaarheidsserum krijgt toegediend, beleeft Kara verrassende herinneringen aan haar tijd voordat ze op aarde kwam, herinneringen die Clark onbedoeld opvangt en met haar deelt terwijl hij haar probeert te bevrijden.

Dit is fantastisch! Lana is uitgelaten, maar Clark is op zijn hoede als ze na een toevallige blikseminslag wat van Clarks krachten krijgt. Het angstige voorgevoel van onze held blijkt terecht: Lana wordt overmoedig en wil proberen Lex te vernietigen.

Is Clarks beoordelingsvermogen vertroebeld door menselijke gevoelens? Hij trapt in een list van Zor-El en raakt verwikkeld in een gevecht bij het Fort van Eenzaamheid. De link tussen Lex en redacteur Grant van de Daily Planet komt aan het licht!

Als Clark na een wekenlang verblijf bij het Fort terugkeert, is er iets aan hem veranderd. Er is weinig veranderd aan Grant en de gevangene van Belle, die een bom op Chloe plant.

Een vogel en geheimen worden losgelaten. Lex roept de hulp in van de mysterieuze Zwarte Kanarie/Dinah Lance. Loïs ontdekt de waarheid over Olivers alter ego. Clark en Lana worstelen om de Phantomzaak achter zich te laten.

Lex is gewond en ligt in coma nadat hij Kara heeft opgespoord, dus gebruikt Clark een experimentele techniek om zijn geest binnen te dringen en er achter te komen waar Kara zich bevindt. Misschien komt hij er wel nooit meer uit. Lex krijgt een hartstilstand en Clark zit in hem gevangen.

Kijk eens wie er terug is. Clark is blij om zijn oude schoolvriend Pete Ross weer te zien. Hij is ontzet als hij ontdekt dat Pete een meteoorkracht heeft ontwikkeld waardoor hij kwetsbaar wordt voor profiteurs als Lex.

Iemand heeft Clark te pakken. Nu komen Lana en ChIoë in actie. Ze beseffen dat alleen een opgepepte Kara Clark uit handen van zijn ontvoerders kan redden, en brengen haar naar het Fort om haar krachten te laten herstellen. De Luthors krijgen het met elkaar aan de stok over het geheime genootschap Veritas.

Brainiac weet hoe hij Kara moet overtuigen zich bij hem aan te sluiten: iemand die haar en Clark dierbaar is iets aandoen. Lex herinnert zich gebeurtenissen die met Veritas te maken hebben. Jimmy en Lois passen verschillende aanwijzingen in elkaar bij hun onderzoek naar de dood van Patricia Swann.

Lex is erop gebrand het geheim van Veritas te ontrafelen. Zelfs als hij hiervoor een heilloze weg moet inslaan. Zelfs als hij hiervoor iemand uit zijn omgeving moet vermoorden. Dan duikt er een andere moordenaar op, een mysterieuze figuur die vastbesloten lijkt Clarks geheim te beschermen.

Agenten halen Jimmy over ChIoë te bespioneren vanwege haar verdachte computeractiviteiten. Kara stuurt Clark een vreemd bericht... vanaf Krypton. Lex bemachtigt eindelijk het safeloket met dubbele sloten en maakt het open.

Clark reist door de tijd naar Krypton voor een confrontatie met Brainiac, maar beleeft eerst een visioen waarin hij heen en weer schiet tussen verschillende realiteiten. Hij ziet hoe de wereld er zonder Clark Kent uit zou zien, een wereld waarin de persoon met zijn vinger op de rode atoomknop de Amerikaanse president Lex Luthor is.

Een vreemde aanvaller uit Zürich slaat opnieuw toe. Dit keer laat hij mysterieuze Kryptoniaanse symbolen achter die hij in Lex' borst gekerfd heeft. Clark brengt de symbolen in verband met een kathedraal in Montreal... en komt in groot gevaar als hij daar aankomt.

Is Kara echt Kara? En zo niet, wie is ze dan wel? Wordt Jimmy het schoothondje van Lex? Of zal hij zich tegen zijn chantage verzetten? Blijft Lana Clarks eeuwige liefde? Of verdwijnt ze voorgoed? Zal Lex de waarheid die hij uiteindelijk ontdekt accepteren? Of wordt hij erdoor over de rand van de waanzin gedreven?