Drei Monate sind vergangen, und in Smallville ist nichts mehr wie es war. Clark ist nach wie vor verschwunden, seitdem er in die Höhlenwand hineingezogen wurde, Jonathan liegt im Koma, Lionel wartet im Gefängnis auf seinen Prozess, und Chloe ist bei der Explosion umgekommen.

Clark returns to Smallville as Kal-El - intent on fulfilling his destiny, he goes after a powerful kryptonian crystal that Lex has obtained in Egypt. Meanwhile, newcomer Lois Lane arrives in Smallville to look into the death of her cousin Chloe, and Lana returns from Paris with a new boyfriend. Jonathan lies in a coma after the events of last year's season finale and Lionel must deal with his new life in prison.

Tres meses después del último episodio, Lois Lane, la prima de Chloe Sullivan, conduce hacia Smallville para intentar que Clark Kent le ayude a hallar al asesino de Chloe. Después de ser alcanzada por un rayo, pierde el control de su vehículo y se encuentra con Clark, desnudo en un campo de trigo, con amnesia. Ella le lleva al Hospital de Smallville, donde se encuentra a Martha con Jonathan, que está en coma. Martha se lleva a Clark de vuelta a la granja, con la esperanza de que recupere la memoria, sin embargo, Clark está deshumanizado. Mientras tanto, Lana tiene novio en Paris y se lo está pasando muy bien con él.

Alors que Lois Lane est en chemin pour Smallville afin d'enquêter sur la mort de sa cousine Chloe, elle tombe sur un Clark reprogrammé en Kal-El... Trois mois après son attaque, Jonathan est toujours dans le coma. Le médecin, pensant qu'il n'y a plus rien à faire pour lui, tente de convaincre Martha de débrancher la machine qui le maintient artificiellement en vie... A Paris, Lana s'est découvert un nouveau petit ami du nom de Jason. Et Lex est sur la trace de mystérieux artefacts...

קלארק חוזר לסמולוויל כקאל-אל. לויס ליין מגיעה לסמולוויל כדי לחקור את מות בת דודתה, קלואי סאליבן. לאנה שבה מפריס וג'ונתן שקוע בתרדמת בבית החולים. ליונל לות'ר ממתין למשפטו בבית הכלא.

Clark ritorna a Smallville come Kal-El, figlio di Jor-El, intenzionato a compiere il suo destino e ruba un cristallo Kryptoniano che appartiene a Lex. Nel frattempo Lois Lane, la cugina di Chloe, arriva a Smallville per scoprire la verità sulla morte di Chloe. Lana ritorna dall'Europa mentre Jonathan è ancora ricoverato in ospedale, in coma. Lionel Luthor è finamente in prigione e sta imparando ad adattarsi alla sua nuova vita.

Hij is klaar om zijn gruwelijke lotsbestemming uit te voeren. Clark keert naar Smallville terug als zijn alter ego, Kal-El...maar misschien kent Martha wel een manier om hem weer in zijn vorige ik te veranderen. Lois Lane komt het vermoedelijke overlijden van Chloe onderzoeken.

Clark volta para Smallville reprogramado como Kal-El. Intencionado a cumprir o seu destino, Kal-El atinge os céus para roubar um poderoso cristal de kryptonita.

Кларк возвращается в Смолвиль, перепрогамированный в Кал-Эла. Полный решимости исполнить своё предназначение, Кал-Эл летит к небу, чтобы украсть мощный кристалл с Криптона. Тем временем Лоис Лейн приезжает в город, чтобы расследовать убийство своей кузины Хлои. Также Лана возвращается из Парижа с новыми планами и новым бойфрендом. Джонатан находится в коме. Лайонел сталкивается с новой страшной жизнью в тюрьме.

Clark se vrací do Smallville jako Kal-El - chce naplnit svůj osud a vydává se za mocným kryptonským krystalem, který Lex získal v Egyptě. Mezitím do Smallville přijíždí nováček Lois Laneová, aby vyšetřila smrt své sestřenice Chloe, a Lana se vrací z Paříže s novým přítelem. Jonathan leží v kómatu po událostech z loňského finále a Lionel se musí vyrovnat s novým životem ve vězení.