Morgenstern, le chef des urgences, est victime d'une crise cardiaque. En attendant son rétablissement, Weaver le remplace, au grand déplaisir de certains de ses collègues. Deux nouveaux médecins viennent renforcer l'équipe : Anna Del Amico et Elizabeth Corday, une chirurgienne britannique. Ross demande Carol en mariage. Weaver suit un séminaire pour améliorer ses compétences en management d'équipe. Alex Kingston et Maria Bello complètent la distribution d'une saison qui s'est installée durablement dans le paysage audiovisuel.

Sous morphine, le docteur Morgenstern ne peut plus assurer ses fonctions de chef des urgences. Il confie de nouvelles responsabilités à Weaver. De son côté, Greene rencontre de sérieuses difficultés dans son travail. Ne réussissant pas à remonter la pente, il se sent incapable de formuler des diagnostics devant ses patients. Ses collègues du service des urgences sont inquiets à son sujet et se demandent bien comment il va pouvoir retrouver une activité normale. De son côté, Benton est maintenant rassuré quant à l'avenir de son fils. Avec Carla, il ne lui reste plus qu'à choisir un prénom pour le nouveau-né...

Rien ne va plus à l'hôpital, où les médecins du service des urgences doivent assumer quotidiennement les consultations. Carter accuse le docteur Maggie Doyle de faire du charme à Anna. Pendant ce temps, l'ex-mari de Jeanie se voit contraint d'avouer sa séropositivité à Bill, un de ses collègues. La liaison de Ross et Hathaway étant restée secrète, cette dernière réagit mal lorsque Corday, une nouvelle, demande à Ross de lui faire visiter la ville. Durant l'absence de Morgenstern, le docteur Donald Anspaugh, chef de service, décide de nommer Weaver pour le remplacer...

Greene assume comme il peut la garde de sa fille. Mais son ex-femme Jennifer a décidé de lui mettre des bâtons dans les roues. Elle s'oppose désormais à ce qu'il voie la petite. Greene ne peut se résoudre à cette extrémité. Benton et Carla, quant à eux, sont soulagés. Ils peuvent enfin emmener leur enfant chez eux. Benton installe du matériel médical à domicile et initie Carla aux rudiments pédiatriques. Mais les ennuis refont rapidement surface. Benton a une vive altercation avec Carter. Il déplore que celui-ci ait mis un terme à son internat de chirurgie, après tout le temps qu'ils ont passé ensemble...

Au sein du service des urgences, Carol Hathaway propose d'ouvrir une section réservée aux femmes et aux enfants. Weaver trouve son idée intéressante mais, pour la réaliser, il faut un bon financement. Anspaugh demande à Benton de quitter la salle d'opération parce qu'il n'est pas dans les dispositions idéales pour pratiquer des interventions. Benton a en effet beaucoup de mal à assumer son travail, car il passe ses nuits à veiller son bébé. Au cours du procès Kenny Law, Greene fait sa déposition. De son côté, Carter commence à s'interroger sur son choix de carrière. N'aurait-il pas mieux fait de s'orienter différemment ?...

Jeanie ne parvient pas à retrouver du travail à Chicago. Al lui conseille de se rendre à Atlanta, où un ami lui propose un poste. L'hôpital a enfin réussi à dénouer l'affaire Kenny Law. Malheureusement, la famille de la victime accuse toujours Greene de violation des droits civils. Greene a énormément de mal à digérer cette situation. Hathaway reçoit une aide financière de Millicent Carter, la grand-mère de Carter, pour son projet d'accueil réservé aux enfants. Ross apprend que son père s'est tué dans un accident de voiture en Californie. Il demande à Greene de l'accompagner pour rapatrier le corps...

Ross doit abandonner les couloirs de l'hôpital pour organiser les funérailles de son père, tué dans un accident de la route. Greene l'accompagne dans ces douloureuses démarches. Au cours du voyage à travers le désert de Californie, les deux médecins évoquent leurs familles. Ils décident alors de rendre visite aux parents de Greene, qui résident à San Diego. Au poste de police, Ross apprend que son père présentait un taux d'alcoolémie quatre fois supérieur à la normale, qu'il roulait trop vite et qu'il n'a pas respecté un panneau de signalisation. Sa passagère, ainsi que le chauffeur du camion qu'il a percuté de plein fouet, sont morts sur le coup...

Récemment licenciée pour « raisons économiques », Jeanie découvre le véritable motif de cette décision : sa séropositivité. Folle de rage, elle souhaite en parler au plus vite avec Weaver et Anspaugh. Scandalisée par la situation, Maggie Doyle lui conseille de consulter l'association de défense gay et lesbienne. De son côté, Greene remet un mot doux à Hathaway, de la part de Ross. Cynthia trouve la lettre par mégarde et croit qu'elle lui est destinée...

Le métier de médecin s'apparente parfois à celui de prêtre. Le docteur Carter fait les frais de son devoir de réserve. Il prend la défense d'un patient qui a maille à partir avec la justice. Il se retrouve, dès lors, accusé de rétention d'informations et d'obstruction au travail du juge. Des policiers viennent l'arrêter pour refus de collaborer. De son côté, Jeanie retrouve son poste grâce aux activistes homosexuels. Aux dernières nouvelles, Synergix emménage aux urgences. Greene, débordé, demande à Cynthia d'emmener Rachel chez le coiffeur. Quand il revoit sa fille, il est surpris par sa nouvelle coupe «radicale». Weaver refuse des médicaments anti-douleur à un patient, supposant qu'il réclame des drogues, et le laisse partir...

C'est Noël. Malgré l'ambiance de fête qui règne dans la ville, les urgences de l'hôpital ne désemplissent pas. Bien au contraire, il semble que le sort s'acharne sur des innocents. Pourtant, des cas désespérés sont mystérieusement sauvés d'une mort certaine. Les médecins commencent à croire aux miracles. De leur côté, Ellis et Weaver partagent un moment d'intimité qui devient vite romantique. Cynthia, en pleine discussion avec Carter, finit par lui avouer un secret qu'elle gardait jusqu'alors pour elle. Carter ne sait pas comment réagir. Ross et Carol discutent, quant à eux, de leur relation. Ce que l'un en attend n'est pas forcément ce que l'autre en espère...

Les choses se précisent pour Ross et Carol. Après avoir longuement débattu de l'avenir de leur relation, ils s'estiment tous deux prêts pour le mariage. Ross semble toutefois plus pressé que Carol et souhaite même avancer la date de leur mariage. Carol, quant à elle, n'est pas sûre de vouloir précipiter les choses. La discussion sur un thème aussi sensible pourrait bien tourner au vinaigre. De son côté, Anspaugh apprend que son fils a besoin d'une surveillance médicale. Quant à Corday, elle s'inquiète au sujet des cordes vocales d'une jeune patiente...

Le docteur Ross a décidé de faire une surprise à Carol Hathaway. Il compte l'emmener dans une auberge romantique pour un mariage improvisé. Greene sera son témoin. Mais Ross ignore que Carol a récemment sympathisé avec Greg Powell, un infirmier doté d'un certain charme. Pendant ce temps, le cousin de Carter semble vouloir surmonter sa dépendance à la drogue...

Le violeur en série est enfin arrêté. Son état critique nécessite des soins urgents, que le docteur Carter et son équipe ne consentent à lui administrer qu'à contre-coeur. Par ailleurs, en dépit des admonestations de Weaver, le conseil de l'hôpital vote pour la négociation avec Synergix, en vue de lui donner la direction du management. Weaver en vient alors à accuser Ellis de lui avoir fait la cour uniquement pour favoriser la négociation. Ellis, choqué, dément et donne immédiatement un coup d'arrêt aux tractations. Jerry est autorisé à reprendre le service de jour. Cynthia informe Greene que son propriétaire veut qu'elle signe un bail de six mois...

En s'envolant pour San Diego, Greene croit n'avoir qu'à réconforter sa mère, qui s'est blessée au genou à la suite d'une mauvaise chute. Cynthia le rejoint par le vol suivant. Sur place, Greene découvre l'ampleur réelle du désastre. Sa mère, immobilisée dans un fauteuil roulant, présente, aux dires des médecins, des signes de démence, et son père souffre d'un emphysème en voie d'aggravation. Greene est obligé de le faire admettre à l'hôpital naval. C'est alors qu'il apprend qu'un hélicoptère militaire s'est écrasé en ville...

Greene réussit à retrouver Cynthia, qui a démissionné de l'hôpital. Il la prie de l'excuser et lui avoue qu'il a besoin d'elle. Cynthia s'interroge. Se pourrait-il que Greene soit réellement amoureux d'elle ? Pendant ce temps, un patient atteint d'un cancer des poumons se suicide au service des urgences. Ebranlé, Greene se demande s'il ne devrait pas arrêter de fumer. Ross présente son mémoire de recherche devant une assemblée de pédiatres. Weaver y décèle des approximations et le prie de revoir sa copie...

Jeanie débarque aux urgences, avec Scott à l'agonie. Ross pratique une douloureuse biopsie de la moelle épinière, qui révèle que le cancer de Scott a récidivé. Hathaway demande à ses collègues de se soumettre à des tests, afin de pouvoir procéder à une greffe osseuse. Un mari paniqué arrive avec sa femme enceinte. Karen vit une grossesse difficile, et Anna veut la mettre sous traitement pour calmer douleurs et vomissements, qui mettent la vie du bébé en danger, mais elle refuse. Son mari, Dave, accuse Anna de penser plus à l'enfant qu'à sa mère. Alors que le docteur Morgenstern peut reprendre le travail, Ross songe quant à lui à abandonner son internat aux urgences pédiatriques afin d'obtenir un poste fixe...

Ross convoite le poste fixe de pédiatre qui vient d'être créé. De son côté, Del Amico, que le sort de Scott inquiète vivement, se propose comme donneuse et demande à Carter d'effectuer l'intervention. Un test révèle l'incompatibilité de son sang. Cependant, celui-ci semble correspondre à l'ADN d'un autre malade. Del Amico accepte de se soumettre à la douloureuse opération au bénéfice de ce dernier. Jeanie suggère un nouveau traitement pour Scott et comprend subitement qu'il est amoureux d'elle, parce qu'il accepte l'expérience alors qu'il ne veut plus entendre parler de chimiothérapie. Pendant ce temps, Greene s'occupe de l'organisation du banquet annuel qui, à la satisfaction de tous, réunit le service des urgences au grand complet...

Benton a été suspendu par la direction du Cook County Hospital après qu'il a admis avoir évincé le docteur Morgenstern du bloc opératoire au cours d'une intervention délicate. Le patient, le docteur Swanson, est décédé au cours de l'opération, mettant le chirurgien dans une position plus que délicate. Mais le personnel n'a guère le temps de s'apitoyer sur le sort de Benton : un attentat contre une clinique du planning familial met tout le monde en alerte. Une des victimes était en train de subir une IVG lorsque la bombe a explosé et il s'agit de terminer l'intervention pour la mettre hors de danger. C'est Kerry Weaver qui, devant le refus de Del Amico de procéder à l'avortement, se charge de l'opération...

La veille du baptême de son fils Reese, Peter Benton sort avec Elizabeth Corday et entame une liaison avec elle. Dès le lendemain, Corday éconduit le docteur Romano qui, une fois de plus, lui a fait des avances pressantes. Mais Eros fait rapidement place à Thanatos : un gardien nommé Paul Canterna arrive aux urgences couvert de brûlures d'origine chimique. Greene réserve son verdict, mais tout porte à croire que le malheureux n'a plus que quelques heures à vivre. Emue, Hathaway décide de veiller le patient jusqu'à son décès. Au même moment, Kerry Weaver est contrainte d'informer une patiente de près de 70 ans qu'elle est atteinte du VIH, chose qu'elle a découverte par hasard après lui avoir prescrit par erreur le test sanguin du SIDA...

Jeanie, contaminée par le virus du SIDA, craint que la maladie ne se déclare et fasse chuter son taux de lymphocytes T4. Les résultats des examens qu'elle a passés la rassurent. Elle est en parfaite santé. De leur côté, Benton et Corday ont du souci à se faire. Ils pensent avoir été vus par Romano en train de s'embrasser dans les vestiaires. Les informations circulent vite dans les couloirs de l'hôpital, et ce genre de nouvelle pourrait leur valoir des ennuis. Le docteur Rosher, ancien chef de Del Amico à Philadelphie, travaille sur la possible implantation d'un service pédiatrique. De grande envergure, ce projet devrait créer plusieurs emplois et renforcer la renommée du complexe hospitalier...

Le service de pédiatrie de l'hôpital est en alerte. Josh, un bébé âgé de six mois, a dû subir un traitement de désintoxication. Sa fragilité empêche les médecins de faire un pronostic. Mais avec le temps, Josh devrait aller mieux. De son côté, Carol Hathaway n'imagine sans doute pas ce qui l'attend. Elle découvre, en effet, une scène horrible qui la marque profondément. Quant à Corday et Romano, ils n'en finissent pas de gérer leurs problèmes. Ils sont incapables de trouver une solution acceptable...