Le docteur Pratt est en voiture avec le docteur Chen et Elgin lorsqu'il est pris pour cible par un tireur embusqué. En essayant d'éviter les balles, il perd le contrôle du véhicule, qui finit sa course dans la rivière. Les trois occupants sont piégés sous l'eau. Lorsque les secours parviennent enfin à les sortir de là, ils sont tous les trois dans un état critique. Au County Hospital, Elgin est pris en charge par Abby, qui entame son premier jour. Entretemps, Sam a décidé de changer de vie et part avec Alex, son fils. Aux urgences, le personnel apprend avec surprise le retour de Neela. Quant à Carter et Kem, ils ne parviennent pas à faire face à la mort de leur enfant...

Carter demande à Kem de l'épouser, mais elle refuse catégoriquement. Dépressif, souffrant d'insomnies, le médecin craque et s'effondre en pleurs dans les bras de Luka. De leur côté, Abby et un nouvel interne prennent en charge un adolescent d'origine espagnole arrivé aux urgences avec un bras complètement disloqué. Abby se pose des questions sur la façon dont l'accident est survenu, mais la barrière linguistique rend sa démarche difficile. Neela, quant à elle, ne sait toujours pas quelle voie choisir entre la médecine et la comédie. Elle emménage provisoirement chez Abby...

Le 4 juillet, jour de la fête nationale, le personnel des urgences est surchargé. Alors que Carter l'a renvoyé chez lui quelques heures plus tôt, le docteur Pratt est de retour parmi ses collègues, une large cicatrice lui barrant le front. Abby veut que des analyses soient pratiquées sur des patients de Ray. Pendant ce temps, le docteur Dubenko, nouvel interne, refuse de pratiquer un don d'organes entre patients séropositifs. Il s'agit en effet d'une pratique illégale. Carter tente de persuader Corday d'effectuer l'opération. Howard, un nouvel interne, prend son service. Ses collègues se demandent s'il ne souffre pas de troubles obsessionnels compulsifs...

Pratt donne pour consigne aux docteurs de traiter au moins 25 cas durant leur service. Poussé jusqu'à ses limites, Ray tente de tenir l'objectif, mais doit réduire le temps passé avec les patients. Dans la précipitation, il donne son aval à un prélèvement d'organes sur un patient décédé sans demander explicitement l'accord de sa veuve. C'est dans ce contexte tendu que Neela effectue son premier jour aux urgences. Elle éprouve des difficultés à suivre le rythme effréné de ses collègues. Confrontée à un patient qui a eu des relations sexuelles non protégées, Abby fait appel à Ray pour lui fournir rapidement un traitement médical...

Kovac, Abby et Sam soignent Charlie Metcalf, ancien prisonnier et alcoolique, qui se plaint de violentes douleurs au niveau de l'estomac. Victime d'une hémorragie massive, il refuse l'acharnement thérapeutique...

Luka et Samantha s'installent enfin tous les deux, mais leur bonheur est contrarié par un grave incident. Une femme est amenée dans un état critique à la suite d'un viol. Sam prend son cas très à coeur et tente de la soigner, mais la patiente décède lorsque l'infirmière essaie une méthode risquée pour lui permettre de parler. Luka décide de couvrir la jeune infirmière. Susan Lewis, pour sa part, est sollicitée pour assumer davantage de responsabilités au sein du service des urgences mais a du mal à s'adapter. De leur côté, Carter et Abby prennent en charge une jeune Asiatique qui nie être enceinte malgré l'évidence...

Un policier blessé par balles est amené aux urgences. Son fils de 15 ans est le seul à pouvoir décider de son traitement. Dans le doute, il se tourne vers Ray pour lui demander conseil. Pendant ce temps, Carter et Wendall partent faire de l'escalade. Luka s'investit de façon plus active dans la vie d'Alex depuis qu'il a été renvoyé de l'école. En dépit de sa fatigue extrême, Chen vient travailler. Pratt la surprend en train de voler du potassium dans la réserve...

Noël se rapproche à grand pas mais les patients ne cessent pour autant d'affluer aux urgences. Abby ausculte une femme qui vit avec sa famille dans une voiture et qui présente une maladie grave attaquant le coeur et les poumons : le lupus. Confrontés à d'autres questions, Carter et Wendall échangent un baiser maladroit. Il leur reste à décider ce que ce geste signifie. De son côté, Chen veut demeurer au chevet de son père, gravement malade. Il lui faut donc absolument trouver quelqu'un qui puisse prendre son service, pour pallier ses absences. Lorsqu'elle se retrouve dans l'obligation de quitter ses fonctions, elle se demande si le plus sage ne serait pas d'accepter la requête pressante de son père : l'euthanasie...

Abby est kidnappée par un gang et contrainte à soigner un jeune voyou blessé par balles. Mais la jeune femme n'a pas sa trousse médicale et ne peut pas suturer la plaie. L'homme succombe à ses blessures...

Luka et Susan ont pour tâche de former les internes afin qu'ils deviennent plus autonomes. Susan passe son temps à les surveiller et plusieurs d'entre eux se crispent sous son regard exigeant. Luka semble plus détendu aux côtés de Neela, l'interne placée sous son autorité. La jeune femme tombe rapidement sous le charme et se prend à rêver d'une aventure avec Luka. Lorsque deux adolescents sont amenés dans un état grave, Neela commet une grossière erreur en annonçant le décès de l'un d'eux aux parents de celui qui a survécu à ses blessures. De son côté, l'avocat Herb Spivak rôde à nouveau dans les urgences à la recherche de patients mécontents des soins reçus...

Neela est amoureuse de Luka. Abby a un faible pour Jake, lequel lui confie qu'il compte arrêter l'école de médecine. Katie, âgée de 16 ans, arrive aux urgences avec son père. Cette jeune transplantée rénale est de nouveau sous dialyse après qu'un médecin a testé un nouveau médicament sur elle. Carter est furieux...

En examinant un garçon, Pratt découvre qu'il a une sérieuse blessure sur le corps. Le petit Thomas, accompagné par sa belle-mère, explique au médecin qu'il s'est fait mal en escaladant maladroitement une clôture. Cette explication ne parvient pas à convaincre Pratt. Il fait appeler Wendall pour voir si l'enfant ne cache pas quelque chose de plus grave. Mais ils constatent que Thomas est reparti avec sa belle-mère. Parallèlement, un homme, blessé par balles, est amené aux urgences. Pratt et Kovac examinent sa plaie, et Dubenko le fait admettre en chirurgie. De son côté, Abby apprend que Jake va travailler de nuit avec Neela. Thomas est ramené aux urgences, il a été battu à mort...

Jake et Dubenko prennent en charge une jeune femme qui présente une vingtaine de blessures dans le dos, infligées avec un tournevis. Weaver rencontre une patiente, Helen Kingsley, qui lui confie qu'elle est sa mère biologique. Enceinte à 15 ans, elle a confié son bébé à l'adoption. Helen est une fervente catholique et lorsque Weaver lui révèle qu'elle est homosexuelle, la situation devient très tendue. Carter et Neela reçoivent une femme, accompagnée par son mari. Celle-ci souffre de douleurs au niveau du cou à la suite du déménagement qu'elle vient d'effectuer. Le couple semble sous l'emprise du démérol...

Seule à son domicile, Ellie Shore, mère de trois enfants, s'effondre, victime d'une attaque cérébrale. Samantha Taggart et Luka Kovac la prennent en charge, mais il leur faut l'accord de son époux. En effet, les chirurgiens ne peuvent entreprendre l'opération du cerveau dont Ellie aurait besoin dans les plus brefs délais, sans l'autorisation de la famille. Neela Rasgotra voit arriver au County Hospital un garçon blessé au poignet. Inquiet, son père ne tarde pas à le chercher. Mais il est visiblement sous l'emprise de l'alcool. Faut-il prévenir les services sociaux ? De son côté, Carter froisse involontairement Wendall à cause d'un appel malvenu...

En Irak, une petite fille est grièvement brûlée par l'explosion d'un camion piégé. Faute de pouvoir lui donner les soins nécessaires, Michael Gallant essaie de l'envoyer aux Etats-Unis, mais les autorités refusent de lui fournir un visa. Désespéré, Gallant fait appel à Neela, grâce à un téléphone satellite récupéré sur un soldat. Neela s'arrange pour faire autoriser l'admission de la fillette et de sa mère au County Hospital. Gallant bénéficie d'une permission de 72 heures pour accompagner la petite fille. Neela est folle de joie...

Neela est déçue de constater que Michael Gallant est venu à l'hôpital sans passer la voir. Mais il y retourne bientôt et accepte de passer un peu de temps avec elle. Samantha découvre que Steve, son ex-mari, est revenu à Chicago. Il ne tarde pas à refaire son apparition dans la vie de la jeune infirmière. Frank, qui s'est renseigné, révèle à Luka que cet homme est recherché au Colorado. De son côté, Carter a investi de l'argent dans une clinique qui se préoccupe davantage de son image que de la santé de ses patients. Inquiet pour un de ses patients, un enfant blessé par balle, Pratt fait appel à Olivia Evans, qui travaille dans une association anti-violences...

Susan, Sam et Neela prennent en charge une patiente qui a entamé une grève de la faim pour empêcher l'expulsion de son fils. Pratt se bat pour persuader une femme, atteinte d'un cancer, d'entreprendre les soins nécessaires, alors qu'Abby soigne deux soeurs âgées, impliquées dans une agression suspecte. Pour la plus grande joie de Weaver, Carter décide de faire un don de 150 millions de dollars en faveur d'un nouveau projet médical. Après avoir essayé maintes fois de reprendre contact avec Wendall, qui se montre très froide, Carter décide d'appeler Kem pour lui demander son avis à propos du centre Joshua Carter, auquel il a donné le nom de leur fils mort-né...

Un certain monsieur Rubadoux est amené aux urgences du Cook County pour de sérieux problèmes cardiaques. Mais il refuse catégoriquement de se laisser soigner par John Carter car il s'avère que le jeune médecin a jadis soigné l'épouse de ce patient, sans succès. Les autres médecins s'expriment en faveur d'une rapide opération du coeur, mais Abby souhaite que l'on explique calmement l'alternative à laquelle est confronté ce patient très nerveux. D'autant que Carter a des informations à révéler à monsieur Rubadoux, au sujet de feu son épouse. Pendant ce temps, le service est confronté à un épineux problème : aucun volontaire qualifié ne se présente au poste de chef des internes. Il faut désigner quelqu'un...

Les relations entre Luka et Sam n'évoluent guère. Celui-ci vient de trouver le test de grossesse qui prouve que celle-ci n'est pas enceinte. Tous deux ont suffisamment parlé de leur couple pour ne plus envisager de nouvelles discussions. Sur les conseils d'un ami, Pratt décide d'assister à la fête d'anniversaire d'un vieux copain qui vient d'avoir 30 ans. Aux urgences, Ray pense qu'un adolescent prend de la drogue. Il comprend que le jeune homme est victime de maltraitance. Morris obtient enfin une promotion attendue. Abby rencontre la famille de Jake à l'occasion du baptême de sa nièce...

Préparant son départ du Cook County, Carter est impatient de rejoindre Kem en France, mais elle lui apprend qu'elle est complètement accaparée par l'hospitalisation soudaine de sa mère. Démoralisé par ce nouveau contretemps, Carter lui propose alors de reprendre leur relation à zéro et de partir d'un nouveau pied, en Afrique. Mais la jeune femme ne répond pas à sa proposition. De leur côté, malmenés par une série d'événements stressants, Abby, Ray et Neela commettent une série d'erreurs médicales critiques qui mettent la vie de leurs patients en danger. Ils doivent en assumer l'entière responsabilité...

Une fête est organisée pour le dernier jour de Carter au Cook County. Ray persuade Abby d'accepter de soigner quatre patients en traumatologie, bien que le service soit fermé...