Rory és Lorelai között feszült a viszony, miután a lány lefeküdt Deannel. Lorelai hiába szeretne kibékülni vele, Rory hajthatatlan. Végül úgy dönt, elutazik Emilyvel Európába. Luke és Lorelai sehogy sem tudnak kettesben tölteni egy kis időt, ráadásul Luke-nak váratlanul Maine-be kell utaznia, hogy kisegítse bajba jutott húgát.

Lorelai boldogtalan, mert Rory elutazott Emilyvel Európába, Luke pedig hetekre a Reneszánsz vásáron ragadt a húgával. Sookie megállapítja, hogy Lorelai kimerült, pihenésre van szüksége. Dean nem tudja mire vélni, hogy Rory váratlanul magára hagyta, Lindsay pedig tudomást szerez kettőjük titkos viszonyáról. Lane hirtelen ráébred: lehet, hogy beleszeretett Zackbe.

Lorelai és Luke titkolni szeretnék kapcsolatukat, ám a véletlen úgy hozza, hogy az egész város tudomást szerez róla. Taylor a városi gyűlésen akarja megvitatni, járhat-e egymással a kávézó és a szálloda tulajdonosa. Rory a második évet kezdi a Yale-en, ahol Paris bejelenti: barátja meghalt a nyáron. A lányok virrasztást tartanak a professzor emlékére. Emily egyre nehezebben viseli a magányt, ráadásul bosszantja, hogy Richard éli a maga életét.

Rory és Dean nehezen találnak módot arra, hogy kettesben lehessenek, ami mindkettejüket megviseli. Rory a problémák ellenére megértést tanúsít Dean iránt. A város ügyeinek rendezése érdekében Jackson elhatározza, hogy indul a képviselőválasztáson Taylorral szemben. Lane igyekszik minél hamarabb tudatni Zachkel érzéseit.

Lorelai igencsak aggódik Rory és Dean megromlott viszonya miatt, ezért azt javasolja, hogy találkozzanak négyesben Luke, Lorelai, Rory és Dean. Az este azonban kellemetlenné válik, mivel Luke nem palástolja Deannel kapcsolatos ellenérzéseit. Emily és Richard egyre jobban hiányoznak egymásnak, de ezt egyikük sem akarja bevallani.

Lorelai és Sookie teljesen lázba jönnek, mert Norman Mailer, a híres író felbukkan a Dragonfly Innben. Mailer nem hajlandó semmilyen ételt rendelni, ezt Sookie kissé nehezen viseli. Rory ezalatt cikket ír az egyetemi újságnak, miközben tudomást szerez egy titkos társaságról melynek Logan is tagja. Rory apja, Christopher felkeresi Lorelait, miután barátnője elhagyja. Sookie ismét terhes.

Végre Emily is megtudja, hogy lányának, Lorelainak viszonya van Luke-kal. Természetesen azonnal vacsorára invitálja Lorelai barátját. A szülői aggodalom itt nem ér véget, Richard hamarosan a golfklubba hívja el Luke-ot. Roryt váratlan meglepetés éri a titkos társaság estélyén, melyre Logan révén sikerül eljutnia.

Emily megtudja, hogy Rory újra Deannel jár, és úgy látja, a fiú nem megfelelő a számára. Ezért Richarddal közösen partit szervez, hogy Rory megismerkedhessen egy rangban hozzá illő fiúval. Lorelai és Luke romantikus vacsorát terveznek, amit TJ zavar meg, aki nehezen viseli a házasélet buktatóit. Mrs Kim megtudja, hogy Lane és Zack együtt járnak, ezért csúnyán leteremti a fiút.

Rory úgy dönt, megpróbálja újra összehozni nagyszüleit, ám Emily tovább akar lépni. Elhatározza, hogy randevúzni fog, és ehhez Lorelai segítségét kéri. Lorelai felkeresi Christophert, majd ebédelni hívja a Szitakötőbe. Ezt nem csak Rory nem nézi jó szemmel, de Luke is bosszús, mivel Lorelai eltitkolja előle a találkozót.

Rory felkérést kap a Chiltonból, hogy vezessen be egy gimnazista lányt az egyetem világába. Rory lelkesen fogadja Annát, ám a lányt csak az egyetemi élet lazasága érdekli. Paris megpróbálja túltenni magát Asher elvesztésén, és részt vesz egy párkereső foglalkozáson, ahol meglepetésére összefut Doyle-lal. Lorelai megtudja, hogy Luke-nak minden évben van egy "sötét napja". Elhatározza, hogy utánajár a férfi titkának...

Richard és Emily közelebb kerülnek egymáshoz, ám Richard dühös lesz, mikor értesül róla, hogy Emily egy másik férfival randevúzott. Rory szeretné, ha Logan magával vinné egy partira, de a fiú nem veszi a lapot. Rory csalódottan megy a péntek esti vacsorára, ahol őt és Lorelai-t nagy meglepetés éri. Lane kiharcolja, hogy anyja az együttest is hívja meg a Kim-házban tartott újévi ünnepségre. A fiúk nincsenek oda az ötletért...

Emily váratlanul beállít Lorelaiékhoz, akik megdöbbenve jönnek rá: sürgősen lánybúcsúztatót kell szervezniük. Emily végül istenien szórakozik a tiszteletére sebtében rendezett bulin. Az esküvő rendben lezajlik, ám Christopher felbukkanása sok bonyodalmat okoz. Rory úgy dönt, felfedi az érzéseit Logan előtt...

Lorelai őrjöng a katasztrofális esküvői jelent után, és kérleli Luke-ot, hogy ne adja fel kapcsolatukat. Lorelai-t feldúlja azonban Luke-nak az a döntése, hogy egy kis időre magára szeretne maradni. A kocsija nélkül a Yale-n ragadt Rory annyira aggódik anyja depressziós állapota miatt, hogy kölcsönkéri Logan limuzinját és sofőrét, és hazaindul Stars Hollow-ba..

Amikor Lorelai rájön, hogy Luke hajója már nincs a garázsban, sokkal jobban fáj az űr, amit Luke nélkül érez. Luke vállalja, hogy az általános iskola "Hegedűs a háztetőn" című előadására csomagokat állít össze, mert tudja, hogy Lorelai a jelmeztervező, és reméli, hogy útjaik összefutnak majd. Eközben Rory és Marty azt tervezi, hogy együtt töltenek egy napot. A háló ajtaja előtt ott terem Logan, aki ráveszi őket, hogy menjenek el vacsorázni. A Logan társaságával töltött borzalmas este után Marty megmondja Rory-nak, észrevette, hogy mennyire tetszik neki Logan. Rory is beismeri, hogy nagyon bele van zúgva Logan-ba.

Richard és Emily visszaérkezik második nászútjáról. A szokásos péntek esti vacsorán Lorelai nagyon dühös, ezért nem is beszél Emily-vel. Rory mindenkit meglep nagymamájával szemben szokatlan kirohanásával, hogy miért avatkozik bele Lorelai szerelmi életébe. A Lorelai nélkül boldogtalan Luke komor hangulata miatt odaégeti az ételt és minden vendéget kidob, aki a vendéglő előtt panaszkodik. Emily váratlanul ellátogat a vendéglőbe, hogy beszéljen Luke-kal. Eközben Lane elborzad, amikor felismeri, hogy anyja nagyobb hatással van rá, mint gondolta volna.

Rory megbánja egyezségét Logan-nel, hogy másokkal is randevúzhatnak, miután a városban meglátja egy másik lánnyal. Később egy bulin, ahol mindenki Quentin Tarantino-film szereplőknek öltözik, Rory Logan barátjával, Robert-tel jelenik meg. Ennek hatására Logan beismeri, hogy féltékeny rá. Luke és Lorelai újra együtt vannak, ezért Emily nem érti, hogy Lorelai miért nem jelenik meg továbbra sem a péntek esti vacsorákon. Emily másodszor is felkeresi a vendéglőt, hogy beszéljen Luke-kal, aminek még keményebb anya-leány viszály lesz a vége...

Amikor Stars Hollow legidősebb lakosa meghal, és házát a városra hagyja, Luke-nak az a hátsó gondolata, hogy önként segít a házból egy ideiglenes múzeumot kialakítani. Dean is ezen a projekten dolgozik.A Dragonfly Fogadó reklámozása céljából Lorelai interjút ad egy turisztikai magazinnak, de azonnal megbánja barátságtalan megjegyzéseit arról, ahogy Emily felnevelte...

Miután Rory elmondja Logan-nak, hogy nem akar alkalmi kapcsolatot vele, és legyenek megint csak barátok, meghökken, amikor Logan azt állítja, hogy kész hozzákötni magát. Amikor azonban elviszi a házukba, hogy találkozzon erős és félelmetes családjával, Rory-t megdöbbenti, hogy szülei milyen negatívan reagálnak kapcsolatukra. Másnap Logan apja elnézést kér Rory-tól, és gyakornoki állást kínál az egyik lapnál. Eközben, amikor Sookie-t az orvos ágyba parancsolja, Lorelai Luke-ot kéri fel, hogy helyettesítse a Dragonfly Fogadó szakácsát.

Rory, aki szeretne jó benyomást tenni Logan apjára, Mitchum Huntzberger-re, mindent megtud róla, amit csak lehet, mielőtt az egyik lapnál a gyakornoki munkát megkezdi. Amikor Lorelai megtudja, hogy Emily és Richard meghívta Logan-t a péntek esti vacsorára, beszünteti a családi összejöveteleik bojkottálását, hogy jobban megismerhesse Logan-t. Az estén Emily és Richard kedveskedik Logan-nek.

Rory meglepődik azon, hogy Logan apja hogyan értékeli teljesítményét a lapnál. Luke terve, hogy megvegye a Twickham házat veszélybe kerül, amikor Kirk egy versenyképes ajánlatot tesz. Lorelai tűzbe jön, amikor a Dragonfly Fogadóról író turisztikai magazin a standokra kerül, de tart tőle, Emily hogyan fogadja majd a cikket.

A Logan-nel vakmerően eltöltött éjszaka után a Rory-t megmentő Lorelai döbbenten hallgatja lánya jövőbeni terveit. Luke lemond a Twickham házról, amikor megtudja, hogy Lorelai esetleg valahol máshol vállal állást. Rory még mindig maga alatt van, amiért Logan apja szerint sosem lesz belőle újságíró, és úgy dönt, nem megy vissza a Yale-re. Lorelai a szüleihez fordul segítségért, akik megígérik ugyan, de mégsem tesznek semmit és Lorelai hamar rájön, hogy egyedül Luke az, akiben megbízhat. Így ennek hatására a kétségbeesett Lorelai furcsa ajánlatot tesz Luke-nak.