Un étrange bébé, Reborn, qui prétend être un tueur à gage de la mafia approche Tsunayoshi "Tsuna" Sawada. Pour Tsuna, c'est la consternation, il vient d'être choisi pour devenir le prochain boss des Vongola.

Tsuna, piégé par Reborn, doit participer à un tournoi de volley de son collège. Puisqu'il commence à se ridiculiser, Reborn lui donne un petit coup de pouce en lui tirant une balle spéciale. Poussé par Kyoko, il parvient alors à se rattraper et sauve son équipe de la défaite. Le même jour, un nouvel élève de sa classe, Hayato Gokudera, venu d'Italie, le défie en tant que potentiel futur 10ème parain de la famille Vongola mais une fois encore grâce à l'aide de Reborn il parvient à retourner la situation en sa faveur. Gokudera se met alors aussitôt au service de Tsuna. Un autre élève de sa classe, Takeshi Yamamoto, sympathise avec lui après avoir joué au volley à ses côtés.

Un soir, pendant que Reborn fait travailler Tsuna, un enfant habillé en costume de vache, Lambo, fait irruption et tente de tuer Reborn. Le lendemain, sur le chemin de l'école, une jeune femme tente d'empoisonner Tsuna. Elle réitérera son action à l'école mais va de nouveau échouer. Il s'agit en fait de Bianchi, la soeur de Gokudera, venue d'Italie avec Lambo caché dans ses bagages, pour ramener Reborn dont elle est follement amoureuse au pays. Lambo est, quant à lui, un tueur à gage d'une famille rivale, venu pour exterminer Reborn. Il possède un bazooka capable d'intervertir dans le temps une personne et cette même personne mais dix ans plus tard : c'est le bazooka de 10 ans.

Tsuna fait la rencontre de Haru Miura, une collégienne de son quartier qui s'est mis en tête de protéger Reborn de Tsuna et ses amis. Haru poursuit alors Tsuna, cachée dans une armure. Elle tombe à l'eau par accident et cette dernière ne sachant pas nager Tsuna parvient à la sauver de la noyade grâce à sa dernière volonté. Elle tombe alors amoureuse de Tsuna pour son acte...

Reborn s’intéresse à un élève du collège Namimori et camarade de Tsuna : Kyôya Hibari, le chef du comité de discipline. Ce dernier a en horreur la foule et toute forme d’attroupement, et semble craint de tous. Reborn décide de créer une rencontre fortuite entre lui et Tsuna...

Alors qu’il se rend à l’école, Tsuna croise un enfant qui le sauve d’un chien en utilisant ce qui ressemble à un pouvoir paranormal. Plus tard dans la journée, Tsuna croise de nouveau l’enfant avant de comprendre que celui-ci est un tueur venu pour lui...

Alors qu’il court avec la dernière volonté à son école, où il a rendez-vous avec Kyôko, Tsuna tombe sur Ryôhei Sasagawa, le chef du club de boxe. Ce dernier, fasciné par l’énergie de Tsuna, lui demande d’intégrer son club de boxe. Tsuna n’est pas franchement partant, mais il découvre de façon inopinée que Ryôhei est le frère aîné de Kyôko...

Avant de venir au Japon pour former Tsuna, Reborn avait la charge de Dino, actuel parrain de la famille Cavalone. Comme Tsuna, il se refusait à devenir parrain et n’en avait d’ailleurs pas l’étoffe. Quand il rencontre Tsuna, il a l’impression de voir son propre reflet passé... et va donc vouloir le tester.

Tsuna est atteint d’un mal étrange. Des têtes de mort apparaissent sur son corps et crient à qui veut entendre tous ses secrets honteux. Reborn ne tarde pas à lui révéler que ce mal frappe ceux qui ont déjà reçu en pleine tête dix balles de dernière volonté. Un ami et docteur pourrait le soigner, mais celui-ci n’accepte d’ausculter que les femmes...

Quand Tsuna oublie son panier-repas à la maison, Lambo se propose de jouer les coursiers. Hélas, tout ce qu’il entreprend finissant toujours en catastrophe, Reborn décide qu’il lui faut un baby-sitter. Il va donc mettre à l’épreuve tous les membres de la famille. Récompense à la clef : le plus à même de baby-sitter Lambo sera aussi le bras droit de Tsuna...

Tsuna fait un rêve prémonitoire où il se voit épouser Kyôko... Mais la mariée se révèle être Haru ! À son réveil, Tsuna se fait tancer par Reborn : selon lui, il n’aura jamais le courage de déclarer sa flamme à Kyôko. Tsuna prétend le contraire et se décide à aller la voir...

Il est temps pour Reborn de sortir le grand jeu : le programme d’endurcissement traditionnel de la famille Vongola. Il va convier Yamamoto et Gokudera afin qu’ils comprennent et travaillent les trois fondamentaux du combat : vitesse, endurance et force. Si Yamamoto s’en sort avec le plus grand naturel, Gokudera semble plus à la peine...

C’est le Nouvel An et au Japon, les trois premiers jours de l’année sont fériés. La maisonnée privilégie l’avachissement sous la table chauffante, mais Reborn décide de faire découvrir à Tsuna et ses camarades une tradition : la grande bataille de début d’année « façon Vongola ». Au programme : les Cavalone vont affronter les Vongola dans une série de jeux dont le perdant se verra contraint de payer 100 millions de yen...

Bianchi, Lambo et I-pin étant absents, la maison semble très calme à Tsuna. Il aimerait en profiter, mais c’est sans compter sur Reborn. Celui-ci lui réserve ce qui semble à première vue être une divine surprise : un rendez-vous au zoo avec Kyôko. Tsuna en reste incrédule et doit bien reconnaître qu’il doit une fière chandelle à Reborn. À moins que...

Il fait toujours aussi froid en ce début d’année. Quand Reborn emmène Tsuna à l’école, celui-ci pense qu’il va devoir jouer les baby-sitters pour Lambo et I-pin. Quand ses camarades apparaissent, il apprend que ce sont eux qui lui ont demandé de venir afin de le décharger de cette tâche. Mais ils restent de grands enfants et une bataille de boules de neige s’annonce...

Yamamoto et Gokudera ont déjà terminé leur entraînement spécial et c’est désormais autour de Tsuna d’y passer. Reborn l’a convoqué dans la bien nommée Montagne de la Mort où il lui a concocté quelques épreuves : chute d’ours, chute d’eau, chute de haut et plus encore. Tsuna pourra compter sur l’aide sinon la bonne volonté de ses amis pour sortir de cet enfer.

Blessé lors de son aventure dans la Montagne de la Mort, Tsuna se retrouve alité et hospitalisé. Il va rapidement faire connaissance avec ses compagnons de chambre, qui décident d'en faire leur laquais au prétexte qu'il est le plus jeune d'eux tous. Tsuna entrevoit un séjour à l'hôpital pénible, mais c'est alors qu'il reçoit la visite de son ami Dino et de ses hommes, qui ont tôt fait d'effrayer les autres patients. Ce sont en fait les visites successives de ses amis qui vont rendre à Tsuna son séjour à l'hôpital plus périlleux...

C'est de nouveau la Saint-Valentin. Jamais aucune fille, sinon sa mère, n'a offert de chocolats à Tsuna. Ce dernier se fait à l'idée de ne rien recevoir cette année encore, mais il ne va pas tarder à découvrir que Kyôko et Haru sont venues chez lui pour en cuisiner... avec Bianchi. La mission de Tsuna consistera à empêcher Bianchi d'empoisonner tout le monde avec son Poison Cooking.

Un jeune garçon du nom de Fûta vient chercher secours auprès de Tsuna. Reborn lui révèle qu'il s'agit de Fûta-le-classeur, qui possède le pouvoir de tout classer de manière infaillible en communiquant avec l'étoile du Classement. Si des mafieux parvenaient à s'emparer de lui, ils pourraient facilement dominer la Terre entière. La prochaine mission de Tsuna sera donc de protéger Fûta.

Les membres du comité de discipline de Namimori, dont le capitaine est Hibari, sont mystérieusement attaqués les uns après les autres. Puis c'est au tour de tous les élèves de Namimori de se faire agresser sans distinction. L'identité des coupables reste encore un mystère, mais il apparaît clairement que Tsuna et ses amis font partie de leurs cibles. Un long chapitre s'ouvre pour Tsuna et sa famille.

Tandis que Gokudera affronte l'un des hommes qui sèment la panique dans Namimori, Reborn tente d'établir leur identité : il s'agirait de trois personnes récemment évadées d'une prison de haute sécurité italienne, en guerre contre la mafia. Tsuna et ses amis décident de porter le combat sur le terrain de leurs ennemis, dans un centre commercial désaffecté.

Si Yamamoto est parvenu à se défaire du premier des deux sbires de Mukuro, la partie n'est pas gagnée pour autant. En effet, le même Mukuro a fait appel à quatre autres détenus avec lesquels il s'est évadé : une joueuse de clarinette, un passionné d'oiseaux et des jumeaux tueurs en série. Chacun a un style de combat aussi déroutant que redoutable...

Alors qu'il s'enfonce dans la forêt à la recherche de Fûta, Tsuna tombe sur Mukuro, qui se fait passer pour un otage de lui-même. Il interroge Tsuna quand à l'identité de Reborn. Suspicieux, Tsuna s'enfuit rejoindre ses amis, qui ont fort à faire face à celui qui se présente comme étant Mukuro Rokudô. Un long combat commence...

Alors qu'il pensait avoir vaincu Mukuro, Tsuna doit se rendre à l'évidence : ce dernier est capable de prendre possession des corps de ses amis. Le véritable combat commence enfin. Comment Tsuna, apparemment le plus faible physiquement du groupe, va-t-il pouvoir se surpasser et trouver les ressources nécessaires pour vaincre Mukuro ?

Tsuna est enfin arrivé à maturité. Il a trouvé la volonté de vaincre Mukuro et Léon lui a fait cadeau de deux objets : les Gants X et la balle de jugement. C'est dans son combat contre Mukuro qu'il va en découvrir toutes les facettes.

C'est la rentrée des classes, mais lorsque Tsuna et ses amis arrivent au collège, ils découvrent qu'ils sont tous dans des classes différentes. Arrive alors un mystérieux conseiller, Vongolevsky, qui leur propose d'établir leur propre répartition des classes, mais à une condition : il va falloir qu'ils l'attrapent...

Reborn reçoit la visite de ce qui semble être une ancienne connaissance, à qui il demande de faire usage de sa "faculté spéciale"... Alors qu'il fait nuit, Tsuna surprend un voleur dans sa chambre mais s'évanouit aussitôt. Au petit matin, il découvre ce qui a tout l'air d'être un cadavre, et Reborn affirme aussitôt que c'est lui, Tsuna, qui a tué cet homme...

Hana, la meilleure amie de Kyôko, a eu le coup de foudre pour Lambo, qu'elle a entraperçu adulte. Alors qu'elle désespère de le revoir un jour, elle aperçoit Tsuna en sa compagnie. Elle va donc lui demander de le lui présenter, mais un dysfonctionnement du bazooka de dix ans va singulièrement compliquer la tâche...

La mère de Tsuna vient de gagner le grand jeu concours d'un magazine, dont le prix est une croisière de luxe vers une île méridionale. N'ayant que deux tickets, et assurée que Bianchi va garder Lambo, I-pin et Fûta durant son absence, elle décide de partir avec son fils Tsuna. Mais quand tous deux arrivent sur le bateau, ils ne tardent pas à découvrir que toute la clique de Reborn les a suivis, de manière parfaitement clandestine...

Tsuna a fini par découvrir que son voyage de luxe avait été organisé par Reborn et la prétendue île méridionale abrite en fait un grand parc d'attractions : Mafia Land. Arrivé sur place, Tsuna va vite comprendre qu'il sera le seul à ne pas s'amuser... mais il va aussi découvrir, pour la première fois, un autre Arcobaleno que Reborn...

Les cours de natation vont commencer au collège Namimori et le professeur menace ceux qui ne seront pas capables de nager 15 mètres de barboter dans la piscine des filles. Tsuna craint l'humiliation devant Kyôko, mais c'est sans compter ses amis qui décident de lui apprendre à nager à la piscine municipale. Évidemment, Reborn est là pour pimenter les cours...

Tsuna, Yamamoto et Gokudera sont contraints de travailler durant les vacances d'été pour rembourser le toboggan que Lambo a détruit à la piscine municipale. Ils découvrent vite qu'ils devront jouer les sauveteurs aux côtés de Ryôhei et certains de ses camarades plus âgés. Mais apparemment, ces derniers sont plutôt là pour draguer les filles et jouer les petits tyrans. La cohabitation s'annonce difficile...