קבוצה של שכירי-חרב קיבורגיים, בהנהגתה של אישה מעברו של וולברין, מבקשים את עזרתו הכפויה כדי לחשוף את סודותיה של חללית זרה שהייתה קבורה מזה שנים רבות.

מפלצת חייזרית משתחררת מהחללית ומנקזת את כוח-החיים של ג'ובילי ו-"הריברס", מה שמוביל לברית מתוחה בין וולברין וליידי דת' סטרוק עד להבסת המפלצת האימתנית.

בעקבות חזיונות מן החלומות האחרונים, פרופסור אקסבייר שולח את האקס-מן שלו במשימה לתחנת החלל נשר-אחת, מה שמכניס אותם לאמצעו של סכסוך בין-כוכבי וגורר אחריו השלכות קשות.

האקס-מן שורדים בקושי את המסע חזרה מהחלל וג'ין גריי מגלה שהיא השתנתה בעקבות החוויה. חציו האפל של פרופסור אקסבייר מקבל צורה גשמית ומתחיל לתקוף את תלמידיו.

טענותיו של פרופסור אקסבייר על תפיסתה של הנפש התאומה החייזרית שלו, לילנדרה, בידי ג'אגרנאט וטום קאסידי, נתקלות בספקנות, עד שהוא מצליח למצוא רמז למקום הימצאה.

לילנדרה מבקשת להגן על קריסטל המ'קראן מאחיה המרושע. אבל הפיראטים הבין-כוכביים, הידועים כמשבשי הכוכבים, תופסים אותו ואת ציקלופ במאמץ ליישם את תוכנית הנקמה שלהם בקיסר.

עלייתו של הקיסר ד'קן לשלטון באמצעות הקריסטל גורמת לקריסה אוניברסלית. ג'ין גריי חייבת לשחרר את גורלה כמארחת של הפיניקס, אפילו במחיר אישי ביותר.

סאורון חוטף את סופה ומביא אותה לארץ הפרא כדי ליזון מהאנרגיה המוטאנטית שלה. וולברין, חיה, רוג וג'ובילי עוקבים אחריו בחזרה לארץ הפרא כדי לשחרר את חברתם הכלואה.

זעמה הבלתי-פוסק של סופה מכין את הקרקע לעלייתו של גארוק. גם אם סופה תחזור לשליטה, ההתחדשות הגיאותרמית של אל השמש תביא לקצו של גן-העדן הארקטי המכונה ארץ הפרא.

כשהוא מונע מתוך הרצון לחפש נקמה נגד המוטאנט האלמוני ששינה אותו לכלי נשק מרושע ומעוות ובידיעה שהוא מסכן את חייו, מלאך-הפנים משכנע את רוג לעזור לו לצוד ולהשמיד את אפוקליפסה.

החיזור בין ציקלופ למוטאנטית בשם דאזלר מחריף את הצד של ג'ין גריי הנשלט על ידי פיניקס, ומשאיר אותה פתוחה למניפולציה על ידי כת סודית של מוטאנטים החומדים את כוחותיה עבור מטרותיהם.

פרופסור אקס ואמה פרוסט נלחמים על שליטה בג'ין וחברי המעגל הפנימי רבים על איך להיפטר מהאקס-מן. הצמא של הפיניקס לתחושות רעות וחדשות מתחיל לגדול וגורם להתפרצות כוחו.

הטרנספורמציה של הפיניקס האפל הושלמה והוא מתחיל את השתוללותו. על האקס-מן למצוא דרך לגרש את כוחו של הפיניקס מן הגוף של ג'ין מבלי לפגוע בה.

האקס-מן עומדים במבחן בלתי-אפשרי מול המשמר הקיסרי על מנת להציל את חייה של ג'ין גריי, אם כי אפילו הם מתחילים לפקפק בביטחון של היקום כל עוד הפיניקס האפל נשאר בתוכה.

חבר אקס-מן לשעבר, איש-הקרח, פורץ לתוך מתקן ממשלתי. הוא מסרב לתת אמון באקס-מן, אבל כאשר ג'ובילי מסייעת לו במסעו, הדבר מוביל לקרב נגד קבוצת מוטאנטים המכונה אקס-פקטור.

ציקלופ מגלה כי קורסייר, מנהיג קבוצת הפיראטים הבין-כוכבית המכונה משבשי הכוכבים, הוא אביו. אלא שכעת הוא נמלט מהאימפריה ומבקש את עזרתו כדי להוכיח את חפותו.

גמביט, וולברין ו-רוג יוצאים לטיול סקי בגרמניה. אך בעוד גמביט ורוג נהנים, וולברין חסר המנוחה יוצא לחקור דיווחים על שד שטני שנצפה במנזר מקומי, רק שהחקירה מגלה לא שד, אלא מוטאנט.

וולברין וחיה נוסעים למיקום שעשוי להכיל את התשובות לעברו של וולברין: חורבות המעבדה של נשק איקס. שם הוא פוגש "נושאי מחקר" נוספים - שן-חרב, מאווריק וסילבר פוקס - שסובלים מהפרעות דומות.