Trwa ślub Jean Grey i Cyclopsa. Mister Sinister poddaje Morpha praniu mózgu, a następnie wysyła go do Nowego Jorku, gdzie Kevin zaczyna eliminować X-Menów jednego po drugim. Tymczasem Graydon Creed wprowadza w życie swój projekt eksterminacji mutantów.

Udający Magneta Morph zwabia Profesora X na Antarktykę. Mister Sinister porywa Cyclops i Jean. X-Meni wyruszają w pościg za Sinisterem. Tymczasem Profesor X wraz z Magnetem zostają zasypani pod lawiną.

W szeregi X-Menów powraca Storm. Tymczasem coś dziwnego zaczyna się dziać w Afryce. Storm i Rogue wyruszają do Afryki żeby zbadać sprawę. W tym samym czasie pozostali X-Meni szukają Profesora X. Charles i Magneto trafiają do Dzikiej doliny.

Profesor X i Magneto zostają zaatakowani przez dinozaury. Jubilee wraz z Colossusem łapią złodziei, którzy obrabowali sklep. Tymczasem w Rosji trzej skorumpowani generałowie przywracają do życia Omegę Reda.

Jean Grey nadal szuka Profesora X. Tymczasem Vindicator wraz z pozostałymi członkami Alpha Flight chwytają Wolverinea. Chcą żeby wyjawił im sekret swojego szkieletu z adamantium. Vindicator postanawia przeprowadzić eksperymenty na Loganie.

Gambit must come face to face with the past he's been running from for years, as he returns to Louisiana to save his brother from the woman he left at the altar.

Bishop returns from the future to again attempt to fix his world, this time trying to stop a plague from infecting mutants. But his noble actions lead to a far greater tragedy.

To stablize his own timeline, Cable comes to the present to prevent Bishop from saving mutant-kind from Apocalypse's plague.

Haunted by visions of a strange woman, Rogue must come to grips with the dark secrets of her past prior to joining the X-Men.

Beast falls in love with his patient, a blind woman named Carly, and though the feelings are mutual, her mutant-hating father and anti-mutant sentiment drive a split between the pair. Meanwhile, Wolverine seeks to take down the Friends of Humanity from the inside out.

Professor Xavier and Magneto gain a native ally, as they finally come face to face with the new ruler of the Savage Land. A lead from Morph sets up a rematch between Wolverine, Cyclops, Jean Grey and Mister Sinister & his Nasty Boys.

The X-Men find themselves powerless in the Savage Land, and become fodder for Mr. Sinister's experiments. It's up to Wolverine and Ka-Zar to initiate a rescue.