J.D. heeft nu een volledige baan als dokter bij Sacred Heart en krijgt dus zijn eigen stagiaires. Turk weet niet of hij kinderen wil en probeert ervoor te zorgen dat Carla niet zwanger wordt. Elliot heeft het moeilijk in het Country Hospital, haar nieuwe werkplek.

J.D. wil dokter Cox en dokter Kelso laten zien hoe je met stagiaires moet omgaan maar hij komt erachter dat zijn stagiaires bang voor hem zijn. Iedereen probeert ondertussen van Jordan af te komen, behalve Turk. Elliot zoekt steun bij Carla.

J.D. plant zijn verjaardag en bedenkt zich wat hij nog allemaal wil bereiken voordat hij dertig wordt. Elliot komt achter een kant van haar vriendje Jake die nog niet eerder gezien heeft. Turk wil indruk maken op zijn baas.

J.D. wordt gevraagd dokter Kelso te introduceren tijdens een prijsuitreiking dus gaat hij op zoek naar iets positiefs aan deze man. Dokter Cox en dokter Kelso strijden ondertussen voor hun patiënt voor een plek in een experimenteel programma. Carla en Turk proberen Elliot haar baan bij Sacred Heart terug te krijgen.

Paige, de zeer gelovige zus van dokter Cox, komt langs voor het doopsel van haar neefje. Turk komt erachter hoe zakelijk baby's maken kan zijn. J.D. en de conciërge worden vrienden.

J.D. vergist zich wanneer hij de vrolijkheid van een patiënte aanziet voor haar wens om niet meer behandeld te worden. Turk en Elliot hebben moeite om een patiënt te helpen die overal pijn heeft.

Turk gaat op zoek naar een hartdonor, Carla is bang dat ze niet genoeg moed heeft om moeder te worden en J.D. zoekt zijn weg. Elliot is bang dat ze niet slim genoeg is voor een vragensessie.

J.D., Turk en Carla worden ondervraagd na de mysterieuze dood van een patiënt. Dokter Kelso doet een aantal ontdekkingen: Elliot kwam erachter dat haar vriendje getrouwd is geweest, Carla was bezig met een loterij en J.D. en Turk waren bezig met een patiënt opsporen.

J.D. ontmoet Julie en wordt verliefd op haar. Elliot probeert hem romantisch advies te geven. Carla gaat op zoek naar de zachte kan van dokter Cox. Turk en de conciërge werken samen maar worden dwars gezeten door dokter Kelso.

J.D. vindt het vervelend dat Julie niet lacht. Elliot raadt hem aan zijn echte gevoelens te delen met Julie. Turk probeert psychologie te gebruiken om het probleem op te lossen. Carla is overstuur wanneer de conciërge een nieuwe verpleegster aanspreekt als 'de knappe, jonge Carla'.

J.D. heeft nog steeds moeite met zijn verbroken relatie en reageert dit af op de nieuwe stagiaire Keith. Een favoriete patiënt van het personeel belandt in een coma. Dokter Cox en de conciërge worden maatjes in de bar.

Dokter Kelso is woedend wanneer hij erachter komt dat er een vogel in Sacred Heart woont. Hij dwingt de conciërge het beestje op te ruimen, maar deze gaat stiekem niet akkoord. J.D. probeert Keith ontslagen te krijgen.

J.D. en dokter Cox gaan door de vijf stadia van rouw wanneer het steeds slechter gaat met hun favoriete patiënt. Carla dwingt Turk met haar mee te gaan op een reeks dubbeldates. Ted wordt ondertussen aangereden door dokter Kelso.

J.D. heeft het helemaal gehad met Keith en wanneer bekend wordt dat Keith een relatie met Elliot heeft, is de rest van het personeel ook niet blij met hem. Dokter Cox schept op omdat hij de beste dokter van de stad wordt genoemd in een tijdschrift dus stelt dokter Kelso hem op de proef.

J.D probeert zijn collega's ervan te overtuigen dat ze wat extra's moeten doen voor hun patiënten. Wanneer hij een meisje ontmoet dat gek is op zijn haar, wil hij het niet meer afscheren voor een patiënte voor hem die chemo ondergaat. Turk en Carla willen van alle stress in hun leven af.

Turk komt erachter dat Carla zwanger is. Carla weet nog van niks, dus vindt J.D. dat Turk een surprise feest voor haar moet organiseren. Elliot brengt dokter Cox in verlegenheid en dit laat hij niet zomaar passeren.

J.D. maakt meer tijd vrij in zijn agenda om met Turk te kunnen spenderen. Turk wil dit helemaal niet omdat hij dan graag zelf wil relaxen. Dokter Cox en Jordan hebben een dubbeldate met Elliot en Keith.

Dan, de broer van J.D., keert onverwacht terug en Elliot komt erachter dat J.D. zijn broer verteld heeft dat hij nog steeds gek is op haar. Carla en Turk schrikken van elkaar wanneer ze babynamen bespreken. Dokter Kelso geeft dokter Cox een rot klusje dat hij samen met Ted met uitzoeken.

Turk en Carla veranderen de oude kamer van J.D. in een babykamer. De conciërge ziet zijn kans schoon om J.D. een dag uit beeld te laten verdwijnen. Turk en dokter Cox beschuldigen elkaar ervan niet hip te zijn.

J.D. vraagt dokter Cox om met hem te lunchen maar ze komen de irritante patiënt Jill Tracey tegen. Elliot en Carla komen erachter dat Todd gelogen heeft over zijn seksleven.

Dokter Cox grijpt naar de fles wanneer er drie patiënten overlijden door zijn beslissingen. Zijn collega's proberen het voor hem op te nemen. J.D. en de conciërge proberen Turk te steunen wanneer hij het moeilijk heeft met zijn nieuwe supervisor.

J.D. heeft het gevoel dat er constant hetzelfde gebeurt in het ziekenhuis. Dokter Cox keert terug op het werk maar Elliot meent dat hij zijn zelfvertrouwen kwijt is. Carla heeft genoeg van het gelummel van Turk.

J.D. vecht de beslissing van een uroloog aan omtrent diens oordeel over een riskante ingreep. Daarnaast wordt hij ook verliefd op deze dokter. Elliot denkt erover na om het uit te maken met Keith maar Carla, die extra emotioneel is door haar hormonen, probeert dit te voorkomen.

J.D. heeft een date in gedachten met Kim maar Elliot blijft maar onderbreken. Elliot organiseert ondertussen een baby shower voor Carla. Dokter Cox en Jordan geven al het oude spul van Jack aan Carla en plotseling maakt er iemand bekend ook zwanger te zijn.