Psykiatern dr Clock anländer med sin snurriga personlighet och börjar genast kalla JD för "Johnny", men JD är glad ändå eftersom det är hans sista vecka som läkarstudent innan han blir helt färdig doktor.

Dr Clock försöker få JD och Elliot att återförenas; Molly och Carla har en subtil konflikt; Elliot och JD kommer närmare varandra; Dr Cox, Turk och vaktmästaren blir tvungna att samarbeta.

Dr Cox har problem med att Molly ställer frågor till hans patienter, och med det faktum att han och Jordan tekniskt sett fortfarande är gifta på grund av administrativa problem.

JD blir chockad när dr Cox säger åt sina studenter att de en vacker dag kommer att begå ett fel så att någon patient dör. Cox ord drabbar JD så hårt att han tror att han snart kommer att råka döda någon.

Elliot blir osäker på om hon verkligen vill ha Molly som mentor när hon får veta mer om henne. JD:s ledarskap prövas när dr Cox skäller ut honom inför hans studenter.

När Dan dyker upp igen och berättar att deras pappa har dött blir JD chockad. Han tröstas av sina kollegor, men den han helst skulle vilja få stöd av är för upptagen med JD:s patienter.

JD hittar Dan och Elliot tillsammans. Turk använder sin diabetes som ursäkt för att få Carla att göra saker för honom.

När Molly får jobb i en annan stad har JD och hon en romantisk kväll tillsammans och han försöker få henne i säng innan hon åker. Dr Cox har ambulanstjänstgöring med en galning.

JD blir uppsökt av en advokat som hanterar tjänstefel. Hon ber honom att utföra ett riskfyllt ingrepp på hennes pappa. Elliot hjälper Doug att ta ett nytt steg i sin karriär.

JD försöker göra slut med Neena, men hon vill inte acceptera det förrän JD ber Jordan att hjälpa till. Elliot bestämmer sig för att bevisa att hon är en bättre doktor än för fyra år sen.

JD tar saken i egna händer och letar upp en släkting till sin favoritpatient. Elliot är trött på att hennes kollegor inte tar henne på allvar.

JD berättar för en grupp studenter från läkarlinjen om hur det är att vara läkare och väljer att exemplifiera genom sina egna bästa ögonblick.

JD och Elliot kommer överens igen, men Elliots skicklighet som läkare överträffar snart JD:s. Elliot tappar fattningen när hon förstår att vaktmästaren kan ha haft mer i kikaren när han bjöd ut henne på fika.

JD blir kär i en tjej som han träffat på en klubb och vet inte om han ska berätta för henne att hennes kille har gonorré. Elliot bestämmer sig för att ta sin patients parti mot dr Kelso.

En man som skadats i ett krogslagsmål lär Turk och JD ett och annat om att leva livet fullt ut.

JD försöker imponera på Kylie på deras första träff. Under en karantänperiod får Turk reda på att Carla en gång var ihop med Cox. Danni Sullivan kommer tillbaka och retar gallfeber på alla.

JD träffar en författare som har skrivit manus till "Cheers", och föreställer sig sitt liv på sjukhuset som en sitcom. Cox vill inte avskeda en trevlig caféanställd.

JD kastas ut ur sin lägenhet. Turk och Carla försöker fortfarande hålla romantiken vid liv. Cox börjar misstänka att en gammal kompis son är autistisk.

JD dumpar Kylie, som verkar ointresserad, och väljer Molly som har kommit tillbaka från Milwaukee. Carla är arg för att Turk ringer till en ex-flickvän så ofta. Vaktmästaren och Cox slår vad om Elliot.

Kelso tar på sig läkardräkten för att bevisa en sak för Cox, men det slår fel när en jobbig patient vägrar att lyssna på honom. JD och Turk festar medan Carla tröstas av Elliot.

Carla och JD går ut, blir fulla och råkar kyssas. Dr Cox blir utsatt för Jordans tävlingsinstinkt när Jack måste sys under Perrys öveinseende. Elliot får problem med en manlig patient.

Turk vill inte prata om sig själv i parterapin. Elliott vägrar att lyssna på Cox kärlekstips. JD får en lektion i medmänsklighet av en döende gammal kvinna.

Elliot vet inte om hon ska agera snabbt eller om det förstör hennes förhållande med Jake. Dr Cox lär Turk hur man ska vara hälsosamt självisk.

JD flyttar ut för att bo ensam. Turk och Carla funderar på att göra en förändring i familjen. Kelso anställer Jordan vilket irriterar Cox. Elliot får ett jobberbjudande på ett annat sjukhus.