בפתח העונה הרביעית, ד"ר מולי קלוק, רופאה חדשה, מגיעה לבית החולים, ופונה אל ג'יי-די בשם "ג'וני". אבל לג'יי-די לא אכפת, מכיוון שזהו שבוע ההתמחות האחרון שלו.

מולי מנסה להשלים בין ג'יי-די לאליוט, וכולם ממתינים להחלטה בנוגע למשרת המתמחה הראשי. מערכת היחסים של מולי וקלרה הופכת מתוחה. ג'יי-די אליוט מתחילים ליישר את ההדורים.

לד"ר קוקס יש בעיות עם ג'ורדן, מאחר שטד חשף שהם עדיין נשואים טכנית. ג'יי-די לא מצליח להיפטר מתווית שותף לראש המתמחים, שהעניק לו אחד השרתים. טורק מתחיל לפקפק ביכולותיו.

ג'יי-די נדהם לשמוע את ד"ר קוקס מסביר למתמחים שלו שבשלב מסוים, כל אחד מהם יתרשל ויהרוג חולה. קרלה מאבדת את רודי, והיא והשרת יוצאים לחפש אותו.

אליוט לא משוכנעת שהיא רוצה שמולי תהייה המדריכה שלה, מכיוון שחיי המשפחה שלה אינם מושלמים. כישורי המנהיגות של ג'יי-די נבחנים, כשד"ר קוקס צועק עליו מול המתמחים.

דן צץ מחדש, וג'יי-די נדהם לגלות שאביו נפטר. אף שחבריו לעבודה תומכים בג'יי-די, ד"ר קוקס עסוק מידי עם החולים שלו. דן השיכור יושב כל היום באמבטיה, וטורק מגלה שהוא חולה בסוכרת.

כשג'יי-די תופס את דן עם אליוט, טורק מציע לו להשתמש ב-"תירוץ האח הפגוע" כדי להביא לכך שייפרדו. ד"ר קוקס וד"ר קלסו מתאחדים כדי להכניע אויבת משותפת: ד"ר מולי קלוק.

מולי מקבלת עבודה בעיר אחרת, והיא וג'יי-די מתנשקים. ד"ר קוקס נוסע עם מטורף באמבולנס, אולם מסתבר שהמטורף הוא אישה שאיבדה את בנה בתאונה.

נינה ברודריק, עורכת דין המתמחה ברשלנות רפואית, פונה לג'יי-די, ומבקשת ממנו לבצע הליך רפואי מסוכן באביה. אליוט מדריכה את דאג בבניית קריירה חדשה, וטורק מנסה להתחמק מחולה היפוכונדר.

ג'יי-די מנסה לסיים את העניינים עם נינה, אבל היא לא מוכנה לכך. קרלה מנסה לשכנע את מר קורמן לבטל את התביעה. אליוט מנסה להוכיח את עצמה.

ג'יי-די מחפש אחר קרוב משפחה לחולה האהוב עליו. לאליוט נמאס משותפיה לעבודה, שלא לוקחים אותה ברצינות, ומגלה בעזרת קרלה וג'ורדן שהיא יכולה להשיג את מבוקשה כשהיא משתמשת בנשיותה.

ג'יי-די מרצה לקבוצת סטודנטים ללימודי טרום-רפואה על הרגעים הטובים ביותר שחווה מאז התחיל להיות רופא. שאר חברי הצוות מצטרפים אליו ומעלים זכרונות. אליוט מתמודדת עם פחד מילדים.

אליוט מתחילה להראות את ג'יי-די כרופא רגוע ומוכשר יותר. תחרות שירה בסגנון א-קפלה מתקיימת בין להקתו של השרת בביה"ח לבין להקתו של טד. טורק מתחיל להתייחס ברצינות לסוכרת שלו.

גבר שנפצע בקטטה בבר מלמד את טורק ואת ג'יי-די לקח בנוגע לחשיבות שבניצול כל רגע בחיים. לד"ר קוקס ולג'ורדן יש דיעות נוגדות בעניין הבאת ילד נוסף לעולם.

ג'יי-די נדלק על בחורה במועדון. אליוט מחליטה לנקוט עמדה משותפת עם אחד החולים נגד ד"ר קלסו. השרת סוחט את ד"ר קוקס אחרי שהוא חושף את הסוף של הסרט "החוש השישי".

ג'יי-די מנסה להרשים את קיילי ומשלם לקבצן שמגיע לבית החולים כדי שיביים התקף לב. טורק מגלה שקרלה יצאה עם ד"ר קוקס. דני סליבן חוזר ומעצבן את כולם, ואף גורם למריבה בין טד לבין דאג.

ג'יי-די מוצא מהדירה שלו. טורק וקרלה עדיין נאבקים לשמר את הרומנטיקה. לד"ר קוקס יש סיבה להאמין שבנו של חבר ותיק הוא אוטיסט.

ג'יי-די נוטש את קיילי לטובת ד"ר מולי קלוק, ששבה ממילווקי. קרלה כועסת על שיחות הטלפון התכופות של טורק עם חברתו לשעבר. השרת וד"ר קוקס מתערבים על אליוט.

ד"ר קלסו מקרצף בניתוח, כדי להוכיח טענה לד"ר קוקס. העניינים מתהפכים כשחולה שחצן לא מוכן להקשיב לו. ג'יי-די וטורק חוגגים, בעוד קרלה מחפשת נחמה אצל אליוט.

כשקרלה וג'יי-די יוצאים, הם משתכרים ובטעות מתנשקים. לאליוט יש בעיות עם חולה, שנטל גלולות לחיזוק האון הגברי.

טורק איננו מוכן לדבר עם ג'יי-די וקרלה, ומתקשה לשלוט ברגשותיו אחרי שגילה שהתנשקו. ד"ר קוקס מבקש את עזרתה של אליוט עם חולה במחלת הנפילה. השרת חש שהמדים החדשים פוגעים בגבריותו.

טורק לא נפתח בטיפול הזוגי. אליוט לא מקבלת את הייעוץ הרומנטי של ד"ר קוקס, וגבר מושך מאוד משוטט לו בבית החולים. ג'יי-די לומד לקח על האנושות מפיה של אישה גוססת.

אליוט קרועה, וחוששת שאם תניע את הקשר שלה עם ג'ייק מהר מדי, הוא יהרס. ד"ר קוקס מלמד את טור על אגו בריא. ד"ר קלסו והשרת רבים על הזכות להשתמש בעגלה הממונעת.

כשההתמחויות מסתיימות, שינויים גדולים קורים. ג'יי-די עובר לגור לבד, וטורק וקרלה שוקלים שינוי משפחתי, מה שיוצר קרע נוסף בקשר ביניהם. ג'ורדן נשכר לביצוע עבודת ניירת לד"ר קלסו.