Désormais en formation à l'Académie du FBI, Jess est momentanément appelée à travailler en collaboration avec l'Agent Nicole Scott : une jeune fille de 15 ans a mystérieusement disparu dans un centre commercial et la seule piste disponible est un enregistrement vidéo la montrant dans un ascenseur avec un inconnu...

Profitant d'une pause dans sa formation, Jess assiste au témoignage de Nicole lors du procès d'un malfaiteur. Mais le juge décide d'ajourner le procès lorsqu'elle reçoit une note l'avertissant du kidnapping de sa fille, Megan. Lapriorité étant la reprise du procès, Nicoleet Jess sont chargées de retrouver la jeune fille. Mais lorsqu'elles la découvrent tentant de s'enfuir de sa chambre par la fenêtre, elles réalisent que ce n'est pas la bonne personne qui a été kidnappée...

Dix ans après la disparition de son fils de2 ans et le décès de son mari, une femme, Susan, clame avoir vu son fils disparu à la télévision dans un match de football. L'analyse de vieilles photographies confirme que le jeune garçon vu par Susan pourrait être son fils...

Quelques heures après avoir quitté Boston pour Atlantic City, un autocar est retrouvé sur le bas côté de la route, sans aucun de ses 19 passagers. Au fur et à mesure de l'enquête, Jess et Nicole se rendent compte que la compagnie de bus est souvent mêlée à des affaires d'insécurité sur ses lignes...

Peu de temps après avoir quitté la scène d'un meurtre à New York, le médecin légiste Kate Weston disparaît brusquement avec son chauffeur et le corps de la victime. Le témoignage du docteur ayant servi à accuser nombre de criminels, Nicole, Jess et Antonio décident d'enquêter sur son passé professionnel. Suite à un rêve, John Pollock avoue alors que la victime était en fait une de ses sources utilisée pour permettre l'arrestation d'un cambrioleur professionnel...

Malgré des signes de lutte dans le pavillon d'une famille d'où ses parents portés disparus, leur fille de 17 ans affirme qu'il n'y a aucunes raisons pour que son père et sa mère soient enlevés. Jess et Nicole apprennent par la suite que la famille de son petit ami n'appréciait guère la mère de la jeune fille et que les parents disparus étaient mêlés à une affaire demeurtre d'un dealer de drogue. Les deux enquêtrices doivent alors collaborer avec la DEA, déjà chargée du dossier...

La voiture d'une patrouille de police est retrouvée à quelques kilomètres de New York vide et tâchée de sang, alors que les deux agents avaient répondu à un appel pour un cambriolage à Ridgeport dans le Connecticut. Nicole et Jess doivent enquêter sur cette disparition, dévoilant la corruption policière dans le Connecticut...

Jess et Nicole sont chargées de retrouverla fille d'une employée du Sénat. Cette enquête les amène à découvrir la disparition d'une journaliste qui écrivait un article sur le trafic de clandestins chinois...

Un ancien collègue de Nicole la contacte pour recevoir de l'aide dans une affaire de menaces à sa cliente, la célèbre chanteuse Kira Kelly. Mais lorsque celui-ci est victime d'un grave accident de voiture, Kira est introuvable. S'étant enfuie avec son petit ami du lycée, ils tentent de retrouver leur bébé abandonné lorsqu'elle était âgée de 16 ans...

A Baltimore, Rebecca Flynn, huissier de justice, attend Janice Anderson à la sortie d'un club de gymnastique, pour lui remettre une convocation. Sa mission accomplie, elle remonte en voiture et s'apprête à démarrer lorsqu'un inconnu la prend à la gorge... Le lendemain, le service de John Pollack est chargé d'élucider le mystère de sa disparition...

La disparition d'une vétérinaire dévoile une affaire plus compliquée : Jess et Nicole découvert la double identité du vétérinaire, Jared Hart, et redoutent qu'il ne l'ai assassiné un témoin protégé. Un agent recherchant Jared se propose pour les aider à le retrouver...

Jared Hart et ses complices tentent d'éliminer un autre membre du système de protection des témoins. Nicole et Jess se lancent sur les traces des assassins tandis qu'Antonio et John essaient de comprendre comment Hart localise ses victimes. En parallèle, l'équipe recherche toujours la femme de Hart...

Nicole travaille sous couverture auprès d'un revendeur d'armes qui souhaite s'en prendre à toutes les personnes ayant participé à une enquête sur son commerce illégal...

A la suite de l' arrestation d'un homme dangereux, Jess et Nicole trouvent un homme avec une balle à la tête s'accrochant tant bien que mal à la vie dans une voiture qu'il était vraisemblablement en train de voler. Amnésique, cet homme s'avère être la seule clé pour trouver le coupable...

Tamara, la soeur de l'ex-femme d'Antonio, la procureur Anna Dolores, est kidnappée. Antonio rejoint Anna qui s'occupe de leurs deux neveux et interroge John, l'ex-ami de Tamara qu'elle a viré pour ses dépendances à l'alcool et à la drogue.Bientôt, les ravisseurs récidivent en tentant sans succès de subtiliser les neveux. Antonio et Anna passent alors en revue d'anciens dossiers avec nostalgie, craignant qu'un condamnéréclame vengeance à peine sorti de prison...

Sa femme disparue, Max Keener devient alors le premier suspect sur la liste. Mais Nicole et Jess découvrent le lourd passé de cette femme qui avait décidé de reconstruire sa vie loin des souvenirs douloureux de son enfance et de safugue. Ce n'est pas tout, elle cache aussi un terrible secret : la fuite d'un homme violent et polygame, Jeffrey Harrington, dont elle est une des 7 femmes et qu'elle a tenté de fuir. Maisles fils de Harrington montent la garde autour du fief familial, véritable harem de femmes abandonnées...

Une biophysicienne, Ellen Steiborne, a disparu en emportant avec elle un échantillon d'un virus mortel qu'elle a mis au point. Pour compliquer les choses, elle prétend avoir été suiviepar un homme en costume. Elle se demande si legouvernement la surveillait ou si elle est vraiment devenue folle. Pendant ce temps, Toni et Douglas Mastriani débarquent en ville où Doug vient à disparaître à son tour. De surcroît,quand Nicole est mise à l'épreuve par la CIA pour divergence de point de vue, Jess, sur qui tout repose, doit faire la part de choses entre travail et famille pour rechercher efficacement les deux disparus. Mais des visions au sujet de son frère la perturbent...