En réponse à la soudaine demande en mariage de Clark, Loïs tente de savoir qui il est véritablement, Clark ou Superman ? Elle lui en veut de ne pas lui avoir avoué son identité secrète ; quant à Clark il lui reproche de ne pas être certaine de son amour pour lui et d'avoir repoussé sa demande. De son côté, Bill Church, désormais marié à l'infirmière Mindy, décide de créer une équipe chargée de protéger Metropolis contre le crime organisé et de veiller à sa sécurité. Sa femme et son fils pensent qu'il a perdu la tête...

Un truand, Spencer Spencer, décide de se glisser dans la peau de Superman pour commettre des crimes. Loïs et Clark s'avouent leur amour...

Informaticien génial, Bob Fences souffre de ne pas avoir obtenu la reconnaissance qu'il estime mériter dans le laboratoire de Metropolis où il travaille. Pour qu'enfin on s'intéresse à lui, il met au point une vengeance en plusieurs actes. Il commence par enlever Loïs Lane et lui fait croire qu'elle est détenue par des extraterrestres. Puis il lui greffe un système de contrôle à distance qu'il est le seul à maîtriser, avant de la relâcher dans la ville. Son but ultime : réussir à attirer Superman dans un piège et prendre le dessus sur le justicier adulé par les foules...

A Metropolis, Patrick Sullivan, l'ancien petit ami de Loïs, recherche une antique couronne irlandaise qui serait dotée de pouvoirs extraordinaires. Selon la légende, le prétendant à la couronne doit sacrifier la femme qu'il a le plus aimée...

Un étrange fait divers attire l'attention de Loïs et Clark. Plusieurs couples sans histoires disparaissent de Metropolis après avoir été en contact avec un célèbre thérapeute et avoir assisté à ses séminaires de relaxation. Les deux journalistes décident de se faire passer pour d'heureux jeunes mariés afin de participer à l'un des séminaires du psychothérapeute et de mener à bien leur enquête. Horrifiés, ils découvrent que Larry Smiley est un véritable fanatique, désireux de fonder une nouvelle société avec les personnes qu'il a enlevées. Loïs et Clark vont tout faire pour l'empêcher de mener à bien son funeste projet...

Tim et Amber Lake, un richissime couple de collectionneurs d'objets rares, décident de kidnapper Superman. Ils entrent en contact avec un criminel afin qu'il les aide à réaliser leur projet...

Lucille et Nell Newtrich, deux soeurs mal intentionnées, ont décidé d'anéantir Superman. Elles mettent tout en oeuvre pour le rendre mortel, utilisant, à ces fins, de la kryptonite rouge. Mais les deux jeunes femmes voient leurs plans pour le moins contrariés, puisque les formidables pouvoirs du héros se retrouvent accidentellement «transférés» dans le corps de Loïs. Celle-ci devient dès lors à son tour une Superwoman. Mais cette métamorphose s'avère aussi inattendue que de courte durée. Superman, redevenu lui-même, va tout faire pour déjouer les plans des deux sinistres créatures...

Lorsqu'une jeune femme de Metropolis, Leigh-Anne Stepanovic, prétend avoir donné naissance à un enfant illégitime de Superman, Loïs s'interroge sur la véracité de ses propos et décide d'interroger la jeune femme. Clark nie être le père, mais lorsque Loïs voit l'enfant soulever un canapé, elle se met à douter. Avant qu'elle ne puisse en apprendre plus, l'enfant est enlevé par un inconnu...

Un dangereux individu, passionné d'informatique, réussit un pari incroyable : il enferme Loïs dans un monde virtuel qu'il a conçu dans l'espoir de percer un grand secret...

Mindy Church, nouveau chef suprême d'Intergang, a décidé de lancer une terrible offensive contre Superman pour prendre le contrôle de la ville. Pour cela, elle compte neutraliser le super-héros en lui inoculant un virus inconnu qu'elle a découvert sur la planète Krypton grâce au «Bricoleur». Pendant ce temps, les parents de Loïs, Ellen et Sam Lane, décident de rendre une petite visite à leur fille. Ils apprennent alors que Clark et Superman ne sont qu'une seule et même personne et qu'il est sur le point de sombrer dans le coma...

Un célèbre illusionniste, Baron Sunday, s'installe à Metropolis. L'homme est plutôt secret mais il semble animé d'un implacable sentiment de haine. Il possède des pouvoirs occultes dont Clark devient rapidement la cible. Par ailleurs, la mère de Loïs, Ellen, engage un conseiller matrimonial. Son but : préparer avec soin le mariage de sa fille avec Clark...

Jack Olsen, le père de Jimmy, arrive à Metropolis où il fait la connaissance des amis de son fils, Clark, Loïs et Perry. Ceux-ci découvrent bientôt que Jack est un agent secret travaillant pour le compte d'un mystérieux commanditaire. Sa nouvelle mission consiste à retrouver, à n'importe quel prix, une disquette contenant des informations «sensibles». Loïs et Clark préviennent aussitôt Jimmy, qui refuse d'admettre la vérité. Bientôt, Jack se persuade que l'objet qu'il recherche est entre les mains de Loïs et Clark. Il va tout faire pour s'en emparer, mettant Jimmy dans une situation délicate...

Tempus, un dangereux criminel voyageant dans le temps, est de retour à Metropolis avec un plan diabolique : kidnapper Loïs et l'emmener avec lui dans un univers parallèle. L'opération réussit. Dans le monde qui accueille Tempus et sa prisonnière, Metropolis est encore plus sinistre...

Après deux ans et demi d'une brillante collaboration professionnelle mais d'hésitations et de tergiversations sur le plan personnel, Loïs et Clark sont prêts à relever un nouveau défi : le mariage. Mais ils doivent faire face à de nombreux obstacles. Ainsi, la soeur de Loïs, demoiselle d'honneur, pourrait ne pas être en mesure d'arriver à temps à Metropolis, et le révérend Bob n'est pas sûr d'être là. De leur côté, les parents de Loïs sont contraints d'habiter chez les futurs mariés, ce qui ne plaît pas beaucoup à Loïs. D'ailleurs pour les fuir, elle choisit de se consacrer à son travail et, pour un article, enquête sur le vol de grenouilles rares...

Juste avant son mariage, Loïs est enlevée par Lex Luthor en personne. Pour que Clark ne se doute de rien, il remplace Loïs par un clone. Toujours amoureux de la jeune femme, il la séquestre dans un bunker en espérant réussir à la séduire. Clark, de son côté, est à cent lieues d'imaginer que celle qu'il s'apprête à épouser n'est pas Loïs. Dans le bunker, l'ambiance est tendue et Luthor injecte une drogue à sa prisonnière...

Loïs, qui souffre toujours d'amnésie, est persuadée qu'elle est amoureuse de Luthor et qu'elle déteste profondément Clark. Lex l'emmène dans son repaire souterrain afin de maintenir son emprise sur la malheureuse. Pendant ce temps, un clone de Loïs, amoureux de Clark, est détenu dans un laboratoire secret du gouvernement. En échange de sa libération, le clone accepte d'aider Clark à piéger enfin Lex Luthor. Mais celui-ci a plus d'un tour dans son sac. Il avait en réalité prévu toute l'affaire dans ses moindres détails et parvient une fois de plus à se débarrasser de Superman. Du moins, provisoirement...

Afin d'être guérie de son amnésie, Loïs est placée sous le contrôle médical du docteur Elias Mendenhall et de son assistant, le docteur Maxwell Deter. Ce dernier, follement épris de la belle Loïs, essaie de limiter les visites de Clark, prétextant que la patiente est beaucoup trop fatiguée...

Loïs, qui souffre encore de sérieux troubles de la mémoire, souhaite reprendre au plus vite son travail au «Daily Planet». Contre l'avis du docteur Deter, elle met son projet à exécution et se lance dans la préparation d'un reportage avec Clark. Malheureusement pour elle, les événements prennent une tournure inattendue. C'est en effet le moment qu'a choisi Herkimer Johnson, un savant fou aux ambitions diaboliques, pour expérimenter sa toute dernière invention, un tourbillon électromagnétique dans lequel il aspire les deux malheureux reporters. Cette mésaventure a au moins un bon côté : la violence du choc permet à Loïs de recouvrer la mémoire...

Au cours de la réunion annuelle de ses anciens camarades de classe, Loïs retrouve son ex-petit ami, Joe Malloy, qui l'informe de la mystérieuse disparition de son épouse. Bientôt, une amie de Loïs disparaît à son tour...

Deux individus aux pouvoirs surhumains, des Kryptoniens, veulent défier Superman. Le premier, Ching, teste la force du super héros en provoquant la chute sur Terre d'une station orbitale. Zara, quant à elle, préfère mesurer son intelligence avec une série d'énigmes. Deux épreuves sont encore imposées par les Kryptoniens. Superman doit choisir entre sauver Jimmy et Perry ou se porter au secours de Métropolis. Pour sauver Ching, Superman doit aussi passer à travers un bouclier en kryptonite. Pourquoi tous ces tests ? Peut-être pour retrouver Kal-El. Un ultime rebondissement confirme cette hypothèse. Ching et Zara sont contactés par télépathie : Kal-El mourra, leur dit-on...

Ching et Sarah semblent être liés à un dénommé «Assassin», un ténébreux individu déterminé à éliminer Superman. Celui-ci dispose d'un sérieux atout : il a les moyens de combattre les pouvoirs du super-héros. Les parents de Clark et Loïs deviennent les cibles de sa fureur. Superman doit prendre la décision la plus difficile et la plus poignante de sa vie. Ses relations avec Loïs s'en trouvent à jamais changées...