La storia si basa sulle vicende di una antica famiglia di origine extraterrestre: i Jin. Giunti sulla Terra più di 200 anni prima, in seguito alla distruzione del loro pianeta natale, Bern, da parte del crudele Gaizok, i progenitori dei Jin, insieme coin i cugini delle famiglie Kamie e Kamikita, si integrarono con gli esseri umani in maniera perfetta e impararono a conviver con essi.

Le cose sembravano andare per il meglio, ma il passato, rimasto sepolto per due secoli, era destinato a tornare alla luce in maniera repentina e violenta. Dallo spazio, infatti, giuse nuovamente a distruggere le esistenze pacifiche dei membri delle famiglia, il malvagio Gaizok, accompagnato dal perfido generale Killer the Butcher.

Le mire di Gaizok non erano certo cambiate in tutti gli anni trascorsi, e il suo scopo era rimasto semplice quanto atroce: la completa distruzione di tutte le forme di vita dell'universo.

Le tre famiglie, risolute ad evitare la scomparsa della loro seconda patria, decidono di armarsi e si preparano a combattere contro l'efferato invasore. La base operativa King Biar viene rapidamente riattivata, così come il robot da combattimento Zambot 3, e comincia una disperata lotta senza quartiere contro un nemico subdolo e pericoloso. La popolazione terrestre, però, reagisce in maniera assurda di fronte al coraggioso comportamento delle tre famiglie e arriva a ritenerle responsabili del conflitto appena scatenatosi. Ciò nonostante il giovane pilota dello Zambot 3, Kappei, e i suoi fratelli non si scoraggiano e proseguono da soli la battaglia contro Gaizok, consci di essere l'unica ancora di salvezza del pianeta Terra.

La guerra attraversa fasi alterne, durante le quali si ha modo di imparare a conoscere tutti gli esponenti delle tre famiglie, e viene pagata a carissimo prezzo: alcuni degli eroici protagonisti sacrificheranno la loro vita in uno dei finali più drammatici e tragicamente commoventi dell'intera produzione nipponica.

富野喜幸(現:富野由悠季)が手がけたこの作品からは、随所にガンダムの源流とも言える要素を散見することができる。異星文明ガイゾックの地球侵略に対して、神勝平、神江宇宙太、神北恵子の3人は、合体ロボット・ザンボット3に乗り込んで立ち向かう。一般市民に敵視されるロボットヒーローを描いた衝撃の作品！※各話の初公開日は本作品の第1話の放送開始日となります。