崔莹送元朝公主和高丽的新王恭愍王回高丽的路上被奇辙派人阻挠，行刺元朝公主受伤命在旦夕，公主生死有关国家存亡。为救回元朝公主，求得“神医”崔莹借由华佗离开的“天门”天上（2012年）遇到正在作讲座的柳恩秀，因为柳恩秀能治愈和元朝公主一样的伤，所以崔莹就将全恩秀带了回去。

柳恩秀救活了元国公主，不想公主身边的女婢竟是内奸，将消息传了出去。柳恩秀一直以为自己是在拍摄影视的摄影取地之中，一心想回家。女婢借机将她偷偷放了。于达赤一员发现后一路跟踪，并将柳恩秀逃走的信息找人传达给了崔莹。女婢趁无人时想杀了公主，于达赤守卫突然出现没能成功，同时柳恩秀发现的跟踪的人便与他们换了衣服离去，却被奇辙的人抓走。崔莹找寻柳恩秀时错身而过，这时恭愍王和公主再次受到刺杀，崔莹只得赶回去先救驾。女婢借机要杀公主时公主醒了，崔莹及时赶到救了公主。并向恭愍王请允送柳恩秀回家。崔莹最终救了柳恩秀带到“天门”打开的地方送其回家，不料却被恭愍王派人阻止，最终崔莹执行皇命将柳恩秀留下，柳恩秀眼睁睁的看着回家的路消失。柳恩秀气愤之中拿剑刺向崔莹，崔莹迎面接受受伤。

崔莹伤重，柳恩秀执意要救其性命，将其带回客栈为其手术。崔莹保住性命。崔莹承诺一定会送柳恩秀回家，要柳恩秀在回家之前呆在他的身边。恭愍王和元朝公主回到高丽，奇辙同天摆宴将官员请去，无臣接驾。元朝公主原来在下嫁恭愍王之前就认识恭愍王，只是恭愍王不知道。高丽站在新王这边的群臣竟同时被毒气毒死。崔莹完成最后的任务有先皇的特设准其离开，恭愍王拒绝，要崔莹找到杀死众臣的真凶才可离开。崔莹便开始追查凶试探奇辙。崔莹伤未好受到感染高烧不退又不肯接受治疗。

奇辙得知崔莹是赤月队的人，一心想要拉拢崔莹。恭愍王接待柳恩秀并要柳恩秀做高丽的医仙。元朝公主发现崔莹在发烧，命令崔莹不要死。元朝公主能够讲一口流利的高丽话是因为小的时候想要和恭愍王说话。柳恩秀在知道自己回了元朝后回想着曾经学过的历史，并道出了许多之后会发生的事情。柳恩秀是从“天上”来的神医不但医术了得而且能预测未来的传言便传开了。崔莹担心柳恩秀安危要带柳恩秀到安全的地方，柳恩秀不同意，并被 张彬阻止，说是王的命令。崔莹伤口发炎晕倒，得张彬救治。奇辙听到医仙的传言要会会全恩秀看是否真有其人。火燧燐便去一探究竟，目标柳恩秀。只是试探火燧燐和崔莹交过手便离开了。恭愍王以朋友的身份问得崔莹直意要离开的原因。崔莹再次因病晕倒，没有于达赤队也没有相抗衡的力量恭愍王只得选择另一种方式接受接下来朝臣的参拜。柳恩秀以医仙的身份出现，迟到的奇辙却说柳恩秀是妖物。

柳恩秀当朝被指妖物，面对奇辙的不敬恭愍王巧妙转移话题，奇辙又想要以崔莹利用柳恩秀居心叵测为由定其罪行，大声呵斥崔莹在哪？柳恩秀开口说是自己的病人没她同意任何人不可以带走，奇辙面对柳恩秀的蔑视反击，柳恩秀迎面直视并职责，如不是在王面前也不会如此让他，要奇辙适可而止。柳恩秀记起历史对奇辙的记载，直言知道奇辙是如何死的。然后就溜了，出了朝堂已是一身冷汗双腿无力，好在张斌急时出现。柳恩秀给崔莹的伤口重新做了处理，伤势无碍但是崔莹迟迟不见醒来。奇辙要再见柳恩秀深夜拜访恭愍王行了君臣之礼，奇辙承认自己杀了谎称是为了王，恭愍王最终没有多做追究未直接说出自己知道的实情，让出柳恩秀七天为限，如果奇辙不能让柳恩秀心甘情愿的为他效力，就要毫发无伤的送回！崔莹没有求生意志停止呼吸，柳恩秀不放弃将其救活，元朝公主得知恭愍王让出柳恩秀，担心恭愍王身边没有忠心可信之人对王不利，固向恭愍王询问。奇辙派人带走柳恩秀。崔莹醒来后得知一切，直接去奇辙府邸救人。为了不被做为借口挑起事端，崔莹谎称是因为恋慕柳恩秀才过来想将人带走。

元朝公主为救柳恩秀和崔莹私自出宫。奇辙声称有病人要救，病人竟是前殿下。崔莹带着柳恩秀前去就医。元朝公主被奇辙埋伏，恭愍王派于达赤营救回宫。奇辙报恭愍王，崔莹劫走柳恩秀是为了救治前殿下易谋造反，恭愍王动摇。同时奇辙已安排好人行动造成崔莹谋反的证据。

崔莹带着恩秀和庆昌君逃亡到某军官的私宅里。虽然对该军官的行为举止有所怀疑，但已没有任何地方可去的崔莹一行人决定在此暂避风头，却不知已再次落入奇辙的圈套中。奇辙偷偷找到庆昌君并给他一瓶毒药，威胁他如果肯毒死崔莹就放过他。但是庆昌君替崔莹喝下了那瓶毒药。得知幼小的庆昌君是为了自己而选择死亡的崔莹抱着痛苦不已的庆昌君悲痛地流下眼泪，为了减少庆昌君的痛苦崔莹抱着他结束了他的生命欲让他安乐死。但看到这一幕的恩秀并不了解崔莹内心的悲痛，她误会了崔莹的举动并受到刺激而向外逃去。对于崔莹的阻拦她冰冷地说道：“别用你的脏手碰我”，看着离去的恩秀崔莹感到十分无奈和难过，为了保护恩秀他还是追了出去。慌忙逃脱的恩秀不慎与奇辙相碰。为了救恩秀崔莹试图以内功打倒敌人，却被同样内功深厚的奇辙拦下。看着火修人将如火般炙热的手放在恩秀的肩膀上，遭到官兵包围的崔莹被逼无奈扔下了手上的剑并跪地投降。

高丽王恭愍王和王妃当着众大臣的面脱下元朝服饰,穿上了高丽王族服饰,并向所有人说明一直以来崔莹是听从恭愍王的命令执行任务,不是谋反而是制止了前皇的反动,以此法洗清崔莹被奇辙诬蔑的罪行.奇辙要柳恩秀说出高丽的未来及元朝灭亡的原因,想改变未来获得更大的权力,恩秀没说.崔尚宫提醒崔莹说为了防止奇辙因为得不到而毁了柳恩秀,千万别对柳恩秀动心,崔莹否认了.崔莹和恭愍王一行人以王妃身体有病将奇辙和柳恩秀诱入皇宫,意示恩秀配合说谎,指证奇辙手下有反动意向,撤官职并没收了财产,解救了柳恩秀.奇辙为了证实恩秀是不是真的从天上来的,将华佗遗物中的第二项带入宫给恩秀看,恩秀却在手扎上看到了自己的名字。

柳恩秀看到奇辙送来的手扎里有自己的名字,并且手扎里是自己的字迹,怀疑里面的内容是类似坐标一样的数据,是自己能回到现代的方法,但奇辙不愿意把手扎给她.恩秀想以奇辙想知道的未来为条件与奇辙交换条件,奇辙让练音功的手下用内功窃听恩秀的话,从中得知恩秀欲以欺骗方式对付奇辙.崔莹得知后急忙阻止柳恩秀说话,却听到恩秀说救下的人是将来杀崔莹的人.崔莹和恭愍王计划收为已用的大臣名单被奇辙派人偷走,并让手下胁迫柳恩秀目睹了大臣们一个接一个被杀的情形,威胁接下来要杀她最重视的人。

天音子与火燧燐带着恩秀将名单上的人一一杀害，崔莹得到消息的时候天音子已经杀掉好几个人了，他急忙前去救恩秀。火燧燐威胁恩秀说出自己想知道的事，恩秀不顾威胁离开。这时于达赤部队的人赶来救她，恩秀目睹天音子使用音功杀害侍卫出来阻拦。崔莹知道己方敌不过他们，便眼睁睁看着火燧燐离开。奇辙直言希望恭愍王不要做英明的王，只要做昏庸之主就好。奇辙离开后，恭愍王急忙去王妃的宫殿确认她安然无恙并将她带到自己的寝宫。崔莹在与奇辙的对峙中受了伤，但他强忍着不愿别人看出来。崔莹他知道恩秀知道未来会给她带来很多麻烦，奇辙决不会放过她，便决定尽早送她回去天界。恩秀答应崔莹自己会好好考虑他的建议。奇辙招来手下最得力的杀手部队，并准备改变对付恭愍王的策略。崔莹为了保护恩秀便向恭愍王保证自己会带来人才，用光明正大的方式请来人才，请恭愍王不要动恩秀的主意。恩秀换上找来的男装，拿上行李单独上路准备去找天门，可是她刚走了没多远便被闻讯而来的崔莹抓住。恩秀正式跟他道别，坚决不愿回去，说自己不愿有人为她而死，不愿卷入这个世界的纷争，崔莹根本不可能时刻保护她。崔莹被她说得哑口无言，只能眼睁睁看她离开，可是这一幕都落入奇辙派来监视恩秀的人眼中。崔尚宫跟崔莹谈过以后便很不放心，她连夜赶去找到恩秀，将崔莹往事告知恩秀，猜崔莹一定是做好了死的准备。恩秀听过崔尚宫的话，急忙骑马向京城赶。

崔莹夜晚到奇辙府上，恩秀一刻也不停地赶回京城，向奇辙府跑去。赶到的时候奇辙跟崔莹正在打架,崔莹不是奇辙的对手，很快便落了下风，崔莹发现刚才所用的招式跟自己之前做的梦里的一模一样，两人正在殊死搏斗事，恩秀出现并用自己的命威胁两人停止争斗，奇辙逼她说出自己的死期，恩秀颤抖着说他大概在四、五年后死，而他死后恭愍王依然是高丽王。奇辙走后恩秀和崔莹吵起来，骂他不珍惜生命，竟然一心求死，她说自己把所有的希望都寄托在他身上，可是崔莹实在太让她失望了。听了恩秀的话崔莹觉得自己有了活下去的意义，就是保护恩秀。恩秀为崔莹包扎好伤口，将他被奇辙用内功冻坏的手握在掌心为他取暖，并忍不住哭了起来。崔莹向她保证自己再也不会这么冲动了，保证自己会好好活着。奇辙每次使用内功都很引发身体的旧病，这次跟崔莹的大战让他的病更加重了。身体上的超负荷，加上恩秀所说的关于他的死期的话，让奇辙下定决心要尽全力改变自己的命。崔莹将恩秀交给王妃来保护，恭愍王问恩秀关于高丽将改名为朝鲜的事，恩秀推说朝鲜只是远方的一个国家。崔莹害怕恩秀再说出什么惊人的话，急忙阻止她，恩秀被他逼急了忍不住跟他吵起来。两人就这么在恭愍王和王妃面前大吵一通，让众人看得叹为观止。于达赤的人围在一起讨论着恩秀与崔莹的事，他们都看的了崔莹与恩秀握手言和的画面，在古代这种行为自然被认为是伴侣才能做的，大家都觉得两人一定在一起了。崔莹的心中已经有了恩秀，他把剑上梅姬留下的布条取下。他跟崔尚宫谈过之后，觉出宫内一定有奸细，便决定引出杀手和这名奸细。崔莹跟崔尚宫设下的圈套，就是为了引奇辙的杀手出来。让恩秀用自己所知道的历史帮助恭愍王选择可以任用的大臣，被奇辙的内应听到并传递。奇辙私闯坤成殿，恭愍王大怒，奇辙不敬的说出要更换高丽之主的事。天音子和火燧燐奉命去找德兴君，这个德兴君是恭愍王的叔父，他听从火燧燐的建议将那本日记给恩秀送来。崔莹在宫里遇到七煞组织的刺杀，他冷静地解决掉对手，劝剩下的杀手停止行动，可这些人还是不停地杀来，崔莹不得不一一将他们杀死。

奇辙通过德兴君将那本日记拿给恩秀，条件是恩秀要跟着德兴君走，恩秀自然不同意，宁可不要日记也不跟他走。崔莹将七煞的人都处理掉后回到皇宫，发现恩秀正把于达赤的人召集起来给他们发自制的牙膏，恩秀发现崔莹满身血腥便跟着他回到住处要为他检查身体，上次崔莹被冻伤的手还没有好全，张彬为他配置了新的药物，恩秀看到崔莹整个手背都裂开，便着手为他包扎。崔莹告诉她自己派人驻守在天门附近，一旦天门出现就立刻送她回去。其实恩秀早已明白自己要想回到现代已经很困难了，她决心要在这里快乐的生活，努力适应这里的生活，跟古人们认真相处。崔莹去向恭愍王复命，看到他安然无恙回来恭愍王很欣慰，接下来他们要做的就是保护来投诚的学者们，他们要严防奇辙使出新的花招。奇辙正在跟德兴君秘密会面，他将现在的局势分析给德兴君听，为了让德兴君帮他得到恩秀的心，答应满足德兴君的任何要求。恭愍王的宴会马上就要召开了，崔莹将属下严密部署一番，并去找鹰鹫帮的人支援。他正跟叔父交谈时突然看到德万跑来找他，崔莹以为是恩秀又出了什么事急忙跑过去，谁知恩秀只是来集市上买药材，她准备做美容用品在古代大赚一笔。恩秀的计划让崔莹不由得笑起来，几人正在逛街时意外遇到了德兴君，崔莹一看到德兴君便升起一种危机意识，他立刻要求侍卫们严密看护恩秀，并将她的一切言行统统上报自己和崔尚宫。崔尚宫得知德兴君与奇辙合伙急忙去见王妃，为了防止有人偷听谈话，她们便在纸上交谈。崔尚宫觉得德兴君此番进京肯定目的不纯，他是除了恭愍王以外唯一的王族，现在他跟奇辙联合起来，肯定是为了图谋王位。崔尚宫没有猜错，奇辙就是打算废掉恭愍王将德兴君推上去，可是这位德兴君却不是那么容易掌控的。王妃在晚上设下酒席宴请恭愍王，她很担心恭愍王的处境，想借元朝的势力帮助他，可是恭愍王却不愿听她的话。他将自己准备好的礼物拿给她看，这些礼物中有一样便是当初两人第一次见面时王妃所戴的面纱。原来恭愍王早就认出王妃，一直忍到现在才说出事实。他知道自己现在什么都没有，一直想凭自己的力量保护高丽对抗元朝，却爱上了身为元朝公主的王妃，现在他将心里话全部说出来，就是想跟王妃从此携手对抗风雨。翌日，朝堂上，崔莹护送着一群学者们来到，看到这些人终于安然无恙地出现，恭愍王的心放了一半。接着恭愍王亲自宣读了一份圣旨，将奇辕、子云等一批奇辙的亲信大臣，并将那些学者们置于高位。

奇辙污蔑崔莹为了五百两的贿赂购买劣质武器，并说如果崔莹不认账，那么手下那个红匣子的于达赤部将就要受到惩罚。崔莹气极了当场举着那个匣子问众人知否知道里面装的是何物，众人纷纷说不知道，崔莹便说要将匣子返回去，并将部下们遣出朝堂。可是新上任的丞相却不肯放过崔莹非要他解释受贿一事，怒极的崔莹直接说自己并没有受贿，要是王不相信的话他听凭处置，说完便头也不回的离开。崔莹回到住处，看到这里被翻得一片狼藉，珍藏的布巾也被随意仍在地上，他还没来得及定下心绪，赵日新便急忙赶来宣布对他的处决，崔莹被停职候审。一直跟崔莹作对的赵日新一抓到这个能够打击崔莹的机会便忍不住趾高气扬，崔莹瞬间明白这桩阴谋肯定也有赵日新的份。恭愍王对于这些大臣们丝毫不顾念往日崔莹对于他们的恩情的做法很生气，可是这些大臣却反过来说崔莹一直在操纵恭愍王，相当于摄政，而且崔莹曾经是杀手，这样的人在恭愍王身边是很危险的。这样的话让恭愍王更是生气，可是他却无力反驳这些人。恩秀将日记本上的文字都抄下来，这些东西看起来像是大串的数字，可是她还没能完整的破译出来，她看着书页末尾那个属于自己的签名陷入深深的沉思中，等德兴君把日记本拿走后恩秀继续破译这些数字的秘密。皇宫内的一举一动很快就通过奸细传入奇辙耳中，他把德兴君叫到密室里询问他跟恩秀相处的情况，再次用利益诱惑他跟自己合作，德兴君说自己要想活命只能得到王位，奇辙便开始计划谋朝篡位。崔尚宫再也不能容忍这些奸细的作为，她开始着手将他们抓起来，一番审问后这些奸细说出奇辙交代的事，原来他们听命要偷出元朝发放的玉玺以造成恭愍王跟元朝的隔阂，趁机推翻他。恩秀找到因罢官而在宫中闲坐的崔莹，告诉他自己已经明白那本日记中数字的意义，原来这些数字是记录的时间，很可能推算出天门打开的时间。恩秀告诉崔莹他在天界很有名，还有一首关于他的歌，听到那首歌词后崔莹很震惊。恩秀安慰他说他的清廉在天界都很有名，让他不要为了这点小挫折而丧气。

崔莹去找德兴君要解药，德兴君表示他只有两条路，成为王或者死，要崔莹去偷来玉玺才会给解药。崔莹直接到皇宫见恭愍王，把事情全部告诉了恭愍王，希望王能够把玉玺交给德兴君。恭愍王斥责崔莹，崔莹表示如果不给就要亲自拿到。崔莹硬闯欲夺玉玺，于达志奋力抵抗，崔莹最终用调虎离山计偷得玉玺并逃出皇宫，用玉玺换得解药，但被告知需要3天一次连续七次才能完全解读（每3天向德兴君拿一次解药）。德兴君把玉玺给了奇辙，但是并没有告诉他为什么崔莹会献出玉玺的原因。奇辙开始怀疑德兴君。另一方面，恭愍王悟得玉玺上写的是元朝驸马令，根本不是堂堂正正的王印，体会了崔莹的苦心！恩秀醒来说自己解开了天界大门日期之谜。奇辙欲以玉玺丢失的罪名逼迫恭愍王退位，但是被恭愍王巧妙解开了窘境。德兴君和赵日新密谋起义。第三天，崔莹向德兴君要解药，德兴君要求崔莹待一晚上，但是此时，赵日新动用了王的部队，攻打奇辙府邸，王大怒，赵日新逼宫。此时，奇辙也知道自己被德兴君算计，决定乘机攻打皇宫。崔莹两难，恩秀昏迷。

崔莹去皇宫保护王，看出德兴君舍弃不了自己的姓名并威胁德兴君要是不给解药就杀了他。德兴君拿出解药赶到皇宫在大臣们面前把一切的罪孽都推倒赵日新身上并杀了赵日新。德兴君又有新阴谋。恩秀急于知道梦境是不是真的，想去找奇辙或德兴君，被崔莹阻止。德兴君和奇辙假传圣旨，内容是让德兴君任监国掌管政权。崔莹带恩秀找奇辙，得知华佗衣物尽数被德兴君抢走，奇辙得知恩秀中毒，为了和恩秀一起去天国，他说会把日记的后半本和第三件遗物拿回来。恭愍王一行和王妃汇合，并放出消息说恭愍王要在外处理政事。奇辙崔莹恩秀一行去皇宫找德兴君索要解药和遗物，崔莹逼德兴君吃下了和恩秀一样的毒药，德兴君要求和恩秀单独去解毒。德兴君断定恩秀是假医仙，是骗人的，并以解药威胁恩秀和自己一起欺骗奇辙控制整个国家，恩秀暂时答应了他，要到了解药，要求德兴君拿出剩下的日记。奇辙想得到医仙，觉得首先一定要和德兴君一起除掉崔莹。恩秀要求自己待在医典室，说她又自己的计划。崔莹去见了大臣们，得知百姓要为恭愍王做玉玺，且大臣们要求在制作玉玺直到交给恭愍王的过程中崔莹的保护，要求第二天崔莹随行保护。恩秀得到剩下日记的一半，隐约觉得这是自己的字迹，并且日记里面出现了“他”。崔莹为了安全起见，有一段路程决定自己一个人来守护大臣们。日记里预言了第二天所会发生的事情，并透露只有自己才能改变崔莹死去的结局。此时崔莹已经踏上征程，恩秀是否可以改变命运。

恩秀得知崔莹将要面对的危险是德兴君设计的陷阱，跑去质问德兴君，德兴君说只要恩秀与自己结婚就可以终止这次的行动。恩秀毫不犹豫的答应。与此同时，崔莹与准备送予王国玺的大臣们被困在藏了炸药的房间内，然而行动却突然终止。恩秀回到住处，张御医告诉恩秀崔莹已经安全撤离。正好德兴君派人送来礼服，恩秀告诉张御医自己答应与德兴君结婚。大臣们带着国玺在崔莹的保护下安全到达王在民间的住处。王用新的国玺下达了第一道教旨，就是恢复崔莹的权利。崔莹对突然撤离的杀手很是奇怪，正在怀疑之间，听闻恩秀要和德兴君结婚的消息，十分震惊。急忙回宫找恩秀。恩秀满心想的都是崔莹，德兴君答应给予她王妃的位置，但被训斥。崔莹不顾危险，闯入德兴君处来找恩秀。问恩秀是不是为了救自己。并且要求恩秀和自己一起走。恩秀不答应，说自己是想要记载了崔莹发生危险的日期的手册后半部分。但是德兴君却背着恩秀偷偷将手册烧毁。崔莹答应王帮他重返宫廷。恩秀告诉崔尚宫说自己只是口头上答应婚约。德兴君找来奇辙继续联手对付王，奇辙透露天界之门打开的时间会很快。崔莹带着于达赤在宫廷内外忙碌。恩秀晚上偷偷跑去德兴君处找手册，被崔莹撞见，并且称不需要冒着危险去找，自己从未贪婪过。恩秀却遗憾自己能为他做的事情只有这个了。崔莹为了帮助王十分忙碌，同时奇辙和德兴君也加紧对付王行动。恩秀带着婚书和聘礼找德兴君说明要取消婚约。德兴君却提醒她要是跟崔莹走，就是他俩的不正当行为，会受刑。德兴君提前了婚期，决定在普济寺直接举行婚礼。同时王所在的贤居村也将要受到包围。崔莹赶到恩秀与德兴君面前，恩秀提醒他赶快去救王。崔莹为了阻止婚礼，当着众人的面吻上了恩秀

由于崔莹的行为，婚礼暂时终止。而在宫外的王开始逃亡。奇辙的私兵扮作强盗攻击王和王妃。于达赤为了保护王死伤严重。柱石也在行动中牺牲。奇辙想要带走医仙去天界之门，然而德兴君却不让，提出必须先办国丧。德兴君来找恩秀，让恩秀救救自己，要求她逃去和崔莹一起，但是不能被奇辙发现，要藏十天以后自己就会受到元朝的封王诏书。趁着恩秀不注意，德兴君又在恩秀的手臂上下了毒。逃跑过程中的王和王妃在无奈之下由替身拖延，二人在于达赤的保护下遇见了由崔莹派来救援来的中郎将，并且顺利逃过危险。恩秀来到崔莹住处，崔莹一听说急忙跑回。恩秀说自己是哭着求德兴君，自己才被放出来的。德兴君被抓，王顺利回到宫廷。听说于达赤牺牲众多，崔莹痛苦不已。张御医推测恩秀是中了日本国的毒，但不会很快发作。王找到崔莹表示让于达赤牺牲的难过与抱歉，崔莹告诉王，自己一直将恩秀放在第一位，让王放了自己。恩秀为了安慰崔莹，学着电影里的样子。将韩语写在纸上给崔莹看，但是崔莹却不知纸上写的和恩秀说的其实根本不一样。恩秀嘴上是安慰，但写在纸上的却是要陪在自己身边。崔莹答应会保护恩秀到天界之门打开那天。王召开会议决定要将奇辙关押在家中。崔莹发现了恩秀手上的伤口，知道恩秀又被下了毒。责怪恩秀不告诉自己，恩秀表示是不想让他为难。崔莹生气离开，恩秀从身后抱住崔莹，问他如果自己不走，留下来可不可以。王准备放德兴君出宫，崔莹告诉王，德兴君又对医仙下了毒。但王仍然没有对德兴君治罪。原来元朝的断事官来到了开京，此时无法惩罚德兴君。此时，却有神秘的人出现，并且救走了德兴君，还在恩秀住处放了一封神秘的信，崔莹打开才发现是元朝人得知恩秀的事，要带走恩秀。二人决定开始逃亡。

元朝断事官召集高丽重臣们以威胁王，并且要求处刑恩秀。王让崔莹带恩秀逃走。原来，恩秀收到的信是德兴君送的，目的是支开恩秀和崔莹，让王孤立。恩秀和崔莹开始了逃亡，并且发现了对两人的通缉令。逃亡过程中两人的感情升温。王妃怀孕，王高兴不已。元断事官加紧对王的威胁，要求处刑恩秀。王妃受到一封断事官的传信。王妃要求去普济寺祈福，然而在祈福的时候，王妃却不见了。崔莹和恩秀两人继续逃亡，恩秀却在意外中发现了一个塑料胶卷盒，里面竟然是未来的自己写给现在自己的信。

恩秀看着过去的自己留给未来自己的信，震惊同时心痛难忍。她从信中得知如果不会宫王妃就会出事，而崔莹也会永远愧疚自责，所以劝崔莹赶紧回去。这时，宫内王正为找不到王妃着急万分，他认为找不到王妃是自己的报应。而崔尚宫在王妃宫里发现了断事官发给王妃的信函，于达赤受到王的命令搜查断事官的住处。恩秀为了让崔莹回到宫故意对他发脾气。崔莹无奈只好答应她一起回去。断事官从王宫回来，怀疑是德兴君私自动用了自己的印章，而诱拐王妃出宫。并暗示他王妃娘娘必须安然无恙。王单独和德兴君谈话，要求将王妃还给自己，并且愿意用王位来换。崔莹和恩秀回到开京，并且用心理战对付德兴君。王重振信心正式面对元朝断事官，并且否认了恩秀来自天国的事实。表示不会屈从与元朝。崔莹找到了王妃的所在地，救走了王妃，但是却流产了。奇辙认为恩秀是用假话骗自己，所以同意和德兴君联合对付恩秀。崔莹要保护恩秀，恩秀表示自己要藏才高丽最安全的地方，知道天界之门开启。然而，崔莹发现新加入的于达赤部队二等兵竟然是恩秀，并且和二人同住。

恩秀成了于达赤的一员，决定和崔莹一起共进退。被恩秀耍得团团转的奇辙，以为恩秀的神医身份是谎言，而终于看清了现实，并对恩秀一直以来的“欺骗”大怒。因此奇辙请德兴君带头企图攻击王宫，恭愍王则准备横扫高丽国内的亲元派。而另一方面，随着天穴开启日一天天的临近，崔莹越发想让恩秀留在自己的身边，崔莹的心也越发焦虑起来。

元朝断事官派刺客到崔莹卧室，打碎了恩秀的解毒剂。同时将王位给了德兴君。恭愍王到行省旁听，遭到断事官和奇辙的袭击。崔莹想要带恭愍王出去，但恭愍王坚持等宫中大臣盖印派禁军来救他。崔莹为了不让更多的手下沾满鲜血，独自在外杀了很多袭击的卫兵。经过漫长讨论宫中终于来了禁军。但元朝断事官放走了德兴君。德兴君告诉奇辙恩秀的确是天界来的，这让奇辙再次想要见到恩秀。恩秀隐晦地问崔莹如果自己先走了他会怎么样，但崔莹并未明白她的话。后来崔莹从恭愍王、德万和崔尚宫得知恩秀的解毒剂制作失败，生气地让恩秀一定要回去，恩秀拒绝。两人相视而哭。

恩秀为了解除体内的毒决定服用另一种剧毒。崔莹得知恩秀的计划后十分惊讶，大声吼道：“要以毒攻毒？成功的概率是多少？”。对此恩秀说道：“要听真话吗？完全不知道，我是第一个实验者。但是如果什么都不做就这样等着的话，一旦开始发烧就都晚了”。崔莹拿出恩秀的日历说道：“看着这个我一直再想剩下的时间里我要为你做些什么。但是如果就这样结束的话，我就没有任何可以为你做的了，也没法让你微笑。为何你会如此冷淡呢？”。恩秀安慰让他放心。看着高烧不退的恩秀，崔莹突然想起了曾将阿司匹林递给自己时恩秀说的话，便亲自咬碎阿司匹林后用嘴喂给恩秀服下。另一方面，奇辙也开始采取行动，打算带走恩秀。

奇辙将恩秀绑架走，尽快向天界入口赶去。崔莹成功救出被奇辙绑架的恩秀，看着身体虚弱的她崔莹眼含泪珠问道：“现在都好了吗？那么可以待在我身边了吗？”。看着恩秀深情点头的样子崔莹一下抱住她。两人互相凝望着躺在床上时，崔莹对恩秀说要带她去时光之门向家人问候，还十分自信地说有把握战胜奇辙，因为他已有了她。看着熟睡的恩秀，崔莹轻轻抚摸着她的头发流露出无比幸福的微笑，仿佛时光只定在这一刻让人看了也被这幸福的气息所感染。第二天在时光穿梭的入口处，两人遇到了奇辙。为了守护身旁的恩秀，崔莹奋力抵抗着奇辙，却被他的冰功所伤失去了意识。被强行带走的恩秀独自进入了时光隧道，而奇辙终究未能达成所愿。回到现代的恩秀为了救受伤的崔莹，赶忙找齐各种药后再次穿越了时光隧道。然而恩秀到达的地方，是在她与崔莹生活过的提前100年的高丽。在那里她等着时光之门的再次开启后穿越回到现代，为了见到崔莹她毅然决然地放弃现代生活，再次回到高丽。就这样她经过多次的时光穿梭后，终于回到了恭愍王继位5年后的高丽时期，并重逢了一直等着她的崔莹。两人眼含泪珠深情相望，幸福的人生也将从此展开。