Alla fine della scorsa stagione, John è finito in prigione per oltraggio alla corte durante il processo per negligenza. Verrà rilasciato a patto che chieda scusa al giudice,cosa che farà malincuore, e che frequenti un terapeuta per lavorare al suo problema con l'autorità. Tuttavia, il terapeuta, Katherine Simmons, ha anch'essa i suoi problemi con le autorità. Nel frattempo, Jake non sopporta più la fastidiosa abitudine di descrivere ogni piccola cosa per lui, che ha la sua nuova ragazza.

John è più irritabile del solito quando cerca di smettere di fumare, Reggie pensa che un cliente dai modi gentili (Colin Ferguson) gli abbia sottratto tutta la sua fortuna e lasciata solo la cattiva sorte.

Tutti rimangono scioccati quando Jake annuncia che si è sposato durante il fine settimana con una donna incontrata al matrimonio di un amico. Dopo aver realizzato che si è trattato di un colpo di testa, Jake ottiene l'annullamento del matrimonio.

Un uomo, all'apparenza un senza tetto, intenerisce i cuori di tutti. Becker ignorando il suo primo istinto, pensa sia un truffatore, gli viene in aiuto offrendogli una consulenza medica. Bob, Jake e Reggie gli danno del denaro e un pasto caldo, tuttavia, l'uomo non è in realtà senza fissa dimora e la banda è sconvolta quando scopre la sua vera professione. Nel frattempo, Margaret, ha un disperato bisogno di denaro extra, ottiene un secondo lavoro ma presto se ne rammarica.

John segue il consiglio di Reggie, chiedere scusa quando delude una donna, ma gli si ritorce subito contro, Jake e Bob si scambiano i relativi lavori per un giorno.

John si fa male la spalla e deve fare una risonanza magnetica, ma ha paura, così chiede a Reggie di andare con lui per fargli coraggio; Linda esce con due gemelli identici.

Jake incontra un uomo depresso che sta per impiccarsi, così lo porta alla tavola calda per tirarlo su di morale, John viene a sapere che la moglie di un suo paziente è rimasta incinta con un altro uomo.

Sara, la stronzetta snob della panetteria, nell'ennesimo tentativo di sminuire Reggie organizza un'uscita a quattro al ristorante. Reggie, che mentendo per orgoglio dice di avere un nuovo partner, supplica Becker di accompagnarla.Durante la cena John, riceve una chiamata di emergenza e deve correre dal paziente, lasciando a malincuore la sua carta di credito per pagare il conto. Sara torna a casa prima per mettere a letto i bambini, lasciando il marito Richard e Reggie soli a godersi il resto della cena. Ma i due si godranno più di un pasto, finiranno la serata con un dolce che non era sul menu.

John crede di avere finalmente un rapporto perfetto, visto che da diversi mesi frequenta Laura, senza pressioni sentimentali e con tanto sesso occasionale privo di responsabilità. Purtroppo per John, Laura non la pensa così, vuole un impegno più serio, qualcosa che John semplicemente non è pronto a fare.Nel frattempo, Bob si vanta di aver trovato un anello del Super Bowl sul sedile posteriore di un taxi e decide di venderlo piuttosto che cercare il suo legittimo proprietario. Mentre, allo studio medico, Linda cerca di parlare con i suoi genitori che stanno per divorziare.

John accetta con riluttanza di comprare un regalo di Natale ad un bambino povero ma poi scopre che deve consegnarlo di persona e cominciano i guai, Bob fa visita sua madre e si scopre che lo considera ancora come un bambino.

La giornata di Becker è piena di persone stravaganti, da due ragazzi che vogliono una prescrizione di marijuana ad un uomo sconvolto perché scopre che non sta per morire.

John si impegna a fornire assistenza medica gratuita a Bob, Reggie e Jake in cambio di riparazioni cibo e riviste.

Becker avrebbe voluto trascorrere il giorno di San Valentino in pace a guardare la partita dei Knicks in TV con il suo amico Jake, ma i suoi piani vengono cambiati. E John si trova alla fine della giornata in un bar alla stazione, intento a raccontare le vicissitudini occorsogli ad un barista (George Wendt di Cin cin 1982) completamente disinteressato: Tutto è iniziato quando la sua ex-moglie che vole sposarsi proprio il giorno di San Valentino li ha mandato una partecipazione.

John è preoccupa che le donne non lo trovino più attraente dopo aver ricevuto un un commento sprezzante dalla fidanzata di Jake, Linda teme di essere sostituita, quando vede una nuova ragazza allo studio medico.

Per l'annuale servizio alla comunità, Becker rifiuta un corso di primo soccorso nella locale prigione ed opta per una conferenza sulla nutrizione alla scuola elementare in una classe con bambini di 8 anni. Le cose ben presto precipitano rispetto a quanto pianificato, quando gli alunni portano la discussione dal parlare di cibo sano e la piramide alimentare a domande sul sesso!. Intanto due poliziotti usano tavola calda come base per un appostamento, venendo infastiditi da Bob, Alex e Reggie.

John è contento, quando viene a sapere che una sua relazione medica sarà pubblicata sul The New York Medical Journal, quando però legge l'articolo si accorge che l'orribile foto dell'autore non centra niente con lui, e va su tutte le furie. Deriso da ex compagni e amici, decide di contattare l'editore, Wally (Wayne Knight -Jurassic Park 1993-), per convincerlo a correggere la foto, ma scopre che non si tratta di un errore !. Nel frattempo, Jake perde l'udito dopo essere seduto troppo vicino alle casse ad un concerto, Linda uscendo con Arnoldo, l'uomo che consegna l'acqua, da sfoggio della sua volubilità, da prima vuole troncare poi essere richiamata ed infine quando è lei ad essere scaricata tenta la riconquista !!!

Ad un paziente diventato muto a causa della SLA, John procura un tastiera elettronica in grado di parlare per lui, ma l'uomo dal carattere scontroso la usa per offendere le persone, Bob si trasforma in un ambientalista per impressionare una ragazza, Linda accusa Margherita ed una suora di averle rubato il suo braccialetto.

Per sfortuna di Jake, Reggie è determinata a esaudirgli gli obiettivi della lettera, speditagli dal suo insegnante, sulle dieci cose che si proponeva di raggiungere nella vita, al tempo delle scuole elementari.E questo provocherà solo dolore e imbarazzo a Jake. Nel frattempo, Linda salvando la vita ad un paziente, si convince di essere un dottore ed inizia a dare ordini su come dirigere lo studio medico tra il disappunto di John e Margaret.

Il Congelatore della tavola calda si è rotto e Reggie non può far fronte alla spesa di uno nuovo, Bob dice di aver un amico, Leonard, che potrebbe fagli un buon prezzo. Ma ben presto le cose si mettono male, infatti Leonard da prima prende in giro Jake perché è cieco e poi ricatta Reggie, chiedendole un appuntamento in cambio dell'affare. Nel frattempo, John si dovrà improvvisare terapista sessuale per i Bennetts, una coppia di ottantenni che hanno problemi a causa della rinvigorita libido del signor Bennett dovuta alla cura prescritta da Becker.

Il bucato in lavanderia, l'appartamento e la posta del Dr. John Becker, sono stati manomessi e lui è sicuro che il colpevole sia uno dei suoi fastidiosi vicini. Deciso a risolvere il mistero, affronta tutti gli inquilini nella riunione settimanale. Nel frattempo Chris, la nuova ragazza del condominio di Becker, ottiene un gran successo con la banda alla tavola calda, ma con il suo comportamento vivace riesce solo ad oscurare la già miserabile giornata di Becker.

Quando John riceve otto costose bistecche da un paziente, la sua nuova vicina di casa Chris lo costringe a dare una festa.

John è sorprendentemente turbato quando viene a sapere che la sua vicina di casa Chris ha lasciato la città senza salutare. L'istinto femminile dice a Reggie che John ha più di una semplice curiosità verso l'ottimistica ragazza ed ingelosita, cerca di far capire a Jhon i sentimenti che prova per lui. Nel frattempo, Linda subaffitta il suo lavoro allo studio medico per una settimana ad una ragazza che riesce effettivamente a fare meno lavoro di lei

La quarta stagione si conclude all'insegna del romanticismo con Reggie e la nuova vicina Chris (Nancy Travis) in competizione per l'affetto di John. Contemporaneamente, Linda invita Margaret a passare la serata in città, vista la scarsa vita sociale che conduce e che Margaret rimpiangerà.