Marcus Chaplin, a Colorado USS tengeralattjáró kapitánya parancsot kap két pakisztáni célpont atomtöltettel való megtámadására. Azonban mivel nem a megszokott rádiócsatornán érkezik az utasítás, ezért úgy dönt, hogy a támadás előtt megerősítést kér egy felettesétől. Az akció pedig kezdetét veszi.

A szigeten található NATO radar segítségével Chaplin tudomására jut, hogy kommandósokat dobtak le a szigeten egy utasszállító repülőgépből. Kendal vezetésével ekkor egy osztag kimegy a terepre, hogy kiderítsék, mi a katonák szándéka.

Julien Serrat elrabolja a tengeralattjáró legénységének néhány tagját. Arra akarja ugyanis felhasználni őket, hogy rákényszerítse Chaplint, törjön át a Coloradóval a blokádon, és vigye el neki a kint várakozó hajóján lévő csempészrakományt.

A legénység több mint háromnegyede szeretne visszatérni Amerikába, és ennek egyre többször hangot is adnak. Chaplin úgy dönt, hogy megadja nekik a lehetőséget. Shepard pedig közben rájön, hogy King küldetésének köze lehet a Coloradót ért támadáshoz.

Az Egyesült Államok kormánya egy küldöttséget vezényel a szigetre, hogy próbálják meg rendezni a Colorado legénységének helyzetét. Chaplin nem akar kompromisszumot kötni, mert úgy érzi, hogy az emberei nem érdemelnek börtönt. Emiatt pedig összekülönbözik Kendal-lal.

A szigetet vegyifegyver-támadás éri, amitől az ott élők és a katonák is hallucinálni kezdenek. Chaplin úgy dönt, hogy minimális legénységgel a tengeralattjáróra vonul vissza, míg a szigetet az első tisztre hagyja.

Chaplin és Kendal az egész személyzet felszerelését átkutatja az eltűnt inditókulcs miatt, amely ismét nyugtalanságot kelt a legénységben. Mivel Shepard-et nem avatják be, a lány azt hiszi, hogy nem bíznak meg benne.

Az egyik szigetlakó asszony azt állítja, hogy egy tengerészgyalogos megerőszakolta. Chaplin úgy dönt, hogy bíróságot alakít a helyiekkel közösen, és ott ad lehetőséget az emberének, hogy tisztázza magát Shepard segítségével.

Egy pakisztáni katonai különítmény elrabolja a katonák összes hozzátartozóját, akik egy hajón érkeznének Chaplin táborába. Arra akarják ugyanis a kapitányt kényszeríteni, hogy lőjjön ki egy atomtöltetet Indiára.

Egy kínai küldöttség érkezik a San Marinara, amelynek a vezetője arra akarja rávenni Chandler-t, hogy engedje a szigetet az ő felségterületükké nyilvánítani. Eközben Sam elindul, hogy kiszabadítsa Christine-t.

Cortez új parancsot kap a megbízóitól, amely szerint azonnal meg kell ölnie Chandler-t. Hopper úgy dönt, hogy segít Kylie-nak, és elmondja egy bizottság előtt, hogy milyen küldetésen vettek részt a csapatával, mielőtt a tengeralattjáróra kerültek volna.

Tani visszatér a lakásába, hogy összecsomagolja a holmiját, mielőtt elhagyja a szigetet. King ekkor úgy dönt, hogy a lánnyal tart. Cortez kapcsolatot teremt Chandler és Shepard admirális között, így új hírek érkeznek a szigetre.

Három kínai romboló hajó közeledik a sziget felé. Chang elfoglalja az irányítóközpontot Serrat segítségével, miközben Chandler ellen fellázad a Colorado néhány tisztje. Ráadásul Kylie is veszélyben van.